分类号:S512.1单位代码:10183研究生学号:2008861008密级:公开吉林大学博士学位论文小-大麦2H染色体重组材料创制及外源基因在小麦背景中表达研究Developmentofwheat-barleychromosome2Hrecombinationlinesandresearchonexpressionofaliengenesinwheatbackground作者姓名:邹宏达专业:植物学研究方向:植物种质资源与利用指导教师:原亚萍教授培养单位:植物科学学院2012年12月小-大麦2H染色体重组材料创制及外源基因在小麦背景中表达研究Developmentofwheat-barleychromosome2Hrecombinationlinesandresearchonexpressionofaliengenesinwheatbackground作者姓名:邹宏达专业名称:植物学指导教师:原亚萍教授学位类别:理学博士论文答辩日期:年月日授予学位日期:年月日答辩委员会主席:论文评阅人:本研究由国家自然科学基金项目(30571152)资助ThisresearchwassupportedbytheNationalBasicResearchofChina(NO.30571152).未经本论文作者的书面授权,依法收存和保管本论文书面版本、电子版本的任何单位和个人,均不得对本论文的全部或部分内容进行任何形式的复制、修改、发行、出租、改编等有碍作者著作权的商业性使用(但纯学术性使用不在此限)。否则,应承担侵权的法律责任。吉林大学博士学位论文原创性声明本人郑重声明:所呈交学位论文,是本人在指导教师的指导下,独立进行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学位论文作者签名:日期:年月日《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿声明研究生院:本人同意《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》出版章程的内容,愿意将本人的学位论文委托研究生院向中国学术期刊(光盘版)电子杂志社的《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》投稿,希望《中国优秀博硕士学位论文全文数据库》给予出版,并同意在《中国博硕士学位论文评价数据库》和CNKI系列数据库中使用,同意按章程规定享受相关权益。论文级别:□硕士■博士学科专业:植物学论文题目:小-大麦2H染色体重组材料创制及外源基因在小麦背景中表达研究作者签名:指导教师签名:年月日作者联系地址(邮编):作者联系电话:I摘要小-大麦2H染色体重组材料创制及外源基因在小麦背景中表达研究小麦(TriticumaestivumL.,2n=6×=42)和大麦(HordeumvulgareL.,2n=2×=14)是世界上两大重要的麦类作物,通过小麦和大麦的远缘杂交,可以将大麦的优良基因及其相应性状导入小麦,如早熟、耐生物和非生物胁迫及各种品质性状。小麦成熟期穗发芽是一种世界性自然灾害,穗发芽时小麦α-淀粉酶活性提高,对胚乳中淀粉分解能力增强,不仅影响小麦产量,而且还会影响小麦的营养品质和加工品质。位于大麦2H染色体长臂上的Isa基因所编码的大麦α-淀粉酶抑制蛋白BASI(bifunctionalα-amylase/subtilisininhibitor),可以通过与小麦α-淀粉酶相结合而抑制其活性,从而降低小麦穗发芽的危害,提升小麦品质。本研究通过郑麦9023,CB037,中麦16等小麦品种与小-大麦2H染色体异代换系2H(2A)及2H(2B)的杂种幼胚组织培养,经愈伤组织诱导、继代、分化的途径最终获得522株结实的SC1代再生植株。以大麦Betzes、小麦CS、小-大麦2H染色体异附加系、一整套小-大麦2H染色体异代换系2H(2A)、2H(2B)和2H(2D)为材料共筛选出10对分别位大麦2H染色体短臂和长臂的大麦2H染色体特异SSR分子标记。通过大麦第二部分同源群特异SSR分子标记,对组培SC1代再生植株及其自交后代SC2-5代植株进行逐代筛选,以追踪和鉴定大麦2H染色体。通过以大麦Betzes基因组DNA为探针、小麦CS基因组DNA为封阻的基因组原位杂交对部分SC4及SC5植株进行进一步验证,最终获得了携带有大麦2HL染色体的杂合易位、纯合易位、单端体、双端体及单等臂体遗传材料。经大麦Isa基因特异引物进行PCR验证,以上这些材料均携带Isa基因。对小-大麦2HL染色体杂合易位系32-4-9,32-4-18及纯合易位系32-4-11花粉母细胞减数分裂I中期的染色体构型进行检测,表明杂合易位系和纯合易位系染色体配对正常,细胞学上遗传稳定。在将外源种质转移至小麦遗传背景的过程中,会引起小麦基因组结构及基因表达的广泛遗传变异。为了了解由大麦2H染色体导入而引起的小麦基因组结构的变异,采用荧光AFLP对大麦Betzes,小麦CS,小-大麦2H异附加系,小-大麦2H异代换系2H(2A)、2H(2B)、2H(2D)这一整套材料进行分析。64对引物组合在大麦中获得了3157个条带,在其它材料中获得了4736个条带。AFLP扩增类型表明,附加系中检测到了消减和激活位点,而代换系基因组结构几乎无变化。同时还检测到了多条大麦2H染色体及小麦2A、2B、2D染色体特异的AFLP片段,经回收测序后,将AFLP分子标记转换成STS分子标记并进行验证,共获得2条大麦2H染色体特异的AFLP-STS分子标记,小麦2A、2B、2D染色体特异的AFLP-STS分子标记各1条。为了了解由大麦2H染色体导入而引起的小麦基因组的表观遗传学变异,在荧光AFLP检测的基础上构建了荧光MSAP检测体系,对大麦Betzes,小麦CS,小-大麦2H异附加系,II小-大麦2H异代换系2H(2A)、2H(2B)、2H(2D)这一整套材料的基因组甲基化模式进行分析。MSAP结果表明,大麦2H染色体导入引起了小麦基因组的甲基化变异,同时大麦2H染色体本身也检测到了甲基化的升高。为了了解由大麦2H染色体导入所引起的基因表达差异,通过荧光cDNA-AFLP对大麦Betzes,小麦CS,小-大麦2H异附加系,小-大麦2H异代换系2H(2A)、2H(2B)、2H(2D)这一整套材料进行了基因表达差异分析,分离和克隆了大量差异表达基因,并初步确定了大麦2H染色体在小麦基因背景中的表达模式。通过iTRAQ技术来了解由大麦2H染色体导入所引起的蛋白表达差异,尝试对以上材料进行差异蛋白质组学分析,目前为止,共鉴定出589个蛋白。关键词:小麦,大麦,2H染色体,易位系,分子标记,基因表达IIIAbstractDevelopmentofwheat-barleychromosome2HrecombinationlinesandresearchonexpressionpatternsofaliengenesinwheatgeneticbackgroundWheat(TriticumaestivumL.,2n=6×=42)andbarley(HordeumvulgareL.,2n=2×=14)aretwoofthemostimportantcerealcropsworldwide.Thehybridizationofwheatandbarleymakesitpossibletotransferdesirablegenesandtraits,suchasearliness,tolerancetobioticandabioticstresses,andvariousnutritionalparameters,frombarleytowheat.Thewheatpre-harvestsproutingisaworldwidenaturaldisaster.Inthecourseofhighactivityofα-amylase,pre-harvestsproutingcannotonlyresultinagreatdecreaseinwheatyield,butalsodramaticallydegradethenutritionalandprocessingqualityoftheseeds.Thebifunctionalα-amylase/subtilisininhibitor(BASI)encodedbytheIsageneonbarleychromosome2HLcouldinhibitwheatα-amylaseactivitybyreducingpre-harvestsproutingandimprovingthequalityofwheat.RegeneratedplantswerederivedfromimmatureembryocultureofhybridsofcommonwheatvarietiesZhengmai9023,CB037andZhongmai16withthewheat-barley2Haliensubstituionlines2H(2A)and2H(2B)aftercallusinduction,subcultureanddifferentiation.10SSRmolecularmarkersspecifictobarleychromosome2HlocatedonshortarmandlongarmwereselectedfrombarleyBetzes,wheatCS,wheat-barley2Hadditionline,wheat-barley2Hsubstitutionline2H(A),2H(2B)and2H(2D).Thepresenceofbarley2Hchromatinwasdetectedinregeneratedplants(SC1)andtheirselfedprogenies(SC2-5)usinghomoeologousgroup2SSRmarkersfrombarley,andfurtheridentifiedinselectedSC4andSC5linesusinggenomicinsituhybridizationwithbarleygenomicDNAasprobeandCSgenomicDNAforblocking.TheIsagenefromtheidentifiedSC4andSC5lineswasalsoamplifiedusingIsaspecificprimers.Weidentifiedwheat-barley2HLchromosomeheterozygoustranslocationlines,ahomozygoustranslocationlines,monotelosomiclines,ditelosomiclines,andanisochromosomelinecarringtheIsagene.MetaphaseIpairingofline32-4-9,line32-4-18,line32-4-11indicatedthatboththewheat-barley2HLchromosomeheterozygoustranslocationlineandhomozygoustranslocationlineshouldregularlydisjoinandbestableincytology.Duringtheprocessofaliengermplasmintroducedintowheatgeneticbackgroud,extensivegeneticvariationsofgenomestructureandgeneexpressioncouldbeinducedinwheat.Tounderstandgeneticchangesassociatedwithintroductionofbarelychromosome2Hintowheatg