NMR中文操作手册VnmrJ22C目录第一章软件使用入门1.1节MenuBar1.2节ToolBarandUserToolBar1.3节Locator1.4节HoldingPen1.5节ViewportsVerticalPanel1.6节GraphicsControlsBar1.7节AdvacnedFunctionBar1.8节GraphicsCanvas1.9节ActionControl1.10节ParameterPanel1.11节HardwareBar第二章基本1DNMR实验的设定、采样、数据处理及绘图2.1节实验前设定2.2节选择实验2.3节设定实验2.4节采集NMR信号2.5节Data处理2.6节图谱显示2.7节绘图2.8节保存与读取文件第三章基本2DNMR实验的设定、采样、数据处理及绘图3.1节二维实验介绍3.2节二维实验设定3.3节二维实验参数设定3.4节启动实验3.5节实验图谱处理3.6节互动式二维彩色谱图显示控制3.7节二维谱图列印附录A常用指令附录B简易操作步骤附录CWalkup使用简介附录DChemicalshift附录E设定转速与温度附录F锁场附录G匀场第一章软件使用入门液体NMRVnmrJ操作界面如下图所示,此界面是一个互动操作区域,本章节将逐步针对不同互动区域进行说明。1.1节介绍MenuBar1.2节介绍ToolbarandUsertoolbar1.3节介绍Locator1.4节介绍HoldingPen1.5节介绍ViewportsVerticalPanel1.6节介绍GraphicsControlsBar1.7节介绍AdvancedFunctionBar1.8节介绍GraphicsCanvas1.9节介绍ActionControl1.10节介绍ParameterPanel1.11节介绍HardwareBar1.1节MenuBarMenuBar位于该操作界面的顶端,它包含多重功能。以下将针对各选项做介绍:中文界面显示如下File(文件)文件的保存、读取与打印机的设定等功能。副选单选项有:■NewWorkspace建立新工作区■Open打开文件■Saveas…文件另存为…■AutoSave依照设定的文件格式储存文件■SaveDatasetup保存数据格式设定■Newautomationrun建立新的自动进样文件目录(walkup界面)■Printers打印机设定该选项视窗如下,在此可选择不同的输出。■PrintScreen印屏幕■AutoPlot自动绘图■CreateaPlotDesign…开启绘图设计界面开启plotdesign视窗来设计谱图输出格式,如下图:■SwitchOperators切换操作者(walkup界面)■ExitVnmrJ退出VNMRJ软件Edit(编辑)提供不同工作区的文件转移及参数页面与工具列编辑功能,若要设定系统组态也在此列。副选单选项有:■MoveParameters移动参数(相对应的指令:mp)■MoveFID移动FID(相对应的指令:mf)■MoveText移动注解■MoveDisplayParameters移动显示参数■NewPulseShapes建立新的形状脉冲■ViewPulseShapes查看形状脉冲■New/EditMacro编辑巨集指令■ToolBar显示工具列■DisplayOptions显示软件颜色设定该选项可进行display设定视窗,在此可依个人偏好进行视窗的色彩以及字体等设定。■Editconfigprofile…编辑系统文件■ParameterPages编辑参数页面设置■Viewports设定图形界面显示视窗数目■Applications包括Autotest,chempack■SystemSettings…系统设置…View(视图)显示或隐藏指令区,显示区工具列,实验区等功能。副选单选项有:■CommandLine显示指令输入行■ExperimentalPanel显示实验协定界面(Protocols)■ParameterPanel显示参数界面■Frame显示插图界面■Viewport显示多图视窗■StudyQueue显示实验序列(Walkup界面)■1D显示一维谱图处理垂直菜单■2D显示二维谱图处理垂直菜单■Cryo低温探头状态显示区■ArrayedSpectra显示序列图谱显示菜单■Toolbars显示多种工具列GraphicsToolbar显示图形工具列HardwareToolbar显示硬件状态工具列SystemToolbar显示系统快捷工具列UserToolbar显示使用者自定义工具列Experiments(实验菜单)在该选项内包含一些可用的脉冲序列明细,可进行相关的各种实验。若为walkup界面则使用Protocol垂直选单。Acquisition(信号采集)该选项可以执行下列acquisition相关的一些动作。副选单选项有:■UseStudyQueuecheckbox选择使用/不使用实验序列界面(walkup界面)■ParametersArrays参数排序设定该选项的选择将会开启ArrayParametertool如下图:界面上方为目前被array的一些参数,内容包括参数的名称(ParamName),参数的含义(Description),array大小(Size),array的顺序(Order)以及on/off的状态。可通过点选NewArray来增加要被array的参数或通过UnArray来移除。对于array的开关可以鼠标双击On/Off达到切换目的,对于array作用的先后顺序则可通过arrayorder来完成对于平行同步进行的array则需在arraysize一致下才可执行。以鼠标点array选参数表中任一array参数,则该array参数的内容就会显示于控制台中段,此时即可针对ArraySize,FirstValue,Increment,LastValue来进行设定,在界面中也包含Inc.Style,可选择array数值增加的方式,比如linearexponential或Randomize。在CurrentValue栏位可手动输入该参数数值,一旦该参数unarray或开闭时,它将自动恢复为CurrentValue栏位所设定的数值。Abandon按钮用以将控制台内恢复成该视窗初启动时候的数值,Close按钮将会储存目前的设定及关闭该视窗。■AcquireData采集数据(但不进行信号处理)■AcquireandWFT采集信号并进行傅立叶转换和进行加窗函数■AcquireandProcess采样于实验完成时显示频谱(用于排序实验)■PauseAutomation暂时中止自动实验■ResumeAutomation继续暂时中止自动实验■PauseAcquisition暂时中止采样■ResumeAcquisition续暂停的实验■AbortAcquistion终止(结束)实验■AbortAutomation终止(结束)自动实验Process(数据处理)该菜单提供以下的选项供数据处理时使用。副选单选项有:■ProcessandDisplay1D执行一维的傅立叶转换以及显示图谱■FullProcess执行一维以及二维的全自动数据处理并显示结果■DriftcorrectSpectrum执行一维光谱漂移校正(相对应的指令:dc)■AutomaticallySetIntegrals针对一维光谱执行自动积分区设定■BaselineCorrect执行一维光谱基线校正(相对应的指令:bc)■SetSpectralWidthBetweenCursors设定光谱区域为两游标所在区间■SetTransmitteratCursor移动光谱中心频率至游标所在处■AddandSubtracta1DData开启一维光谱加、减■ClearBufferandaddcurrentspectrum清除buffer(exp5)内容及加入新光谱■AddsecondSpectrumintoBuffer将第二个光谱加入buffer(exp5)中■FullProcess2D全自动二维傅立叶转换■Process2D二维光谱处理,二维傅立叶转换■Analyze图谱分析选项,处理分析T1,T2等数据Tools(工具)该选单下包含以下的功能,对于系统组态的设定及界面设定上非常有用。副选单有:■Updatenightqueuestarttime更新夜间排序开始时间(walkup界面)■OpenSampleTray开启样品状态视窗(walkup界面)■CreateProtocols增加实验协定■ProbeTuning探头调谐(protune选单)■DoGradientShimming脉冲梯度匀场■StandardCalibrationExperiments标准校正实验﹡CalibrationProbe探头参数校正﹡SetupGradientShimming设定脉冲梯度匀场功能﹡StartAutoTest执行自动实验﹡AutoTestsettings设定Console自动测试功能■UpdateLocator更新定位器内容■Importfilestolocator输入文件于定位器内该选项将开启如下视窗,可将文件传至Locator内。■Savecustomlocatorstatement保存用户定位器分类选单■Delectcustomlocatorstatement删除用户定位器分类选单■MolecularStructures开启绘制分子结构软件■Browser文件浏览■Locator数据管理器■ChangePassword更改密码Help(帮助)该菜单包含VnmrJ的所有在线说明1.2节SystemToolBarandUserToolBarToolBar位于menubar正下方,这些按钮提供常用功能的快速捷取。工具图示功能工具图示功能建立一新工作区显示FID选项开启文件与文件浏览器功能显示频率选项开启文件浏览以保存文件二维谱图显示选项取消命令终止实验开启视窗可显示设定与颜色UserToolBar工具图示功能工具图示功能储存显示格式1储存显示格式21.3节LocatorLocator(数据管理器)提供文件,实验参数,匀场数值及命令等的查询结果。选择所要查询的关键字再点选放大镜,例如SortWorkspace,SortNMRdata查询结果将会显示在Locator视窗内,白色部分表示符合查询条件的文件列表;灰色部分表示不符合查询条件的其它文件;点选Locator查询结果中的其中一项目,可以用鼠标将该项目拖拽至图形界面区或参数控制台来使用。如将文件拖拽到图形界面区,系统会把文件放置在此实验区内,且显示该图谱;若将实验区(workspace)拖拽至图形界面区,系统将会做实验区切换。相同的功能可以通过双击Locator内的项目而达成。1.4节HoldingPen使用该holdingpen可保存Locator中比较常用的项目,以方便取用,只要使用鼠标将所要的选项拖拽至holdingpen区即完成保存动作。至于holdingpen的内容并不会因Locator的内容改变而改变,holdingpen的内容就如同Locator的内容,拖拽或是双击该选项会产生同样的效果。若要将holdingpen的内容移除,只要将鼠标将要删除的项目拖拽至垃圾桶区即可。1.5节GraphicsControlsBarGraphicsControlsBar位于图形界面区左侧,使用该区内的控制按钮即可达成图形界面中图谱的处理,当图谱或FID显示时,通过这些按钮将可提供互动式的图谱处理,而这些动作包括积分,相位调整,边界线的设定等,而按钮的功能也会依图形界面区所显示的内容而有所改变。如下图:1.6节AdvancedFunctionBar以鼠标点选并向下拖拽谱图视窗边框,该圆点将开启命令输入及文字输出列,任何命令或巨集指令可通过该命令输入行来输入,至于错误及相关信息,此时将会显示于命令输入列上方文字输出视窗中,以鼠标点选命令列左