Gaussian菜鸟常见问题分析

Gaussian菜鸟常见问题分析1．检查是否有初始文件错误在命令行中加入%kJobL301or%kJobL302如果通过则一般初始文件ok。常见初级错误：a.自旋多重度错误b.变量赋值为整数c.变量没有赋值或多重赋值d.键角小于等于0度，大于等于180度e.分子描述后面没有空行f.二面角判断错误，造成两个原子距离过近g.分子描述一行内两次参考同一原子,或参考原子共线2．SCF(自洽场)不收敛则一般是L502错误省却情况做64个cycle迭代(G03缺省128cycles)a.修改坐标，使之合理b.改变初始猜Guess=Huckel或其他的，看Guess关键词。c.增加叠代次数SCFCYC=N（对小分子作计算时最好不要增加，很可能结构不合理）d.iop（5/13=1）这样忽略不收敛，继续往下做。3．分子对称性改变a.修改坐标，强制高对称性或放松对称性b.给出精确的、对称性确定的角度和二面角。如CH4的角度给到109.47122c.放松对称性判据Symm=loosed.不做对称性检查iop(2/16=1)（最好加这个选项）iop(2/16=2)则保持新的对称性来计算4．Opt时收敛的问题a.修改坐标，使之合理b.增加叠代次数optcyc=N5．优化过渡态，若势能面太平缓，则不好找到。iop(1/8=10)默认30（下一个结构和该结构的差别0.3Å），可改成10。如果每一步都要用到小的步长，应该加opt(notrustupdate)6．在CI（组态）方法中如QCISD(T),CCSD(T),CID方法中，省却最大循环50，若出错（L913错误）解决方法：#PQCISD(maxcyc=N)注：N≤5127．优化过渡态opt=TS(给出过渡态)opt=qst2(给出反应物和产物)opt=qst3(给出反应物和产物和过渡态)a.用G03时的出错opt=ts必须加FC(forceconstant)写法：opt=(TS,calcFc)oropt=(TS,calchffc)计算HF力常数，对QCISD，CCSD等方法用；oropt=(TS,modRedundant)(最好写这个)b.如果计算采用QCISD计算（不好计算FC）则写为QCISDopt=(TS,calcHFFC)(用HF计算FC)8.无法写大的Scratch文件RWFa.劈裂RWF文件%rwf=loc1,size1,loc2,size2,……..,locN,-1b.改变计算方法MP2=Direct可以少占硬盘空间c.限制最大硬盘maxdisk=NGB，****MB,有些系统写2GB会出错，可以写2000MB9.FOPT出错原因是变量数与分子自由度数不相等。可用POPT或直接用OPT10.优化过渡态只能做一个STEP原因是负本征数目不对添加iop（1/11）=1或者noeigentest我是初学者，看到这个图，然后参考高斯用户参考手册，一点自己的解释和看法，请多多指教。上面的图应该是从L301说起的，即图中的“基组”，L301的作用是产生基组信息。（在这之前还有L1：处理计算执行路径，创建执行链接的列表，并初始化scratch文件；L101：读取标题和分子说明部分；L103：berny优化到最小值；L202：重新定位坐标，计算对称性，检查变量）“基组”之后是“分子结构”即L401，形成初始的分子轨道初猜。第一个框中有“分子轨道”和“能量”两项，我想这应该指的是L502即迭代求解SCF方程。下面红线圈的框中则是迭代求解的具体过程。每次迭代完毕都得到一个能量。即（SCFDone:E(RHF)=-xx.xxxxA.U.afterxxcycles）然后是L103判断力和位移是否满足收敛条件。如果满足（即四个yes），则进行布居分析等，并完成计算。如果不满足，则继续调整分子结构（L401），再次进行迭代求解，反复这个过程，直到满足力和位移收敛条件为止。如果不是HF方法而是多体微扰，CI等后-scf方法的话，在每次迭代（L502）完成后还要多一步相关能的计算，以MP2为例，迭代完成后多出:L801(双电子积分变换的初始化),L906(半直接的MP2)和L1002(迭代求解CPHF方程)等计算。对于楼主的图，我觉得力和位移判断为NO以后，箭头应该指向最头上的“基组”，因为实际过程中，每次构型调整都会重新定位坐标和产生基组信息。对于楼上说图看不清楚，可以把图拷下来然后用看图软件放大看。