pH与pka的计算

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关于pKa寇朝卫2013.09.24Mainlyfrom(美)克恩斯,邸力著;钟大放等译.类药性质:概念、结构设计与方法从ADME到安全性优化.科学出版社,2011.01.摘要1pKa显示一种化合物的离子化能力。离子化能力是决定溶解度和渗透性的主要因素。2当pH=pKa时,溶液中离子化分子与中性分子浓度相同。3随着pKa增加,碱性化合物的碱性增强;酸性化合物的酸性则随着pKa降低对于2如电离方程式为HA→H(+)+A(-),则电离常数Ka=[H+]*[A-]/[HA]pKa=-log(Ka)那么pH与pKa的关系是:pKa=PH值+log(未解离浓度/已解离浓度)From论坛=5033如右图所示绝大部分化合都含有可离子化基团(图6.1)。大部分呈碱性,一些呈酸性,仅5%不能离子化。pKa显示一种化合物的离子化能力,它是分子中基团的酸性或碱性的函数。化学家通过修饰化合物骨架的酸性或碱性亚结构以获得理想的pKa从而改变其溶解度和渗透性。目录1pKa的基本原理2pKa的影响3影响有机物pKa的因素4pKa案例研究5针对pKa的结构修饰策略1pKa的基本原理当pH=pKa时,溶液中离子化分子与中性分子浓度相同。随着pKa增加,碱性化合物的碱性增强;酸性化合物的酸性则随着pKa降低2pKa的影响在水溶液中,离子化分子比中性分子的溶解度高,原因在于离子的极性更强。溶解度包括中性分子的固有溶解度和离子形式的溶度,且后者远高于前者。与此相反,离子化分子的渗透性比中性分子低。中性分子比离子化分子的亲脂性高得多,以被动扩散方式完成的渗透主要是通过中性分子形式。由于pKa决定了离子化程度,所以它对溶解度和渗透性均有很大影响,从而会影响水中污染物质的膜吸收。离子化效应显示了膜处理中经常遇到的一种关联性:渗透性高的化合物通常溶解度低,反之亦然。因为离子化对这两种性质有着相反的影响,因此需要在溶解度和渗透性之问进行权衡。pKa也影响某些结构系列的活性,据推测,这与靶蛋白活性位点的相互作用发生改变有关。3影响有机物pKa的因素•物质的pKa值受分子外部因素和内部因素的影响。外部因素包括溶剂环境(溶剂极性、离子强度等)和温度;内部因素则是指分子组成及结构带来的诱导效应、场效应、共振效应、氢键影响、立体效应以及杂化作用等。这里重点讨论分子组成及结构对物质pKa值的影响。From戴猷元,秦炜,张瑾等编著.有机物络合萃取化学.化学工业出社,2008.5.(1)诱导效应吸电子基,如卤素,能使H~A键减弱,并能稳定阴离子,从而使酸性强,pKa减小。当分子中吸电子取代基数目增加时,诱导效应也增强,分子的酸性增强。供电子基,如烷基、氨基,能增强H—A键,从而增加对质子的亲和力,这将使碱性增加,pKa增大。(2)场效应场效应是通过空间而不是通过成键起作用的电子效应。对于多数分子来说,区分诱导效应和场效应是很不容易的,因为二者时常同时作用,而且对物质酸性强弱的影响是一致的。一般常把诱导效应和场效应合并考虑,当作为“极性效应”。(3)共振效应官能团,如p—NO2,通过减弱O—H键并使阴离子稳定,可使苯甲酸或苯酚的酸性增加;官能团,如—NH2,通过共振提供电子,因此,会增强O—H键,促进阴离子和质子的结合,所以,酸性会相应减弱。(4)氢键在分子内部形成氢键能够在很大程度上影响酸性的强弱。例如:邻羟基苯甲酸由于—OH和—COOH间形成了氢键,电荷离域化,稳定性增强,结果增大了分子的酸性。(5)立体效应由于质子较小,质子酸—碱反应对立体压缩不太敏感。然而,具有较多分支的酸,其阴离子会由于较小的溶剂化程度变得不太稳定,导致酸性减弱。From戴猷元,秦炜,张瑾等编著.有机物络合萃取化学.化学工业出社,2008.5.4pKa案例研究•图6.4显示了pKa和分子大小对一个结构系列化合物活性影响的例子。哌啶的pKa约为10,脂肪族基团的修饰对其pKa几乎没有影响。当修饰基团逐渐增大时,似乎会引起部分失活。虽然芳香环与其他修饰基团对于化合物体积的改变基本一致;然而,当引入芳香环后,胺的碱性大幅下降,从而导致其活性远低于预期。IC50是指被抑制一半时抑制剂的浓度,该浓度称为50%抑制浓度,即凋亡细胞与全部细胞数之比等于50%时所对应的浓度。IC50值可以用来衡量化合物诱导凋亡的能力,即诱导能力越强,该数值越低,当然也可以反向说明某种细胞对药物的耐受程度。4针对pKa的结构修饰策略•当计划通过合成修饰改善一种结构系列化合物的水溶性或渗透性时,可选择多种亚结构。但必须记得,提高溶解度的结构修饰也将会降低化合物的渗透性。•根据预期效果不同,可通过引入或除去供电子和吸电子基团,以提高酸性或碱性化合物的电子密度。例如,可在α位引入卤素或其他吸电子基团(例如羧基、氰基、硝基)提高酸性化合物的酸性,但引人脂肪基团则影响很小。除去吸电子基团后,可降低其酸性强度。•引入芳香基可降低碱性化合物的碱性强度(例如苯胺)。孤电子对离域后,与芳香环形成共轭体系。引入脂肪基团后,碱性也会小幅降低。由于甲氧基可提供电子,引入该基团后能提高苯胺的碱性;若引入吸电子的硝基,则苯胺的碱性下降。

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