KNIME用法说明

KNIME用法说明——刘春玲、王斌、王璐、谢冬、周莲子（按学号顺序）引注：使用说明包括三个部分：KNIME—构建CBR完整模型、聚类——K-D树存储和检索优化、Adaboost——决策树推理RBR，在使用knime之前先进行knime升级weka功能模块，具体操作：file—updateknime—availablesoftware，在搜索栏里输入weka安装完成重新启动knime，完成升级。KNIME—构建CBR完整模型一、新建KNIME文件单击菜单栏File里的New之后出现如下对话框：选择NewKNIMEProject，并按下Next键，之后点击Finish即可完成新文档的创建。二、K-D树的生成与准确度判断1.布局1）查找filereader，其结果如下图所示：2）分别拖两个filereader出来。3）将IBK拖出来。并将其中的一个filereader与IBK连接起来。4）拖一个WekaPredictor出来并与IBK和另一个filereader连接起来。5）将Scorer与WekaPredictor连接起来。其具体的布局和连接情况如下图所示：2.导入数据右击第一个FileReader，选择Configure（或直接双击进入），在ValidURL处选择要导入的数据的文件。之后点击OK就完成了数据的导入。3.生成K-D树右击IBK，点击Configure，可以改变KNN的数值，从而改变精度。改distanceweighting（距离权重）的值为weightby1-distance，之后点击nearestneighbourSearchAlgorithm后面的choose，选择KDTree，点击OK。4.导入新的数据其方法与参照步骤2中导入数据的过程5.模型运行与验证1）将来自FileReader2的数据和来自IBK的K-D树模型输入到WekaPredictor中。注：当发现设置完的结点没有变成绿灯时要及时按下按钮来执行所有的结点。2）设置scorer的属性右击后点击Configure,firstcolumn选择要预测的属性；secondcolumn选择winner.6．查看结果右击后点击accuracystatistics来查看预测的结果。聚类——K-D树存储和检索优化1．布局与数据导入1）先打开knime，再新建（new）一个工程（project）。2）先拖一个filereader到工作区，右击选择configure，设置成下图形式：3）再拖入一个k-means（依次mining—clustering---k-means），filereader连接k-means4）拖入一个interactivetable（data—views—interactivetable），k-means连接interactivetable。5）再拖入一个filereader，右击选择configure，设置成下图形式：6）再拖入一个聚类器clusterassigner（三个下拉菜单里存在聚类器，这里选择mining—clustering---clusterassigner）7）最终使工作区变成如下形式：2、模型测试与运行1）点击，运行，观察各node的运行结果。2）右击k-means，选择“0labeledinput”，可观察到如下结果：3）、右击k-means，选择“view：clusterview”，可观察到如下结果注：在interactivetable的“view：clusterview”中也可观察到相应结果，结果如下图4、再右击clusterassigner，选择“0assigneddata”，可得到如下结果：Adaboost——决策树推理RBR用Adaboost对数据进行训练并得到规则，并用此规则对新数据进行预测1.布局与数据导入1）数据源的选取先查找到FileReader，然后将其拖出。共拖两个，分别代表用来进行训练的数据和用来预测的数据。2）找出Adaboost，将其拖出3）将Wekapredictor和Scorer，Interactivetable拖出，形成如下图所示。4）开始进行设置。在第一个FileReader上点击右键，选择Configure，出现如下图所示：点击“Browse…”，选择数据源。本例中是选取经过粗糙集处理的241例病例的数据。5）同理，将第二个FileReader的数据源设置为经过粗糙集处理的61例病例的数据。如下图：2.参数设置1）对Adaboost进行设置，在Adaboost上点击右键，选择Configure，出现如下图所示其中，numIterations一项指的是将多少个分类器累加，即迭代多少次。不同的迭代次数会使最后的准确度不同，次数过少会训练不足，次数太多会训练过度，都不会得到最好的结果，需要多次试数。使最后的准确度最高的迭代次数，就是最合理的迭代次数。2）对Scorer进行设置，在Scorer上点击右键，选择Configure，出现如下图所示将进行比较的两列设为如图所示。即为，将患者实际的是否患病的情况（class）与用训练出的规则预测的情况（winner）进行比较，在Wekapreictor上点击右键，选择0ClassifiedTestData，即可观察比较情况：如上图，若判断情况相同，则准确度高；反之，则准确度低。3.运行与测试设置完成，即可开始运行如上图，点击最上面一行的即可运行，当所有控件下部都显示绿灯时，运行即结束。如下图所示4、观察预测结果与分析在Scorer上点击右键，选择0Confusionmatrix或1AccuracyStatistics，即可观察预测结果（或在InteractiveTable中也能观察），如下图所示图中数据意为：实际为Yes的案例一共有20个，但预测结果是11个No，9个Yes；实际为No的案例一共有41个，但实际预测结果是39个No，2个Yes如上图所示，规则预测准确率为78.7%，这是在迭代次数为55时的结果。大家也可以试试变化迭代次数后准确率是否会提高。5.模型验证——回归检验上例中，如果将第二个FileReader的数据也换成241例的数据，则会发现最后结果准确率非常高。这是因为规则就是用这241的数据训练出来的，反过来用这个规则来预测自己本身，自然准确率就会很高。如下图所示：