Swiss-Pdb Viewer软件的使用

Swiss-PdbViewer软件的使用蛋白质序列查找CDK2[Homosapiens]序列提交Pdb文件下载蛋白质空间结构的显示用Swiss-pdbviewer打开结构CDK2蛋白质空间结构的显示调出ControlPanel选择以ribbon显示肽链并消除棍棒结构选择以不同的颜色显示螺旋与折叠蛋白质空间结构特征的分析一·不同类型残基的分布二·蛋白质的静电势分析三·残基分布与其的溶剂可及性四·邻近残基的选择及氢键分析一、不同类型残基的分布碱性残基的分布酸性残基的分布极性残基的分布非极性残基的分布二、蛋白质的静电势分析三、残基分布与其的溶剂可及性点“select”，选择“accessibleresidues”=30四、氢键分析tools选项中选择computeH-bonds邻近残基的选择及氢键分析计算氢键五、结构的同源模建Automatedmodle打开序列打开模板结构Fitrawsequence序列提交返回结果六、刚性与柔性color——B-factor七、相似性分析Magicfit→CalculatorRMSThankyou！