LOGO生物医学数据库检索RetrievalofMedicalInformationDatabase主讲人:胡笳昆明医科大学医学信息检索教研室前言医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室医学信息检索系统是发展、利用较早、较快的一个领域,各种医学数据库的不断出现和广泛应用,为促进人类医学科学研究水平的发展,发挥了重要的作用。近年来,随着人类科学技术的不断发展,新技术、新方法不断出现,医学数据库开发和利用也出现了一些新特点。中文数据库医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室共八十九种数据库医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室医学数据库的类型-----What1数据库的信息来源------Who2常用数据库的特点------Why3怎样使用------How4医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室文摘型数据库•Medline•EMBASE.com(荷兰《医学文摘》)•BIOSISPreview(美国《生物学文摘》)•CA(美国《化学文摘》)•Dialog联机检索系统医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室全文型数据库•ElsevierScienceDirect全文期刊数据库•ProQuest全文期刊数据库•Springer全文期刊数据库•OVID全文期刊库•EBSCOhost全文期刊数据库医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室引文检索数据库•美国科学引文索引----SCI医学外文数据库的类型医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室循证医学数据库•WILEYCochrane数据库•OVID数据库----BestEvidence•PubMed----ClinicalQueries•SumSearch循证医学资源网站Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室1.Medline是美国国立医学图书馆(theNationalLibraryofMedicine,NLM)研制开发的国际上最具权威性的综合性生物医学文献书目数据库。收录范围:全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊,目前文摘条目1300余万篇,年报道量40万条,英文刊物占90%、3/4有英文摘要,每周更新。内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。PubMed是其提供Internet免费检索的WEB数据库。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室2.EMBASEEMBASE(theExderptaMedicalDatabase,荷兰医学文摘),是荷兰Elsevier科学出版公司建立的生物医学与药学书目数据库。收录了自1974年以来的70多个国家和地区的3800种期刊,尤其涵盖了大量欧洲和亚洲医学刊物。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室3.BiosisPreviewBIOSISPreview是美国《生物学文摘》(BiologicalAbstract)的在线数据库。是美国生物科学信息服务社(BIOSIS)生产的世界上最大的有关生命科学的文摘和索引数据库。收录世界上100多个国家和地区的5500多种期刊的文献和1650多个会议的会议录和报告,每年大约增加28万条记录。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室4.CA(美国《化学文摘》)《化学文摘》,ChemicalAbstracts,简称CA,是世界最大的化学文摘库。也是目前世界上应用最广泛,最为重要的化学、化工及相关学科的检索工具。创刊于1907年,由美国化学协会化学文摘社(CASofACS,ChemicalAbstractsServiceofAmericanChemicalSociety)编辑出版。Who----信息来源医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室6.全文型数据库数据库名称出版商及期刊数量ElsevierElsevier全文数据库是荷兰著名商业出版公司爱思唯尔科学(ElsevierScience)的核心产品,共收录了2500余种期刊,涵盖24个学科,其中1400多种被《科学引文索引》(SCI)收录。ProQuest是美国ProQuestInformationandLearning旗下的网络医学期刊数据库。该库收录了1997年以来重要的生物医学期刊1200多种。Springer施普林格出版社于1842年在德国柏林创立,是全球第一大科技图书出版公司和第二大科技期刊出版公司,每年出版5,500余种科技图书和约1,700余种科技期刊,其中超过1,500种经同行评阅的期刊。OVID美国OvidTechnologies公司开发的医学数据库系统,收录了超过1200种科学、科技及医学期刊。收录了从1993年至今的文献,其中超过350种属于核心期刊,被SCI收录的期刊超过300种EBSCOhostEBSCOhost是美国EBSCOPublishing公司提供的数据库。学科综合性较强,收录了包括自然科学、社会科学、人文艺术、生物医学等多学科领域的3000多种期刊。Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室书目型数据库(文摘型数据库)•Medline•EMBASE.com(荷兰《医学文摘》)•BIOSISPreview(美国《生物学文摘》)•CA(美国《化学文摘》)Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室书目型数据库(文摘型数据库)•建立时间较早,认知度高•收录期刊数比较多,专业性强•检索系统成熟、规范•标引质量高、检索途径全面•无全文提供Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室书目型数据库(文摘型数据库)如:Medline收录4600多种生物医学专业期刊;提供包括作者、题名、关键词、主题词、代码等30多个经详细标引的可检字段MESH主题词规范标引PubMed部分功能医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室超过三十多个可检字段经规范化的MESH词表检索EMBASE的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室EMBASE收录3800多种医学、药学专业期刊;涵盖了大量的欧洲和亚洲医学期刊;专有药物检索(DrugSearch):支持药物名称检索,并提供药物联接,其中包括17个核心的药物联接和47个药物管理联接。EMTREE词表检索Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室全文型数据库•国外全文数据库大多由期刊出版商或出版集团生产•收录期刊一般为本出版社自主产权的杂志,收录范围少•检索系统简单、易于操作,但功能不够齐全•大多为电脑机器标引,标引质量一般•检索结果为全文Why----数据库的特点医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室PubMed与CBMPubMed中国生物医学文献数据库CBMVS检索举例医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室某医院消化科医生欲申报立项课题“幽门螺杆菌(HP)感染胃癌易感基因多态性检测的研究”。课题研究内容是IL-1β,IL-10,TNF-α多态性检测,用于HP感染胃癌高危人群的筛查。检索词:胃癌(gastriccancer);幽门螺杆菌(Helicobacterpylori);白细胞介素1β(IL-1β);白细胞介素10(IL-10);肿瘤坏死因子α(TNF-α);基因多态性(Polymorphisms)。中国生物医学文献数据库(CBM)医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室•中国生物医学文献数据库(CBM)是我国最早的生物医学文献数据库之一。•收录了1978年以来中国生物医学期刊1800多种,年增长量40余万篇。•学科范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等医学各个领域。•其医学主题词(MeSH)检索是几个中文数据库中独有的,标引依据美国国立医学图书馆的MeSH和中国中医研究院出版的《中医药学主题词表》。中国生物医学文献数据库(CBM)医学信息检索与利用CBM主题词表查词中国生物医学文献数据库(CBM)医学信息检索与利用CBM主题词表参见系统CBM主题检索医学信息检索与利用CBM检索主要主题词扩展树形结构检索扩展副主题词CBM主题检索医学信息检索与利用CBM中英文主题词入口词参见树状结构号表明其类别CBM主题检索医学信息检索与利用CBM主题词在学科分类中的位置族首词树状结构表明该主题词分属四个不同的上位学科CBM检索缺省字段:在中国生物医学文献数据库(CBM)中,是中文标题、摘要、作者、关键词、主题词和刊名内容的组合。CBM检索医学信息检索与利用CBM医学信息检索与利用CBM检索词在题名字段出现检索词在文摘字段出现检索词在刊名字段出现PubMed由美国国立医学图书馆(nationallibraryofmedicine,NLM)下属的国家生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI)开发,用于检索生物医学文献的WEB数据库。1997年6月起提供INTERNET免费服务医学信息检索与利用昆明医学院信息检索教研室医学信息检索与利用PubMedPubMed医学信息检索与利用PubMedMar-20PubMed数据库不同的标注不同的来源通过PubMed可检索的信息Medline收录范围:全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊,目前文摘条目1300余万篇,年报道量40万条,英文刊物占90%、3/4有英文摘要,每周更新。内容涉及:医学、药学、牙医学、护理学、预防医学、卫生管理、兽医学等专业。记录标注:[PubMed-indexedforMEDLINE]PubMed数据库Premedline收集未经标引的最新文献,经MeSH词表标引后,每周向medline移加一次,同时从Premedline中删除。记录标注:[PubMed-inprocess]Mar-20PubMed数据库PublisherSuppliedCitation出版商直接向PubMed递送的电子文献。其中有一部分在Medline中未收录。若出版商提供全文,PubMed则建立与全文的链接,可免费或交一定费用直接联机获取原文。记录标注:[PubMed-assuppliedbypublisher]Mar-20PubMed数据库二、检索规则(一)AutomaticTermMapping词汇自动转换1、MeSHTranslationtableVitaminc转换为“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]想要查验检索词的转换情况,并调整和保存检索策略,可点击“details”按钮PubMed数据库2、JournalsTranslationtableNewEnglandjournalofmedicine转换为“NEnglJMed”[Journal]包括期刊的三种不同表达方式刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN例JournalofleukocytebiologyJleukocbiol0741-5400Mar-20PubMed数据库3、PhraseListColdcompresses在前两个表中均未找到,在短语列表中可找到这个词组。Mar-20PubMed数据库4、AuthorIndex当一个短语在前三个表中都找不到匹配词,PubMed就会到作者索引中查找。例:smithjc姓前(全称)、名后(首字母缩写)Mar-20PubMed数据库如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时,PubMed就将短语劈开,用AND将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找,直到找到相应的词为止。例:pressurepoint转换为((“pressure”[MeSHTerms]ORpressure[TextWord])ANDpo