Nextseq-500二代测序实验室要求

NewgenegleNextSeq™500实验室指导方案一、实验室要求………………………………………………………………………….1-2二、电的要求………………………………………………………………………………3三、不间断电源（UPS）…………………………………………………………….4四、环境限制………………………………………………………………………………5五、计算网络要求……………………………………………………………………….6六、用户提供的消耗品和设备…………………………………………………...7-81一．实验室要求1.Nexseq500仪器尺寸：测量尺寸高度58.5cm(23in.)宽度53.4cm(21in.)深度63.5cm(25in.)重量83kg(183lbs.)2.安置要求仪器安装的位置必须保证有足够的空间，以确保能够接触电源开关和电源插座，以及进行设备的检修，同时应当保持适当的通风。1)仪器的左侧应有足够的空间，以确保实验人员能够控制位于仪器背部电板电源线上的电源开关。2)放置仪器以便工作人员可以迅速的从电源插座上断开电源线。3)该仪器四周能够让实验人员进入操作的空隙不能小于以下数值。进入最小间隙边距至少61cm，仪器的每一边背部至少10.2cm，仪器背面顶部至少61cm，仪器顶部；如果仪器放在隔板下，依然要符合此规定注：移动仪器需要联系厂家代表。如果移动仪器不当会影响光学校准以及数据的完整性。3.放置Nextseq500的实验台要求仪器中有精密的光学原件，应该被安装在坚固的实验台上，并远离振动源。宽度高度深度脚轮122cm(48in.)91.4cm(36in.)76.2cm(30in.)非强制的24.防止震动源使用以下指导意见最小化测序过程中的震动，以保证光学表现。1)把仪器安装在坚固牢靠的实验台上。2)不要将其他任何可能导致震动的设备放置在同一实验台上，如摇床，涡旋器，离心机，或能引起空气流动的装置。3)在测序过程中，不要打开试剂箱门，缓冲液门，右侧的服务面板，或流式细胞门。不要在仪器上放置任何物品。5.PCR工序的实验室设置实验室在使用前应建立专用区域和实验程序，并确保实验室设置合理，以减少被PCR产物污染的风险（PCR产物会污染试剂，仪器，样本等，并导致实验结果的不准确性）。1)专用的完全独立区域如果您打算进行PCR序列扩增，仪器必须设在PCR后处理实验室。专用的完全独立的PCR前处理实验室进行PCR前处理工序（DNA的提取，量化和标准化）。专用的完全独立的PCR后处理实验室进行PCR产品制造和加工。绝不使用同一水池进行PCR前处理和PCR后处理材料的清洗工作。绝不使用同一个水纯化系统进行PCR前处理和PCR后处理的工序。PCR前处理方法中使用的所有物品均应保存在PCR前处理区，并根据需要送到PCR后处理区。2)专用设备和用品进行PCR前处理和PCR后处理的实验室工序所使用的设备和用品应当进行专用的独立的设置（移液器，孵化器，加热区，涡旋器，离心机等），同时，PCR前处理和PCR后处理工序不能共用这些设备和用品。PCR前处理和PCR后处理的实验耗材应设置专用的独立的储存区域（冰柜和冰箱）3二．电的要求1.电源规格型号规格线电压100–240VAC@50/60Hz功率600Watts2.插座您的设备必须连接下列设备：1)对于100-120伏交流电--15安培地接，适当电压的专用线和电接地是必需的。北美和日本的插座类型：NEMA5-152)对于220-240伏交流电--10安培的有适当电压的接地线和电接地是必需的。3)如果电压波动超过10％时，电源线调节器是必需的。3.安全接地线1)通过外壳，仪器具有一个来保护接地安全的接点。2)安全地面通过电源线的返回去保护接地是一种安全参考方案。3)使用设备的时候，电源线上的保护接地的接地线必须有稳定工作条件。4.电源线1)仪器拥有一个IEC60320C20国际标准的插座盒以及一个区域特定的电源线。2)只有当电源线从交流电源上断开连接的时候，危险电压才能从这个仪器上移除。3)要获得符合当地标准的等效的插座或电源线，咨询第三方供应商，如Interpower公司注：别使用额外的电源线来连接仪器。5.保险丝这个仪器有一个不能被用户更换的保险丝4三．不间断电源（UPS）规格APCSmartUPS2200VALCD120V(日本/北美)APCSmartUPS2200VALCD230V(国际)最大功率1920W1980W输入电压100–120VAC220–240VAC输入频率50/60Hz50/60Hz输入连接NEMA5-20PIEC-320C20标准的运行时间（300W）90分钟90分钟标准的运行时间（600W）40分钟40分钟注：要获得符合当地标准的等效的UPS，咨询第三方供应商，如Interpower公司5四．环境限制环境因素要求温度维持实验室温度在19度到25度(22±3度).这个温度是仪器的操作温度。在运行过程中，别让周围温度的改变超±2度。湿度维持20-80%的不凝结的相对湿度。海拔仪器要安装在海拔2000米以下。空气质量仪器的操作应该在PollutionDegreeII（二级污染）或更好的环境中。PollutionDegreeII：通常只包含有非导电污染物。通风请咨询您的设备部门以便通风要求能够满足仪器预期热量输出的水平。1.热量输出实测功率热量输出600watts2048BTU/hour2.噪音输出噪音输出（分贝）与仪器的距离60分贝1米6五．网络考虑1.对网络连接来说，仪器提供了一个加保护罩的，3米长的CAT6网线。以下操作需要网络与英特网连接：连接到IlluminaBaseSpace®或者BaseSpace®Onsite。通过NextSeq控制软件(NCS)界面接收和安装软件更新。从仪器中移动运行数据到服务器位置。使用实时帮助,一个在线的仪器的特点是连接你到Illumina技术支持来排除障碍。2.网络支持Illumina并不提供仪器网络化的安装和技术支持。使用以下建议来安装和维护网络连接：在仪器和管理系统之间使用1GB的的连接。这个连接能被直接制作或者通过网络开关。寻求网络设备管理员对潜在的系统兼容性风险进行网络维护活动的复查检测。7六．用户提供的耗材及设备以下的耗材和设备是使用Nexseq500进行测序所要求的。1.用户提供的耗材以下耗材在测序运行前就必须准备好耗材提供者目的1NNaOH(sodiumhydroxide)普通实验室供应商Librarydenaturation,稀释到0.2N200mMTris-HCl,pH7普通实验室供应商LibrarydenaturationAlcoholwipes,70%IsopropylorEthanol,70%VWR,catalog#15648-981*普通实验室供应商流式细胞清洗和通用的目的无粉的一次性手套普通实验室供应商通用的目的低棉纤维的实验室纸巾VWR,catalog#21905-026*流式细胞清洗3%–6%NaOCl(sodiumhypochlorite)Sigma-Aldrich,catalog#239305*清洗仪器,稀释到0.03%–0.06%(自动和手动清洗)Tween20Sigma-Aldrich,catalog#P7949清洗仪器(手动清洗),稀释到0.05%实验室级别的用水普通实验室供应商清洗仪器(手动清洗)2.实验室级别用水指导总是使用实验室级别的水来运行仪器程序。绝不使用自来水或者去离子水。以下的任何一种样品都是能被接受的：IlluminaPW118Megohm(MΩ)waterMilli-QwaterSuper-Qwater分子生物级别的用水3.用户提供的设备物品来源无霜冰柜,-15度到-25度普通实验室供应商冰桶普通实验室供应商冰箱,2度to8度普通实验室供应商84.需要储存的耗材物品（每一次运行）储存要求试剂盒-15度到-25度缓冲盒15度到30度流式细胞盒2度到8度