2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室1医学文献数据库MEDLINEIE6.0以下版本,应用火狐浏览器(下载网址及软件)2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室22020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室3一、数据库概况(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)。(二)收录学科内容:主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室4(三)文献来源:收录70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊,大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。近年数据涉及37种语种,回溯至1949年的数据涉及60种语种。数据库47%为美国本土出版文献,90%为英文文献,79%的文献有著者撰写的英文文摘,(以上数据根据2009年7月数据库提供)。一、数据库概况2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室5二、MEDLINE的检索平台广域网免费平台:NCBI-PubMed(含非MEDLINE数据)2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室6校园网内可用平台(IP控制):OvidSP(含非MEDLINE数据)WebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch二、MEDLINE的检索平台2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室7校园网内可用平台的Medline2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室8PubMed数据库检索复旦大学图书馆文献检索教研室9(一)开发机构:NCBI(美国国立生物技术信息中心)NCBI的任务:建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。一、PubMed简介2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室10NCBI网站2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室11NCBI提供的数据库检索大分子生物学数据获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列;获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列,从核酸序列翻译到蛋白质的序列;获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据库检索。PubMed等文献数据。2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室12广域网免费提供题录和文摘提供与原文的网址链接(部分免费获取)提供检索词智能转换匹配界面简洁,操作简便(二)PubMed的特点2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室13MDENLINEIndexed1966toprensent的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和摘要,每条记录标有:[PubMed-indexedforMEDNLINE]OldMDENLINE1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH字段和摘要,每条记录标有:[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966](三)PubMed收录数据2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室14MDENLINEInprocess最新的MDENLINE处理中数据,未标引,无MeSH字段。每条记录标有:[PubMed-inprocess]。Publisher-Supplied出版商提供的电子文献题录,每条记录标有:[PubMed-assuppliedbypublisher],分为两类:MEDLINE收录,逐步转为InProcess,Indexed状态。NotMEDLINE:PubMed收录,MDELINE不收录,一直标注[PubMed-assuppliedbypublisher]或[PubMed](三)PubMed收录数据2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室15二、PubMed的检索功能基本检索输入框检索限制高级检索检索指南检索工具:特定文献检索临床查询专题查询其他资源:规范词数据库期刊数据库临床试验等个人空间2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室16检索栏可输入一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索)如:Omeprazolepharmacology三、PubMed基本检索规则多个检索词输入2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室17检索栏可输入布尔逻辑运算式:如:OmeprazoleAND(analogsORderivatives)字段限定符:[],空格按词组匹配如:Stemcelltransplantation[ti](空格=词组运算)如:Omeprazole[ti]pharmacology[ti](空格=“and”运算)三、PubMed基本检索规则2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室18字段限定stemcelltransplantation[ti]2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室192020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室19stemcell[ti]ANDtransplantation[ti]比空格多检出400篇2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室20逻辑运算式输入:芦荟治疗牛皮癣,牛皮癣出现在篇名中2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室21著者检索:姓全称在前,名首字母在后,[au]。如:smithab[au]“paulsene”[au]三、PubMed基本检索规则逻辑运算式输入:PaulsenE撰写的芦荟治疗牛皮癣的文章2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室22刊名检索:全称或MEDLINE认可的标准缩写,[so]如:Journalofinvestigativedermatology[so]Jinvestdermatol[so]三、PubMed基本检索规则输入刊名检索发表在该刊上的文献(限定出处字段SO)2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室23PubMed记录字段说明文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室24电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室25最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室26作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式(纸张或电子)参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室27截词检索:treat*可检出:treat,treated,treatment...强迫短语检索:“”,不进行自动转换匹配和扩展检索如:“acutelowbackpain”“ang1”(血管紧张素1缩写)检出1085篇比较:ang1检出9956篇,误检多,其中有:三、PubMed基本检索规则2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室282020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室29自动转换匹配检索词:对常用医学名词自动在规范词索引(主题词、副主题词、物质名称)中转换、并在所有记录字段中匹配。如:tonguecancertongueneoplasms[MeSHTerms]OR(tongue[AllFields]ANDneoplasms[AllFields])ORtongueneoplasms[AllFields]OR(tongue[AllFields]ANDcancer[AllFields])ORtonguecancer[AllFields]三、PubMed基本检索规则2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室30结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换的检索词2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室31自动转换匹配检索词:如:hypertensiontherapyDetails:(hypertension[MeSHTerms]ORhypertension[AllFields])AND(therapy[Subheading]ORtherapy[AllFields]ORtherapeutics[MeSHTerms]ORtherapeutics[AllFields])三、PubMed基本检索规则2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室32四、PubMed检索限制:LimitsPubMed主页、结果显示页、高级检索界面均有Limits链接。2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室33全文、免费全文、摘要限定出版日期限定文献类型限定语种限定研究对象人/动物限定性别限定年龄限定各种专题的子数据库限定2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室34五、PubMed高级检索功能一个网页中集多种功能于一体基本检索检索细节检索式编制检索历史其他检索资源检索词索引结果预览2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室35SearchBuilder(检索式编制):检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。多个字段检索要分多次输入。SearchHistory(检索历史):检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。可组配检索式,如:#1OR#2,#1ANDchild点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。Preview(结果预览):在History中快速显示检索式与检出篇数Details(检索词匹配细节):显示转换规范词及运算的详细过程,可确定规范词五、PubMed高级检索规则2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室36六、PubMed其他资源1.MeshDatabase(规范化主题词表)功能:确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词进入途径:MeSHDatabase链接:PubMed主页,AdvancedSearch界面MeSH选项:基本检索框前Search下拉菜单的2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室37进入MeSH2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室38MeSH词检索例1:2006-10年关于舌根癌药物治疗的文献。课题分析:舌根癌的不同表达形式(OR):tonguebasecancer、cancer/carcinoma/tumoroftonguebase、cancerofthebaseoftongue…药物治疗的不同表达形式(OR):drugtherapy/treat/treatment两个概念之间:舌根癌AND药物治疗2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室39输入检索词,查找规范词未匹配到规范词改用上级概念“舌癌”匹配2020/3/10复旦大学图书馆文献检索教研室40只查重点论述的文献2020/3/