凝胶成像软件使用说明书

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资源描述

目录一样品拍摄指南1拍摄界面简介42琼脂糖电泳凝胶拍摄方法93蛋白质电泳凝胶拍摄方法134蓝光样品的拍摄方法165化学发光样品的拍摄方法196RGB荧光样品的拍摄方法24二软件分析指南1系统进入282功能介绍293图像分析293.11D凝胶分析3.1.1打开图像333.1.2旋转333.1.3图像调整343.1.4图像增强353.1.5分析设置363.1.6泳道识别363.1.7初始井373.1.8条带识别373.1.9背景校准383.1.10标准分子量选择393.1.11倾斜403.1.12结果413.1.13遗传树分析423.1.14VNTRs分析433.1.15视图选择443.1.16报告453.1.17保存实验463.2ECLWesternBlot分析3.2.1打开图像473.2.2图像旋转473.2.3图像调整473.2.4图像增强473.2.5噪点去除473.2.6合并MAKER泳道473.2.7分析设置483.2.8泳道识别48Lane1D凝胶图像软件23.2.9条带识别483.2.10背景校准483.2.11标准分子量选择483.2.12倾斜493.2.13结果493.2.14视图选择493.2.15报告的生成493.3图像合并493.4染料数据库和伪彩503.5PCR密度分析3.5.1打开图像523.5.2图像旋转523.5.3图像调整523.5.4图像增强523.5.5分析设置523.5.6强度校准533.5.7保存实验543.6菌落/克隆计数分析3.6.1打开图像553.6.2图像旋转553.6.3图像调整553.6.4图像增强553.6.5分析设置553.7斑点杂交分析3.7.1打开图像583.7.2图像旋转583.7.3图像调整583.7.4图像增强583.7.5分析设置583.7.6强度校准593.7.7保存实验593.8距离测量分析3.8.1打开图像603.8.2分析设置613.8.3标准线更改62Lane1D凝胶图像软件3三附录3.1仪器的保养要求633.2售后服务63Lane1D凝胶图像软件4样品拍摄指南1拍摄界面简介:主页面①②③④⑤⑥⑦⑧⑨⑩①模式选择部分根据不同样品的需要,软件包含两种不同的拍摄模式:普通模式和ECL模式。普通模式:用于DNA/RNA、蛋白质凝胶电泳、微孔板、杂交膜、瓶皿、菌落、切片、荧光二抗WesternBlot等样品的拍摄。(在本模式下,开启不同的灯光,滤光轮会自动转到对应的滤光镜位)ECL模式:用于ECL等化学发光底物样品的拍摄。本模式下,分辨率自动进行像素合并从而提高灵敏度。(在本模式下,滤光轮会自动转至空位,并且在选择自动曝光、规则积分和不规则积分拍摄功能时均会自动关闭所有灯光并将镜头光圈值放到最大,从而减少操作步骤)②镜头控制部分镜头的控制功能包括:光圈、焦距、聚焦的调整。③图像区域可显示图像预览和拍摄的效果。Lane1D凝胶图像软件5④灯光控制部分灯光控制包括:反射白光、紫外光、红绿蓝三色光源;透射紫外、白光等。(在普通模式下,滤光轮联动。当选择紫外、红绿蓝反射光时,滤光轮将自动转到对应的滤镜位置。)⑤滤光轮调整部分滤光轮孔位的调整控制,通过自动旋转来切换不同的滤光镜复位按钮用来修正基准位(5位滤光轮校准位:5号位;7位滤光轮校准位:7号位)。⑥分辨率选择与相机启动部分分辨率选择功能仅部分型号支持。⑦参数选择与自动曝光部分参数选择:可设置和保存相机各种参数,便于今后调用。自动曝光:程序将自动计算出当前状态下的最佳曝光值。⑧曝光时间设置部分100毫秒:将相机转为预览状态的快捷键。自由设置:可自己设置任意的曝光时间。⑨拍摄方法选择部分单祯拍摄:适用于普通模式和ECL模式自动曝光后的图像捕获。规则积分:指ECL模式下等分时间间隔的积分图像拍摄。不规则积分:指ECL模式下不等分时间间隔的积分图像拍摄。可任意设置每祯图像的间隔时间。⑩图片拍摄按钮及分析快捷键拍摄:进行图像的捕获。图像管理:每次拍摄完后,图像将自动保存至Lane1D文件夹下的“拍照”子文件夹中。分析:可直接将拍摄后图像导入分析界面,进行分析。Lane1D凝胶图像软件6子页面参数设置子页面:①②③④⑤①相机类型和控制类型设置设置相机的类型与控制的类型(相机类型请参照仪器型号进行选择)②RGB和滤光轮RGB三原色激发光源和滤光轮仅部分机型配置,请根据仪器配置清单进行选择③存放路径设置设置拍摄图片存放路径,点击功能按钮进行设置④参数设置调整调整相机的增益,对比度及伽玛值⑤参数保存名称可对当前设置进行保存,方便下次实验直接调用Lane1D凝胶图像软件7自动曝光设置出厂时均设置有默认值明场:指白光或自然光环境UV场:紫外光和荧光环境暗场:ECL等无激发光源的密闭环境自动曝光积分单位:用于暗场模式自动曝光的时间单位。镜头设置电动镜头的光圈、焦距和聚焦三个值的数值化显示设置。框内时间是三可变对应的全程可调整范围的时间,精确到毫秒,自动对应到1-100的调整范围。规则积分用于等分时间间隔的积分拍摄,可设定拍摄张数和间隔的时间。Lane1D凝胶图像软件8不规则积分用于不规则时间间隔的积分拍摄,可任意设定每张图片的间隔时间,利于对未知特性发光底物样品的拍摄条件的摸索。拍摄数量最多10张。滤光轮设置可进行滤光轮每个孔位的信息输入。Lane1D凝胶图像软件92琼脂糖电泳凝胶拍摄方法:提示:本指南所例举为:EB或GoldView染色的DNA凝胶。其它染料的样品请根据激发和吸收波长选择光源和滤光镜。2.1打开拍摄界面,软件将自动开启白光反射灯。单击功能按钮相机启动,在图像预览区域显示图片效果。将样品放置紫外台中央,关闭暗箱门。2.2单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。白光反射灯Lane1D凝胶图像软件102.3调整焦距,直至样品达到屏幕的满幅面。2.4调整聚焦,直至加样孔清晰。焦距调整聚焦调整Lane1D凝胶图像软件112.5关闭白光反射灯,开启紫外透射光源。注意:如果您购买的为多波长紫外台,请选择302nm波长.(波长切换开关)2.6单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。紫外透射灯Lane1D凝胶图像软件12注意:通常情况下,只要在白光下将加样孔调整清楚,切换到紫外时条带就能清晰的看到。但是,如果胶非常厚,加样孔和条带将不在同一景深,所以白光时加样孔虽然能聚清晰,但是紫外时条带仍会有些模糊,这时,可以再微调一下“聚焦”,让条带变清晰。点击“拍摄”按钮:2.7单击功能按钮,进入图像管理界面(该界面里能直接对图片进行打印、保存、删除或分析)。如需进行下一次拍摄,单击功能按钮返回至拍摄界面Lane1D凝胶图像软件133蛋白质电泳凝胶拍摄方法:3.1ChampGel,ChampChemi:将折叠白光透射板从机箱内折下.SmartGel,SmartChemi:将白光透射板放入机箱内,并与12V电源连接.3.2打开拍摄界面,软件将自动开启白光反射灯。单击功能按钮相机启动,在图像预览区域显示图片效果。将样品放置白光透射板中央,关闭暗箱门。关闭白光反射灯,打开白光透射灯3.3单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。白光透射灯Lane1D凝胶图像软件143.4调整焦距,直至样品达到屏幕的满幅面。3.5调整聚焦,直至条带清晰。单击“拍摄”按钮:焦距调整聚焦调整Lane1D凝胶图像软件153.6单击功能按钮,进入图像管理界面(该界面里能直接对图片进行打印、保存、删除或分析)如需进行下一次实验,单击功能按钮返回至拍摄界面注意:同样的操作方法可拍摄其它类型的样品,如下图所示:菌落斑点杂交膜X光胶片抑菌圈Lane1D凝胶图像软件164蓝光样品的拍摄方法:提示:请按照样品中染料的吸收波长选择合适的滤光镜。4.1将蓝光透射台放入机箱内,并与12V电源连接。打开拍摄界面,自动开启白光反射灯。单击功能按钮相机启动,在图像预览区域显示图片效果。将样品放置蓝光透射台中央,关闭白光反射灯,开启透射白光(蓝光透射台与白光透射共用一个开关按钮),关闭暗箱门。4.2单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。蓝光透射灯Lane1D凝胶图像软件174.3调整焦距,直至样品达到屏幕的满幅面。4.4调整聚焦,直至条带清晰。单击“拍摄”按钮:焦距调整聚焦调整Lane1D凝胶图像软件184.5单击功能按钮,进入图像管理界面(在该界面里能直接对图片进行打印、保存、删除或分析),如需进行下一次拍摄,单击功能按钮返回至拍摄界面提示:蓝光样品主要用蓝光台或反射蓝光作为激发光源。蓝光台跟白光板共用一根电源线,均为12V。Lane1D凝胶图像软件195化学发光样品的拍摄方法:5.1打开拍摄界面,自动开启白光反射灯。选择ECL模式,滤光轮自动转到5号空位,负片功能自动启动。单击功能按钮相机启动,在图像预览区域显示图片效果。将未加入发光液的样品放置化学发光样品板中央,关闭暗箱门。5.2单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。白光反射灯Lane1D凝胶图像软件205.3调整焦距,直至样品达到屏幕的满幅面。5.4根据样品上的MAKER或标记的数字调整聚焦,直至样品清晰。焦距调整聚焦调整Lane1D凝胶图像软件215.5选择拍摄方法,灵活的更改拍摄时间和张数。(一般浓度高的样品使用单帧拍摄方法,即自动曝光后的图像捕获;浓度低的样品使用规则积分拍摄或不规则积分拍摄方法,即长时间积分曝光拍摄)5.6将发光液加在样品上,关闭暗箱门,点击功能按钮Lane1D凝胶图像软件225.7软件自动拍摄,直至完成所设置的拍摄张数。Lane1D凝胶图像软件235.8单击功能按钮,进入图象管理界面(该界面里能直接对图片进行打印、保存、删除或分析),如需进行下一次拍摄,单击功能按钮返回至拍摄界面。积分拍摄模式下保存的图像格式为多页式TIFF文件,一个文件中可保存多张图像,您可以使用对多页式TIFF文件进行查看。Lane1D凝胶图像软件246RGB反射光源激发样品拍摄方法6.1打开拍摄界面,自动开启白光反射灯。单击功能按钮相机启动,在图像预览区域显示图片效果。将样品放置紫外透射台中央,关闭暗箱门。6.2单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。白光反射灯Lane1D凝胶图像软件256.3调整焦距,直至样品达到屏幕的满幅面。6.4调整聚焦,直至样品清晰。焦距调整焦距调整Lane1D凝胶图像软件26关闭白光反射灯,打开相对应的RGB荧光灯,这时滤光轮自动转到相对应的滤镜孔位。(图例中样品的激发光源是蓝色荧光光源)6.6单击功能按钮,软件自动计算曝光值,使预览图片达到最佳效果。单击“拍摄”按钮:蓝色荧光光源Lane1D凝胶图像软件276.6单击功能按钮,进入图像管理界面(该界面里能直接对图片进行打印、保存、删除或分析),如需进行下一次拍摄,单击功能按钮返回至拍摄界面Lane1D凝胶图像软件28软件分析指南1系统进入双击桌面图标出现新的对话框在对话框内输入用户名和密码,进入系统。管理员初始密码:123456。请尽快设置和更改此密码。管理员为最高级用户,拥有最高权限,可以修改其他用户的密码,请注意保管好密码。Lane1D凝胶图像软件292功能介绍打开图像后,所有应用程序窗口便处于激活状态。应用程序窗口包括菜单栏、工具栏、图像窗口、工作区以及状态栏。下图显示了LANE1D应用程序窗口的上述及其它特征。菜单栏:菜单栏包含了所有LANE1D命令,这些命令可从菜单栏上的菜单列表来选择。同大多数应用程序一样,在选择命令之前,您必须确定命令的应用对象(例如,在选择命令之前,应确定已选择了此命令将要应用的图像数据)。工具栏:工具栏是位于屏幕顶端的按钮条。应用程序窗口的此位置包含了LANE1D最常用到的基本强度控制和成像工具当光标移到按钮上时,将出现浅黄色简短的描述该按钮功能的提示信息。如果未出现提示信息,则表面该按钮/功能不可应用于当前图像。本指南对工具栏上的26个按钮进行了解述。这些按钮的说明及其用途见下:在默认状态下,下面的工具栏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