氨基的保护及脱保护策略-060226

药明康德内部保密资料经典化学合成反应标准操作氨基的保护及脱保护策略编者：彭宪药明康德新药开发有限公司化学合成部经典合成反应标准操作—氨基的保护及脱保护药明康德新药开发有限公司药明康德内部保密资料Page1of77目录1．氨基的保护及脱保护概要……………………………………………22．烷氧羰基类2-1.苄氧羰基（Cbz）………………………………………………42-2.叔丁氧羰基（Boc）………………………………………………162-3.笏甲氧羰基（Fmoc）…………………………………………282-4.烯丙氧羰基（Alloc）…………………………………………342-5.三甲基硅乙氧羰基（Teoc）……………………………………362-6.甲（或乙）氧羰基……………………………………………403．酰基类3-1.邻苯二甲酰基（Pht）……………………………………………433-2.对甲苯磺酰基（Tos）…………………………………………493-3.三氟乙酰基（Tfa）…………………………………………534．烷基类4-1.三苯甲基（Trt）………………………………………………574-2.2,4-二甲氧基苄基（Dmb）……………………………………634-3.对甲氧基苄基（PMB）………………………………………654-4.苄基（Bn）……………………………………………………70经典合成反应标准操作—氨基的保护及脱保护药明康德新药开发有限公司药明康德内部保密资料Page2of771．氨基的保护及脱保护概要选择一个氨基保护基时，必须仔细考虑到所有的反应物，反应条件及所设计的反应过程中会涉及的所有官能团。首先，要对所有的反应官能团作出评估，确定哪些在所设定的反应条件下是不稳定并需要加以保护的，并在充分考虑保护基的性质的基础上，选择能和反应条件相匹配的氨基保护基。其次，当几个保护基需要同时被除去时，用相同的保护基来保护不同的官能团是非常有效（如苄基可保护羟基为醚，保护羧酸为酯，保护氨基为氨基甲酸酯）。要选择性去除保护基时，就只能采用不同种类的保护基（如一个Cbz保护的氨基可氢解除去，但对另一个Boc保护的氨基则是稳定的）。此外，还要从电子和立体的因素去考虑对保护的生成和去除速率的影响（如羧酸叔醇酯远比伯醇酯难以生成或除去）。最后，如果难以找到合适的保护基，要么适当调整反应路线使官能团不再需要保护或使原来在反应中会起反应的保护基成为稳定的；要么重新设计路线，看是否有可能应用前体官能团（如硝基，亚胺等）；或者设计出新的不需要保护基的合成路线。在合成反应中，伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚和其他芳香氮杂环中的氨基往往是需要进行保护的。已经使用过的氨基保护基很多，但归纳起来，可以分为烷氧羰基、酰基和烷基三大类。烷氧羰基使用最多，因为N-烷氧羰基保护的氨基酸在接肽时不易发生消旋化。伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚和其他芳香氮氢都可以选择合适的保护基进行保护。下表列举了几种代表性的常用的氨基保护基。经典合成反应标准操作—氨基的保护及脱保护药明康德新药开发有限公司药明康德内部保密资料Page3of77几种代表性的常用的氨基保护基结构缩写应用引入条件脱去条件OXOCbz伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Cbz-Cl/Na2CO3/CHCl3/H2OH2/Pd-C，供氢体/Pd-C，BBr3/CH2Cl2orTFA，HBr/HOAc等OXOBoc伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Boc2O/NaOH/diox/H2O,Boc2O//MeOH,Boc2O/Me4NOH/CH3CN3MHCl/EtOAc,HCl/MeOHordiox,TosOH/THF-CH2Cl2,Me3SiI/CHCl3orCH3CNOXOFmoc伯胺、仲氨等Fmoc-Cl/NaHCO3,/diox/H2O20%哌啶/DMF，50%哌啶/CH2Cl2等OXOAlloc伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Aloc-Cl/PyNi(CO)4/DMF/H2O;Pd(PPh3)4/Bu3SnH;ClOOTMSTeoc伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Teoc-Cl/碱/diox/H2OTBAF；TEAFMe(orEt)OXO-伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等ROCOCl/NaHCO3,/diox/H2OHBr/HOAc;Me3SiI;KOH/H2O/乙二醇NOOXPht伯胺邻苯二甲酸酐/CHCl3/70℃;邻苯二甲酰亚胺-NCO2Et/aq.Na2CO3H2NNH2/EtOH，NaBH4/i-PrOH-H2O（6：1）SOOXTos伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Tos-Cl/Et3NHBr/HOAc,48%HBr/苯酚（cat）XOCF3Tfa伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等TFAA/Py;苯二甲酰亚胺-NCO2CF3/CH2Cl2K2CO3/MeOH/H2O;NH3/MeOH;HCl/MeOHXTrt伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Trt-Cl/Et3NHCl/MeOH,H2/Pd/EtOH,TFA/CH2Cl2XMeOOMeDmb伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等ArCHO/NaCNBH3/MeOHXOMePMB伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等PMB-Br/K2CO3/CH3CN;PhCHO/NaCNBH3/MeOHHCO2H/Pd-C/MeOH;H2/Pd(OH)2/EtOH;TFA;CAN/CH3CNXBn伯胺、仲氨、咪唑、吡咯、吲哚等Bn-Br/Et3NorK2CO3/CH3CN;PhCHO/NaCNBH3/MeOHHCO2H/Pd-C/MeOH;H2/Pd(OH)2/EtOH;CCl3CH2OCOCl/CH3CN经典合成反应标准操作—氨基的保护及脱保护药明康德新药开发有限公司药明康德内部保密资料Page4of772．烷氧羰基类保护基烷氧羰基类保护基可用于氨基酸，以在肽合成中减少外消旋化的程度。外消旋化发生在碱催化的N-保护的羧基活化的氨基酸的偶联反应中，也发生在易由N-酰基保护的氨基酸形成的中间体恶唑酮中。要使外消旋化程度减到最小，需使用非极性溶剂、最弱的碱、低的反应温度，并使用烷氧羰基类保护的氨基酸是有效的。其中常用的有易通过酸性水解去保护的Boc基、由催化氢解去保护的Cbz基、用碱经β-消除去保护的Fmoc基和易由钯催化异构化去保护的Alloc基。2.1苄氧羰基（Cbz）苄氧羰基（Cbz）是1932年Bergmann发现的一个很老的氨基保护基，但一直到今天还在应用。其优点在于：试剂的制备和保护基的导入都比较容易；N-苄氧羰基氨基酸和肽易于结晶而且比较稳定；苄氧羰基氨基酸在活化时不易消旋；能用多种温和的方法选择性地脱去。2.1.1苄氧羰基的导入苄氧羰基的导入，一般都是用Cbz-Cl。游离氨基在用NaOH或NaHCO3控制的碱性条件下可以很容易同Cbz-Cl反应得到N-苄氧羰基氨基化合物。α,β-二胺可用该试剂在pH=3.5-4.5稍有选择性地被保护，其选择性随碳链地增长而减弱，如H2N(CH2)nNH2,n=2时71%被单保护;n=7时29%被单保护[1]。氨基酸酯同Cbz-Cl的反应则是在有机溶剂中进行，并用碳酸氢盐或三乙胺来中和反应所产生的HCl。此外，Cbz-ONB（4-O2NC6H4OCOOBn）等苄氧羰基活化酯也可用来作为苄氧羰基的导入试剂，该试剂使伯胺比仲胺易被保护，但苯胺由于亲核性不足，与该试剂不反应[2]。HNR1R2Cbz-ClBaseNR1R2CbzNH2R1R2OOCCbz-ClBaseNHCbzR1R2OOC1．G.J.Atwell,W.A.Denny.,Synthesis,1984,10322．D.R.Kelly,M.Gingell,Chem.Ind.(London),1991,888经典合成反应标准操作—氨基的保护及脱保护药明康德新药开发有限公司药明康德内部保密资料Page5of77Cbz-Cl很容易用苯甲醇同光气的反应来制备（见下式），在低温下可以保存半年以上而不发生显著的分解。CH2OHCOCl2CH2OCOCl+HCl除Cbz-Leu为油状物外，绝大多数氨基酸的苄氧羰基衍生物都可以得到结晶。有的N-苄氧羰基氨基酸能同它的钠盐按一定比例形成共晶，共晶产物的熔点较高，并难溶于有机溶剂。例如，苯丙氨酸经苄氧羰基化后再加酸析出Cbz-Phe时往往得到共晶产物（熔点144℃），此共晶产物用乙酸乙酯和1MHCl一道震摇时可完全转化为Cbz-Phe而溶于乙酸乙酯中。因此。除Cbz-Gly以外，一般都是采用酸化后用有机溶剂提取的方法来得到纯的N-苄氧羰基氨基酸。2.1.1.1游离氨基酸的Cbz保护示例Konda-Yamada,Yaeko;Okada,Chiharuetal.,Tetrahedrom;2002,58(39),7851-7865Cbz-Cl(18.5μl,0.155mmol)indiethylether(0.2ml)wasdroppedtoasolutionof(R)-1(36.4mg,0.129mmol)in10%aqueousNa2CO3(1.8ml)at0°C,andstirredfor5h.Thereactionmixturewasacidifiedwith10%citricacid,extractedwithCHCl3(10mlX3).Theorganiclayerwaswashedwithwater,driedoverNa2SO4,evaporatedtogivelightyellowgels,whichwerepurifiedbypreparativeTLC(CHCl3/MeOH=5:1)toafford(R)-6(25.7mg,47.1%)asyellowamorphoussolid.Rf=0.87(n-BuOH/AcOH/H2O=4:1:5);[a]D23=-27.270(c=0.99,CHCl3);经典合成反应标准操作—氨基的保护及脱保护药明康德新药开发有限公司药明康德内部保密资料Page6of772.1.1.2氨基酸酯的Cbz保护示例SONH2.HClOCbz-ClK2CO3SONHCbzO12M.Carrasco,R.J.Jones,S.Kameleta1.,Org.Syn.,70,29A3-L,three-necked,Mortonflaskequippedwithanefficientmechanicalstirrer,thermometer,andadroppingfunnelischargedwithL-methioninemethylesterhydrochloride1(117.6g,0.56mol),potassiumbicarbonate(282.3g,2.82mol,5eq.),water(750mL),andether(750mL),andthesolutioniscooledto0°C.Benzylchloroformate(105g,88.6mL,0.62mol,1.1eq.)isaddeddropwiseover1hr,thecoolingbathisremoved,andthesolutionisstirredfor5hr.Glycine(8.5g,0.11mol,0.2eq.)isadded(toscavengeexcesschloroformate)andthesolutionisstirredforanadditional18hr.Theorganiclayerisseparated,andtheaqueouslayerisextractedwithether(2×200mL).Thecombinedorganiclayersarewashedwith0.01Mhydrochloricacid(2×500mL),water(2×500mL),andsaturatedbrine(500mL),andthendried(Na2SO4),filtered,andevaporatedonarotaryevaporator.Theresulting