医学文献检索PubMed医学文献检索医学文献检索2PubMed()是由美国国立医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)研制开发的文摘型数据库。收录1946年至今来自80多个国家60多个语种的生物医学文献,最早可追溯至1848年,至2012年2月底记录总量已超过2155万条。具有收录范围广、数据更新快、覆盖内容全、检索途径多、检索方式灵活、检索体系完备、链接功能强大及使用免费等特点。PubMed医学文献检索医学文献检索3历史沿革1879年《IndexMedicus》(简称IM)创刊。1960年起IM由NLM编辑出版。1964年NLM开发了MEDLARS实现了IM的自动化编辑。1971年NLM建成MEDLINE(MEDLARSonline)联机数据库。1983年MEDLINE光盘版(MEDLINEonCD)发行。1997年NLM下属的NCBI开发了网络版MEDLINE,即PubMed检索系统。主题词---人工标引PubMed医学文献检索医学文献检索4MEDLINE收录1946年至今出版的80多个国家39个语种的5600多种生物医学期刊的文摘及题录数据,总数达1944多万条。每条记录都进行主题词、特征词等规范化标引,记录末尾标有[PubMed-indexedforMEDLINE]。OldMEDLINE存放1965年以前出版的、未进行标引的数据,这些记录中没有MeSH字段和摘要字段,末尾标有[PubMed-OLDMEDLINE]PreMEDLINE临时存放尚未标引MeSH主题词、文献类型的最新数据,待数据完成标引后再转入MEDLINE,记录末尾标有[PubMed-inProcess]。Publisher-SuppliedCitations出版商提供的未被MEDLINE收录的非生物医学专业的文献,记录末尾标有[PubMed-assuppliedbypublisher]。NOTEDLINENIH资助的研究人员的手稿、向PubMedCentral提交全文的生命科学期刊论文、及接受NLM评审的文献,这些记录均不被MEDLINE收录,末尾标注为[PubMed]。注意:许多出版商通过电子期刊平台发布最新的文献信息,这些先于印刷版期刊发表的电子期刊文献加标[Epubaheadofprint]标识。PubMed医学文献检索医学文献检索5检索方法主界面检索方法检索结果显示和输出检索实例常用检索途径医学文献检索医学文献检索6检索区PubMed功能服务区数据库选择检索方式、帮助检索输入框NCBI功能服务区主题检索期刊检索检索、清除医学文献检索医学文献检索7检索字段含义检索字段含义AD第一著者的单位、地址PT文献类型ALL可供检索的所有字段SB子集AU著者FAU著者全名1AU第一著者LASTAU排名最后的著者MAJR主要主题词TI题名SH副主题词TIAB题名/摘要MH主题词VI期刊卷号NM化学物质名称IP期刊的期号PA药理作用PG文献起始页码医学文献检索医学文献检索8基本检索(search)限定检索(Limits)主题检索(MeSHDatabase)期刊检索(JournalsDatabase)其他检索功能高级检索(Advancedsearch)医学文献检索医学文献检索9基本检索(search):主界面默认的检索方法自动词语匹配(AutomaticTermsMapping)精确检索截词检索字段限定检索著者检索期刊检索逻辑组配检索医学文献检索医学文献检索10对输入的有实际意义的检索词、短语,系统会自动进行词语的匹配转换,并返回检索结果。匹配原理输入的检索词、短语依次在多个词表(MeSH转换表、刊名转换表、著者转换表、著者索引表、合作者转换表及合作者索引表)中进行搜索、比对,并自动转换为相应的MeSH词、刊名或著者,再将短语、构成短语的单词分别在所有字段中检索,输出检索结果。基本检索—自动词语匹配医学文献检索医学文献检索11检索词MeSH转换表(主题词、副主题词)刊名转换表(全称、缩写、ISSN)著者转换表(著者全名)著者索引表(著者缩写)合作者转换表(合作者全名)合作者索引表(合作者缩写)转换为相应的MeSH词、刊名或著者,再将检索词在所有字段中检索,输出检索结果。基本检索—自动词语匹配医学文献检索医学文献检索12精确检索亦称强制检索。在短语上加双引号“”,避免自动词语匹配时将短语拆分造成的误检,系统会将该短语作为一个整体在所有字段中进行检索。精确检索时PubMed会关闭自动词语匹配功能。基本检索—精确检索医学文献检索医学文献检索13精确检索和自动词语匹配对比自动词语匹配的结果实际执行的检索式强制检索结果实际执行的检索式医学文献检索医学文献检索14使用无限通配符“*”,可实现截词检索。PubMed会关闭自动词语匹配功能,在所有字段中执行检索。各检索词间为逻辑OR关系。基本检索—截词检索在所有字段检索前缀为acupunctur的检索词医学文献检索医学文献检索15在检索词后输入检索字段标识可进行字段限定检索,以提高查准率。输入格式为:检索词[字段标识]。如检索标题中含Diabetes(糖尿病)的论文,可输入Diabetes[TI];要检索综述文献可输入Review[PT]。字段限定检索时,系统关闭自动词语匹配功能,只在限定的字段检索输入的检索词。基本检索—字段限定检索检索出篇名中出现糖尿病的综述文献医学文献检索医学文献检索16在检索框中输入著者姓名时,通过“自动词语匹配”,系统会自动执行著者检索。使用著者字段进行限定检索可实现特殊的检索要求。如检索某著者作为第一作者或排名最后的作者发表的论文时,即可用字段限定检索来实现。基本检索—著者检索检索2002年前的论文时要求姓前名后,姓用全称,名用首字母缩写。2002以后的论文还可用姓和名的全称检索,且前后顺序不限。输入Huangw[1AU],可检索出Huangw作为第一作者发表的文献;输入Huangw[LASTAU],可检索出Huangw作为排名最后的作者发表的文献。医学文献检索医学文献检索17在检索框中输入刊名全称、标准的MEDLINE刊名缩写或期刊的ISSN时,通过“自动词语匹配”,系统会自动检索出该刊被PubMed收录的文献。当刊名与MeSH词相同时,如Blood、Cell、Cancer等,采用刊名字段限定检索,可避免自动词语匹配造成的误检。如输入Blood[TA],即可检索出期刊Blood被PubMed收录的所有文献。基本检索—期刊检索医学文献检索医学文献检索18基本检索界面支持布尔逻辑运算组配检索,运算符为AND、OR、NOT,大小写不限。同时输入多个检索词,系统默认检索词之间是逻辑AND关系。当检索式中存在多种逻辑关系时,先运算AND,再按从左到右的顺序运算,加括号可改变运算的优先顺序。如:输入逻辑检索式cancerandliverorlungorstomach和输入lungorstomachorliverandcancer的检索结果相同。基本检索—逻辑组配检索医学文献检索医学文献检索19高级检索—检索界面检索构建器检索历史选择其他检索方式医学文献检索医学文献检索20高级检索—检索构建器点击Edit可在文本框内编辑检索式④选择逻辑运算符⑤点击Search执行检索⑥点击Addtohistory,在下方的检索历史中显示结果数量①选择检索选项②输入检索词③通过索引表正确选词检索构建步骤:1diabitis3456医学文献检索医学文献检索21高级检索—检索历史可查看检索历史,还可对检索式进行逻辑组配检索。该界面可保存100条检索式,最多可保留8个小时。从左到右依次显示检索式序号、添加键、检索式、检索结果数量及检索时间。点击结果数量,可浏览检索结果。点击序号可对该检索式进行逻辑组配检索。医学文献检索医学文献检索22限定条件—界面限定文献类型限定原文语种限定对象种类限定性别限定期刊子集限定年龄组限定摘要或全文限定检索字段限定时间范围医学文献检索医学文献检索23限定检索显示已激活的限定条件更改、清除限定条件条件一旦限定,对以后每一次检索都有效医学文献检索医学文献检索24主题词检索—主界面输入检索词,点击search,查找该检索词对应的主题词acupuncture医学文献检索医学文献检索25主题词检索—主题词列表主题词列表按相关度排序,根据注释信息确定主题词,点击主题词主题词主题词注释主题词收录时间医学文献检索医学文献检索26主题词检索—检索界面可组配的副主题词列表限定为主要主题词不进行扩展检索款目词历史标引相关参见树状结构医学文献检索医学文献检索27主题词检索—检索界面点击此键,将检索式添加到检索构建器∨勾选要组配的副主题词点击searchpubmed执行主题词检索医学文献检索医学文献检索28主题词检索—优点采用主题词检索能保证较好的查全率采用主题词检索能保证较好的查准率主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范。系统默认对主题词进行扩展检索(Explode),即同时检索该主题词的下位主题词。可与专指的副主题词组配,限定检索主题词某方面的文献。可将主题词限定为主要主题词(MAJR),从而使检索结果更准确。医学文献检索医学文献检索29主题词检索—注意事项单独采用主题词检索可能会造成漏检,实际检索时应结合其他检索方法。PubMed系统中只有MEDLINE数据库中的记录进行了主题词标引,所以主题词检索只对MEDLINE中的记录有效,而PubMed中其他来源的记录不支持主题词检索。主题词检索时需注意主题词的收录时间。如上例中“stroke”是2000年收录为主题词的,故检索结果均是2000年以后发表的文献,检索2000年之前的文献要结合其他主题词或结合基本检索。医学文献检索医学文献检索30期刊检索—界面可输入主题、刊名全称或缩写、ISSN医学文献检索医学文献检索31其他检索功能单篇引文匹配器(SingleCitationMatcher)可通过输入已知的作者、期刊名称(全称或标准缩写)、出版年月日、卷、期、起始页码或篇名中的任意词准确查找到所需的单篇文献。批量引文匹配器(BatchCitationMatcher)按指定格式将需要查找的记录信息输入到下方的文本框中,检索结果可通过邮件发送或直接保存到文件中。临床试验(ClinicalTrials)点击ClinicalTrials进入ClinicalTrials.gov页面,可检索来自全球178个国家的12万个实验信息。临床查询(ClinicalQueries)专为医生设计的检索服务,输入疾病名称后,可选择查询临床研究分类(ClinicalStudyCategories)、系统评价(SystematicReviews)和医学遗传学(MedicalGenetics)三大类文献,仍可再细分。特定专题查询(Topic-SpecialQueries)整合了PubMed提供的其他专题检索功能,包括对临床医生和健康服务人员查询、对不同学科子集及不同的期刊子集的查询。医学文献检索医学文献检索32检索结果显示检索结果输出显示格式排序方式其他栏目医学文献检索医学文献检索33检索结果显示选择显示格式、每页显示记录数和排序方式更改设置后点击“Apply”其他栏目信息医学文献检索医学文献检索34Summary系统默认的显示格式Summary(text)Summary格式的纯文本形式显示。AbstractSummary格式所有信息,加上著者单位、摘要、出版类型、MeSH主题词、化学物质等信息。以Abstracts格式显示可获得更多的全文链接。Abstract(text)Abstract格式的纯文本形式显示。MEDLINE显示记录中的全部字段信息,是显示字段最全的格式。XML显示XML格式的信息,方便在Web上进行转换和描述。PMIDList显示每条记录的PMID号,是显示字段最