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概述和原核生物转录相比，真核生物转录需要3种RNA聚合酶,需要基本和特异转录因子协同作用识别。基本转录调控因子-RNA聚合酶[基本转录机器]控制着基因的低水平表达，而特异（+/-）转录调控因子结合在特异（+/-）调控元件改变DNA构象（染色质重塑或核小体解聚）暴露出启动子区域并直接或间接通过中介蛋白复合体调控基本转录机器起始频率。原核和真核细胞基因表达的区别酶位置产物对α-鹅膏菌素的敏感性RNApolⅠRNApolⅡRNApolⅢ真核细胞的三种RNA聚合酶核仁pre-rRNA[28S18S5.8S]不敏感核质pre-mRNAsmallRNAsnRNA[U1,U2,U4,U5]敏感核质tRNA5SRNAU6snRNASmallRNA高浓度敏感真核生物蛋白编码基因结构模式.5´cap5´非编码区编码区3´非编码区3´poly(A)tail真核生物mRNA结构基本转录机器的组装1993inNatureSeepage308TFⅡD（TBP+TAFⅡ）识别和结合TATA框TFⅡF与PolⅡ结合，参与解链TFⅡH磷酸化RNA聚合酶大亚基CTD,转录起始所必需基本转录因子在转录复合物组装中的功能真核生物转录因子的结构转录调控域（激活或抑制）DNA结合域（和启动子调节元件结合）二聚体结构域（同源或异源单体结合）细胞核定位信号（通过核孔进入细胞核的氨基酸短序列）.DNA结合域1.HTH结构2.碱性结构域3.锌指结构1）酸性结构域2）富含Gln结构域3）富含Pro结构域转录激活域Yeasttwo-hybridassayReportergeneADRNA聚合酶特异转录因子通过中介蛋白复合体间接地与基本转录机器互作改变转录起始频率。转录因子调控染色质构象转录前调控水平核基质附着区（MARs）特异转录因子招募组蛋白乙酰化酶或染色质重塑因子改变染色质的紧密程度从而影响转录因子与启动子结合。胞嘧啶与组蛋白的修饰胞嘧啶甲基化H3K27甲基化H3K4甲基化组蛋白H3化学修饰