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第三章外文信息资源检索-PUBMED南京医科大学图书馆第一节美国医学索引与Medline一、美国医学索引（IndexMedicus,IM）（一）美国医学索引概况1.收录范围：世界上著名大型医学文献题录型检索期刊2.文献类型：论文、社论、通信、综述等3.IndexMedicus特色(1)历史悠久(2)收录范围广(3)质量高(4)检索简便(5)回溯检索能力强第一节美国医学索引与Medline一、美国医学索引（IndexMedicus,IM）（二）编排结构1.主题部分2.著者部分3.医学综述题录4.医学主题表(1)字顺表(2)树状结构表(3)副主题词表(4)收编期刊目录第一节美国医学索引与Medline一、美国医学索引（IndexMedicus,IM）（三）检索方法1.主题途径检索2.著者途径检索（四）检索举例第一节美国医学索引与Medline二、Medline数据库（一）Medline数据库概况（二）Medline的收录范围1966年以来的70多个国家和地区，37种语言的近5600种期刊文献（三）Medline数据库的检索方法第二节Pubmed与NCBINIH、NLM、NCBI与EntrezNIH(NationalInstituteofHealth)：美国国立卫生研究院NLM(NatioanlLibraryofMedicine)：美国国立医学图书馆NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国生物技术信息中心)EntrezNCBI与EntrezNCBI创办了生物技术和生命科学的优秀网站——Entrez——基于多种数据库的集成检索系统，也是网上最大的免费检索生物医学资源的网站。通过该平台可检索到NCBI提供的28个数据库，这些数据库包含文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维蛋白质结构数据库、种群研究库、表达库、完全人类基因组库、分类信息库。其中，Pubmed属于文献数据库。文献数据库主要收藏生物医学方面的期刊、图书等。第二节Pubmed与NCBI一、Entrez资源整合系统NCBI，基于Web界面的综合生物信息数据库，网址为(1)GenBank和Nucletide(2)Genoma(3)OMIM(4)Protein(5)Structure(6)Pubmed(7)Taxonomy第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（一）Pubmed收藏范围：(1)Medline:标注为[Pubmed-indexedforMedline](2)OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline](3)InProgressCitations:标注为[Pubmed-inProcess](4)RecordSuppledbyPublisher:标注为[Pubmed-assuppliedbyPublisher]（二）Pubmed数据库结构（P135）字段限定符：[]例如：Stem[ti]ANDneuroscience第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索1.基本检索Pubmed第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则1.逻辑运算符:ANDORNOT如：commoncoldANDvitaminC将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则2.词语自动转换：自然语言转换Mesh转换表、刊名转换表、短语表、著者索引对常用医学名词进行自动在MeSH转换表、刊名转换表、短语表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。如：renalfailure（肾衰竭）转换为renalinsufficiency[MeSHTerms]OR(renal[AllFields]ANDinsufficiency[AllFields])ORrenalinsufficiency[AllFields]OR(renal[AllFields]ANDfailure[AllFields])ORrenalfailure[AllFields]第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则3.截词检索功能：截词符：”*”作为通配符进行截词检索。例如：bacter*（系统会找到前一部分是bacter的单词，如：bacteria、bacterium等）4.短语精确检索用双引号来强制系统进行短语检索。例如：“oxygenfreeradicals”（不再自动转换匹配和扩展检索）第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则其他著者检索姓名,姓在前,名首字母在后限定加字段符如:genbacevo[AU]smithab[AU]第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（四）Pubmed主题词检索主题词概念与优势：统一概念，可扩展检索方法例：欲查肾衰竭（renalfailure）饮食疗法(diettherapy)的相关文献？MeshSearchMeshSearchSubheadings款目词树状词表检索检索结果第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（五）Pubmed高级检索1.检索构建器searchbuilder2.检索历史AdvancedSearch第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（六）期刊数据库检索通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献。提供电子原文的超链键。newenglandjournalofmedicineclinexpimmunol[so]1059-1524Journal第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（七）单篇引文匹配器输入题录信息，查找特定文献进行补缺。刊名要准确，缩写要标准著者姓名大小写不敏感如：已知：第一著者是ChallisDE，出处是PediatricResearch；2000，47（3）：309-15，要求写出其他合著者输入已知条件SingleCitationMatcher第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（八）临床查询1.ClinicalStudyCategories2.SystematicReview3.MedicalGeneticsClinicalQueries第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（九）检索结果的显示、评价、分析与管理1.结果显示：2.检索结果的保存及输出3.检索结果的记录显示4.检索结果的限定和过滤检索结果显示方式保存方式详细显示结果限定第二节Pubmed与NCBI三、其他工具和链接（一）MyNCBI个性化功能1.保存检索策略及E-mail发送功能2.保存检索结果3.过滤检索结果（二）Linkout：全文链接（三）批量引文匹配器（四）临床试验数据库MyNCBILinkOUTNCBIBatchCitationMatcherClinicalTrail第二节Pubmed与NCBI三、其他工具和链接（五）Gopubmed知识挖掘分析工具1.Gopubmed概述2.Gopubmed的分类统计功能(1)主题分布(2)作者分布(3)文献来源分布(4)年度分布3.Gopubmed与SCI信息分析功能比较Gopubmed是一种Pubmed检索工具，是对于Pubmed资源的另一种组合检索方式，它比Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研究过程、研究动态和各种信息之间的相关性摘自上海交通大学-生命医药学科博客：=269GoPummed第二节Pubmed与NCBI四、PubMedCentral：免费全文数据库五、Entrez跨库检索PubmedCentral://由丁香园创建，基于Pubmed数据。高级搜索图库搜索TheendSeeyounexttime!