名词解释—分子生物学

分子生物学名词解释：基因(gene):编码蛋白质或RNA等具有特定功能产物的遗传信息的基本单位，是染色体或基因组的一段DNA序列(对以RNA作为遗传信息载体的RNA病毒而言则是RNA序列)。包括编码序列(外显子)、编码区前后对于基因表达具有调控功能的序列和单个编码序列间的间隔序列(内含子)。Tm值:Tm值就是DNA熔解温度，指把DNA的双螺旋结构降解一半时的温度。不同序列的DNA，Tm值不同。DNA中G－C含量越高，Tm值越高，成正比关系。中度重复序列(moderatelyrepetitivesequence)：基因组中有10个到几千个拷贝的DNA序列。重复单元的平均长度约300bp。高度重复序列（highlyrepetitivesequence）：基因组中有数千个到几百万个拷贝的DNA序列。这些重复序列的长度为6~200碱基对。启动子（promoter）：DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域，在许多情况下，还包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点。增强子(enhancerelement)：增强基因启动子工作效率的顺式作用序列，能够在相对于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)上都发挥作用。分子杂交(molecularhybridization)：不同来源或不同种类生物分子间相互特异识别而发生的结合。如核酸(DNA、RNA)之间、蛋白质分子之间、核酸与蛋白质分子之间、以及自组装单分子膜之间的特异性结合。限制性内切酶（restrictionendonuclease）：识别并切割特异的双链DNA序列的一种内切核酸酶。反式作用因子(trans-actingfactor)：通过直接结合或间接作用于DNA、RNA等核酸分子，对基因表达发挥不同调节作用(激活或抑制)的各类蛋白质因子。半保留复制(semiconservativereplication)：DNA复制时亲代DNA的两条链解开，每条链作为新链的模板，从而形成两个子代DNA分子，每一个子代DNA分子包含一条亲代链和一条新合成的链。PCR（PolymeraseChainReaction）：聚合酶链式反应，聚合酶链式反应(PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火（复性）及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。Anticodon（反密码子）：转移核糖核酸中能与信使核糖核酸的密码子互补配对的三核苷酸残基。位于转移核糖核酸的反密码子环的中部。centraldogma（中心法则）：是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。single-strandbindingprotein（SSB单链结合蛋白）：结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区，防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质。Transcription（转录）：是以DNA中的一条单链为模板，游离碱基为原料，在DNA依赖的RNA聚合酶催化下合成RNA链的过程。Exon（外显子）：是真核生物基因的一部分，它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。satelliteDNA（卫星DNA）：真核细胞染色体具有的高度重复核苷酸序列的DNA。总量可占全部DNA的10%以上，主要存在于染色体的着丝粒区域，通常不被转录。因其碱基组成中GC含量少，具有不同的浮力密度，在氯化铯密度梯度离心后呈现与大多数DNA有差别的“卫星”带而得名。cvalue：在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量是特异的，被称为C值C值悖论（c-valueparadox）：高等生物具有比低等生物更复杂的生命活动，所以，理论上应该是它们的C值也应该更高。但是事实上C值没有体现出与物种进化程度相关的趋势。高等生物的C值不一定就意味着它的C值高于比它低等的生物。这种生物学上的DNA总量的比较和矛盾，称为C值悖论。Chromatin（染色质）：真核细胞分裂间期的细胞核内由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA组成的线性复合结构。overlappinggen：Denaturation（蛋白质变性）：蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时，次级键受到破坏，导致天然构象的破坏，使蛋白质的生物活性丧失。autonomouslyreplicatingsequences（ARS自主复制序列）：在真核生物中发现的一类能启动DNA复制的序列，含有一个AT富集区。最早在酵母中分离得到，随后在其它真核生物中也发现了ARS序列的存在。corepromoterelements（核心启动子元件）：真核生物基因启动子中介导基因转录起始的最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列，大小约为40个核苷酸。含有TATA框，起始子(Inr)，TFⅡB识别元件(BRE)和核心启动子下游元件(DPE)等序列模块。Degeneracy（简并）：两种或多种核苷酸三联体决定同一种氨基酸。adaptiveexpression：Intein：指蛋白质的内含子。同mRNA一样，一些前体蛋白质具有内含子(intein)序列，位于多肽序列的中间,经加工切除后，两端的蛋白质外显子(extein)连接为成熟蛋白质分子。Euchromatin（常染色质）:间期核内染色质丝折叠压缩程度低，处于伸展状态，着色浅的那部分染色质。富含单拷贝DNA序列，有转录活性。异染色质（heterochromatin）：间期核内染色质丝折叠压缩程度高，处于凝聚状态，染料着色深的那部分染色质。富含重复DNA序列、复制延迟，一般无转录活性。jumpinggene（跳跃基因或转座子transposon）：一段可以从原位上单独复制或断裂下来，环化后插入另一位点，并对其后的基因起调控作用DNA顺序.Cot1/2：Priming:tRNAidentity:Translation（翻译）：在多种因子辅助下，核糖体结合信使核糖核酸(mRNA)模板，通过转移核糖核酸(tRNA)识别该mRNA的三联体密码子和转移相应氨基酸，进而按照模板mRNA信息依次连续合成蛋白质肽链的过程。constitutiveheterochromatin（结构异染色质）：在细胞的所有时期都保持凝聚状态的染色质。主要由高度重复序列DNA构成。splittinggene（断裂基因）:真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质，这些基因称为断裂基因（splitegene）。intragenenicpromoter（基因内启动子）：位于转录起始位点下游的启动子。见于由RNA聚合酶Ⅰ负责转录的5S核糖体核糖核酸(rRNA)、转移核糖核酸(tRNA)等基因中。其中tRNA基因的内部启动子区由两个10bp元件的A框和B框组成。isoacceptingtRNA（同功受体tRNA）摇摆假说的相对性说明了摇摆范围的局限，在通用三联体密码中一个密码子家族必须由两种tRNA识读。能解读同义密码子的不同tRNA被定义为同工受体tRNA。Repression(阻遏):阻遏物或阻遏物-辅阻遏物复合物与基因的调控序列结合而将其封闭，从而阻止基因的表达。Codon（密码子）：由3个相邻的核苷酸组成的信使核糖核酸(mRNA)基本编码单位。有64种密码子，其中有61种氨基酸密码子(包括起始密码子)及3个终止密码子，由它们决定多肽链的氨基酸种类和排列顺序的特异性以及翻译的起始和终止。positiveregulation（正调节）：调控因子(如转录、翻译的调控因子)等通过直接结合或间接作用。引起激活或增强基因表达的调控作用。可提高目的基因的转录效率以及基因产物的数量或活性。负调节（negativeregulation）：转录、翻译或信号转导的调控过程被一些因子(如阻遏蛋白)所阻遏的调节方式。可使基因表达水平下降以及基因产物(RNA或蛋白质)的数量减少。leadingstrand（前导链）:与复制叉移动的方向一致，通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。后随链（laggingstrand）：与复制叉移动的方向相反，通过不连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。reversetranscription（逆转录）：以RNA为模板，依靠逆转录酶的作用，以四种脱氧核苷三磷酸(dNTP)为底物，产生DNA链。常见于逆转录病毒的复制中。facultativeheterochromatin（兼性异染色质）：生物体一定时期处于凝缩失活状态的染色质，而在其他时期松展为常染色质。openreadingframe（开放阅读框）:是结构基因的正常核苷酸序列，从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链，其间不存在使翻译中断的终止密码子。hyperchromiceffect（增色效应）：核酸(DNA和RNA)分子解链变性或断链，其紫外吸收值(一般在260nm处测量)增加的现象。Estein:activatingprotein:（激活蛋白）：抑制素的两个β亚基组成的二聚体。是转化生长因子家族的成员，β亚基有A，B两种同工型，可形成AA、AB、BB三种组合。除能刺激促卵泡激素的分泌外，还有多种细胞生物效应。Polysome（多核糖体）：多个核糖体在一个信使核糖核酸(mRNA)分子上串成的颗粒体。信使核糖核酸在核糖体中有一段裸露的序列。每个核糖体可以独立完成一条肽链的合成。Topoisomerase（拓扑异构酶）：是指通过切断DNA的一条或两条链中的磷酸二酯键，然后重新缠绕和封口来更正DNA连环数的酶。拓扑异构酶Ⅰ、通过切断DNA中的一条链减少负超螺旋，增加一个连环数。某些拓扑异构酶Ⅱ也称为DNA促旋酶。replicationfork（复制叉）：正在进行复制的双链DNA分子所形成的Y形区域，其中，已解旋的两条模板单链以及正在进行合成的新链构成了Y形的头部，尚未解旋的DNA模板双链构成了Y形的尾部。