MassHunter数据分析培训教材

Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材1•确保选定usecurrentmethod。•确保不要选定Run‘FileOpen’actionsfromselectedMethod•如果文件夹中存在多个数据需要同时分析，可以按住Shift键同时单击需要分析的数据可同时打开多个数据•当窗口处于活动状态时，通过按F1键可以获取有关任何窗口、对话框或选项卡的帮助5977MSDMassHunter数据分析培训教材培训目的熟悉安捷伦MassHunter工作站，了解其主要界面及相关功能；能够正确使用该软件完成一次典型的定性分析并打印出定性报告；能够正确使用该软件完成一次典型的定量分析并打出定量报告。第一章定性分析打开软件之前先将数据采集软件光盘(G3336-60065_MassHunterQualitativeAnaylsisDASoftwareB.06.00)X:\DATA\GCMSPesticide\目录下的所有文件夹拷贝到D：\MassHunter\Data\目录下。此文件夹将包含我们练习所要使用的所有数据。双击QualitativeAnalysisB.06.00图标，打开MassHunter定性分析软件。系统将显示“OpenDataFile”对话框，转到文件夹D:\MassHunter\Data\GCMSPesticide打开一个全扫描的文件Pest-200-scan.D。首先，我们要确认一下“用户界面配置”是否正确（一般在首次安装时操作）。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材21.在定性分析软件的菜单栏，选择“Configuration”——“UserInterfaceConfiguration”，并按照下图配置用户界面。按“OK”键确定。2.MassHunter软件支持个性化窗口排列，并且可以保存以及调用。在定性分析软件的菜单栏，选择“Configuration”——“WindowLayouts”——“RestoreDefaultLayout”，即可恢复到默认的窗口排列方式。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材3接下来，我们先来熟悉一下MassHunter定性分析软件的主要界面及各个功能区的使用方法。以下为主要功能区简介，详细使用方法会陆续在后面的教程中讲到：1.1数据浏览器窗口这里会列出所调用的数据文件以及该数据之前定义好的结果或者方法文件所定义的结果。MassHunter软件支持数据分析结果保存。如果数据文件调用后做了相关修改，可保存修改的结果。当再次调用此文件时，即可调出上次保存的结果，无需再次执行分析操作。可以选定/取消选定某个文件或某张图的对话框，有选择的显示数据文件与相关谱图对数据文件单击右键，可选择关闭文件，保存修改结果或打印报告SortbyDatafile/Type当调用多个数据时，可以选择根据数据类型或者数据名排列顺序。数据浏览器窗口：可以勾选前面的方框来显示需要的色谱或质谱图等信息方法管理器窗口：列出了所有与方法参数相关项目质谱图结果显示窗口色谱图结果显示窗口Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材41.2方法管理器窗口这里会显示你当前调用的方法名称，以及方法数据处理的各项参数。点选方法参数，还会弹出方法编辑器窗口。这个窗口则是方法参数的详细内容，下图显示为“Integrate(MS)”，选择“Chamstation”积分器。如果有修改过的参数，会被蓝色三角标记。另外，所有其他会影响到的功能也会被标记。保存方法后，标记消失。输入的参数如果超过允许范围，会被黄色三角标记。仍显示为修改前的数值。出现错误矛盾信息，会被红色圆形标记。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材51.3色谱图结果窗口按住鼠标右键拉出一个矩形，可以放大选定谱图。点击色谱图窗口的工具栏图标可恢复满量程显示。A．要缩放X轴，请将光标移到X轴值，直到出现水平双箭头，然后按着鼠标右键，向左滑动缩小，向右滑动放大。B．要平移X轴，请将光标移到X轴值，直到出现水平双箭头，然后按着鼠标左键，向左或者右进行平移。C.单击工具栏图标，即可对X轴缩小至满量程。D.要缩放Y轴，请将光标移到Y轴值，直到出现垂直双箭头，然后按着鼠标右键，向下滑动缩小，向上滑动放大。E．要平移Y轴，请将光标移到Y轴值，直到出现垂直双箭头，然后按着鼠标左键，向上或者下进行平移。F.单击工具栏图标，即可对Y轴缩小至满量程。1.4提取色谱图点击菜单栏的“Chromatograms（色谱图）”——“ExtractChromatograms（提取色谱图）”，弹出下面窗口。在Type栏选择“TIC”，然后点击OK，即可提取总离子流图。选择“EIC”，然后在“m/zvalue(s)”方框内输入所需的质量数，如果有多个离子，质量数之间以逗号隔开，然后点击“OK”即可。提取后的色谱图，会在右侧数据导航菜单的“UserChromatograms”下显示。调节至满量程调整x或y轴至满量程放大缩小色谱图y轴相关联色谱图anchor色谱图分开/重叠放置设定同时显示的色谱图数目选择范围选择峰手动积分浏览数据点不同色谱图显示尺度Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材6点选（高亮）其中一个色谱图，然后点击“Chromatogram”——“SmoothChromatogram”，即可对色谱图进行平滑处理。平滑后的结果会显示在原色谱图的的树状目录下。如需调整平滑色谱图的参数，只需到“MethodExplorer（方法管理器）”窗口的“Chromatogram（色谱图）”，点选“Smooth”，在弹出的平滑色谱图参数窗口，进行调整。1.6色谱图积分在“MethodExplorer（方法管理器）”窗口的Chromatogram（色谱图）下，选择Integrate（MS）（积分器），弹出积分器编辑窗口如下图所示。在“Integrator（积分器）”页面的“IntegratorSelection”下拉菜单有多种积分器选择，分别为：ChemStation（化学工作站积分器，主要针对UV信号）General（即MSDChemstation里的RTE积分器）Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材7Universal（即MSDChemstation里的Chemstation积分器）MS/MS（第一代少参数积分器，针对液质信号优化过的积分器，不推荐用于SQ）MS/MS(GC)（第一代少参数积分器，针对气质信号优化过的积分器，不推荐用于SQ）Agile（默认积分器，第二代少参数积分器，推荐用于GC信号）无论是选用哪种积分器，都可以在peakfilter菜单设置一些参数，用于过滤小杂质峰。Peakheight——根据峰高进行过滤Peakarea——根据峰面积进行过滤Absolutearea绝对阈值Relativearea相对阈值（相对于面积最大的峰）Maximumnumberofpeaks(根据峰高定义最大峰数量)编辑完积分参数后，在“DataNavigator（数据浏览器）”窗口里，点击（高亮）你要进行积分的色谱图，然后点击菜单栏“Chromatograms”——“IntegrateChromatogram”对色谱图进行积分。或者点击积分参数窗口的“IntegrateChromatogram”按键，如上图红色方框，进行色谱图的积分。点击菜单栏“View（视图）”——“IntegrationPeakList（积分峰表）”，或者点击菜单栏下方的快捷按键调出已积分峰表。已积分峰表会列出保留时间、峰面积、峰高等相关信息。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材8如果需要进行手动积分，先点击色谱窗口上方的手动积分按键，然后按住鼠标右键拖选需要手动积分的峰。1.7计算色谱峰信噪比在“MethodExplorer（方法管理器）”窗口的Chromatogram（色谱图）下，选择“CalculateSignal-to-Noise（计算信噪比）”，弹出计算信噪比参数窗口，如下图。可根据需求，选择根据峰高或者峰面积进行信号的定义。噪音的定义提供了五种方式，噪音范围提供了自动选择或者指定范围两种。编辑好参数后，点选（高亮）已经进行过积分的色谱图，然后点击计算信噪比参数窗口左上角的“CalculateSignal-to-Noise”，完成信噪比计算。结算结果显示在峰表的SNR列内，如下图红色方框所示。在色谱的左上角，会显示计算的噪音结果，以及最大峰的信噪比，如下图蓝色方框所示。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材91.8提取质谱图点选“DataNavigator（数据浏览器窗口）”下的TIC图，然后点选色谱图窗口工具栏的“RangeSelect（范围选择）。在色谱图所需要提取质谱图的位置，双击鼠标右键，即可完成该时间点的质谱图提取，提取的结果显示在色谱图下方的“MSSpectrumResults（质谱图结果窗口）”内，结果名称显示在“DataNavigator”的“UserSpectra”目录下。如下图所示（提取时间点为9.352min）。如需提取某个峰或者某一时段的平均质谱图，只需按住鼠标左键，拖选这个峰或者所需的时间范围后，并在此范围内双击鼠标左键，即可完成提取。如下图所示（提取范围为17.694-18.941min）：Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材10在质谱结果窗口单击鼠标右键，选择“MSPeakList1（质谱峰表1）”，即可在质谱结果窗口的右侧看到质谱峰表，表内详细列出各离子峰的丰度以及相对丰度。1.9实时色谱图点选色谱图结果窗口工具栏的WorkChromatogram（实时色谱图）按键，然后点击色谱图任意位置，即可预览该时间点的质谱图结果，质谱结果显示在SpectrumPreview（质谱预览）窗口，同时，MSPeaksOne（质谱峰表1）也会显示对应的峰结果。按键盘的“←”或者“→”即可移动光标，预览前一个或者后一个时间点的质谱图。实时色谱图所看到的质谱结果只是预览，不会保存到数据里面，如需保存，只需在SpectrumPreview（质谱结果预览）窗口单击右键，选择CopytoUserSpectra（复制到质谱结果）即可。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材111.10质谱图背景扣除按照提取质谱图的操作，首先选择（高亮）TIC图，然后点选色谱图结果窗口工具栏的RangeSelect（范围选择），在基线位置按住鼠标左键拖选一段谱图，然后单击鼠标右键，选择ExtractMSSpectrumtoBackground（提取质谱图到背景）即可。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材12在DataNavigator（数据浏览器）窗口，该数据的BackgroundSpectra目录下，就会显示你所提取的背景质谱图数据，同时，MSSpectrumResults（质谱图结果）窗口显示平均质谱图结果，如下图所示。在DataNavigator（数据浏览器）窗口点选选择之前提取的质谱信号，然后单击鼠标右键，选择SubtractBackgroundSpectrum（背景扣除），即可得到背景扣除后的质谱数据。Agilent5977MSDMassHunter数据分析现场培训教材131.11谱库检索在MethodExplorer（方法管理器）窗口，选择IdentifyCompounds（查找化合物）下的SearchUnitMassLibrary（搜索化合物谱库），弹出的参数编辑窗口选择LibrarySearch（谱库检索）页面，点击AddLibrary（添加谱库），然后选择一个或者多个合适的谱库，如Nist08.l。定义好谱库后，点选（高亮）需要进行检索的质谱图，然后单击鼠标右键，选择Sear