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医学文献检索与论文写作第一部分：医学文献检索文献的定义文献（document,literature）是指以文字、图像、公式、声频、视频、代码等手段将信息、知识记录或描述在一定的物质载体上，并能起到存储和传播信息情报和知识作用的一切载体。实例1：南方医院曾经有位老主任，为了“通过测定羊水中氨基酸成分鉴别胎儿性别”的课题，查遍了图书馆收藏的所有书刊而一无所获。原因：没有学习过文献检索，不知道查文献也有一套科学的方法。文献检索的重要性实例2：美国一钢厂欲改良一种炼钢工艺，花100000美元用1年时间，研究成功。该厂图书室工作人员说，只需5美元就可以复制一份该工艺的现成文献。原因：研究人员事先没有对文献进行检索，不知道别人已经做过什么研究。图书80万种/每年科技期刊15万种/每年专利说明书100万件/每年会议论文10万篇/每年第一节文献的基本知识按载体形式分：印刷型：图书；期刊；资料缩微型：视听型电子型1.文献的类型根据内容性质及加工深度分：一次文献；二次文献；三次文献；零次文献。一次文献定义：未经加工的原始文献范畴：期刊论文、专利文献、技术标准、科技报告、会议论文、学位论文特点：内容先进、成熟；叙述具体、详尽和系统；数量庞大分散功能：学习、研究的最基本文献类型，也是最主要的文献情报源，二次、三次文献产生的基础。二次文献定义：将分散的无组织的一次文献进行加工、压缩、提炼、简化、整理的产物。即检索工具。范畴：书目、索引、文摘、题录、简介特点：汇集性、工具性、综合性、系统性功能：检索、通报、控制一次文献，用于查找一次文献的线索。三次文献定义：利用二次文献为基础，选用大量一次文献经过综合、分析撰写的。范畴：综述研究、参考工具、文献指南特点：内容更集中、针对性更强、具有参考性和指引性功能：情报调研的结果零次文献记录在非正规载体上的、未经任何加工处理的源信息叫做零次信息，比如书信、论文手稿、笔记、实验记录、会议记录等，这是一种零星的、分散的和无规则的信息。或者尚未形成的文字材料或知识，即非出版物，如经验、设想、感想等。零次信息的载体形式就称之为零次文献，这是近20年来被逐步认识和重视的一类文献，它具有原始性、新颖性、分散性和非检索性等特征。2.常用文献检索布尔逻辑算符逻辑“与”and/*检索式“AandB”表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。如：查找“胰岛素治疗糖尿病”的检索式为insulin(胰岛素)anddiabetes（糖尿病）。AANDB逻辑“非”NOT/-检索式“AnotB”表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。如：查“动物的乙肝病毒（不要人的）”的文献的检索式为hepatitisBvirus（乙肝病毒）nothuman（人类）。ANOTB缩小检索：缩小检索是指开始的检索范围太大，命中文献太多，或查准率太低，需要增加查准率的一个方法。•缩检的方法：增加检索词用AND组配；选择专指性检索词；增加副主题词；使用主要主题词的加权检索；增加限定检索；从文献中选择合适的检索词等。逻辑“或”OR/+检索式“AorB”表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。如：查找“肿瘤”的检索式为cancer（癌）ortumor（瘤）orcarcinoma（癌）。AORB扩展检索：扩展检索是指初始设定的检索范围太小，命中文献不多，需要扩大检索范围的方法。•扩检的方法：增加同义词用OR组配；使用上位词扩大检索范围；使用截词符或通配符；减少检索的字段限定；从文献中选择合适的检索词。邻近度算符With检索式“AwithB”表示检索词A和检索词B不仅要同时出现在一条记录中，还要同时出现在一个字段里的文献才是命中文献。如：“drugwithabuse”检索出的是同一个字段中同时出现这两个词的记录。3.引文检索工具SCI简介ScienceCitationIndex（SCI）美国《科学引文索引》(SCI)由美国费城科学情报研究所(ISI)在1963年创刊。创办人为加菲尔德(Garfield)。是目前国际上公认的最具权威的科技文献检索工具之一。期刊的影响因子(Impactfactor，IF)：某期刊前两年发表的论文在统计当年的被引用总次数除以该期刊在前两年内发表的论文总数。这是一个国际上通行的期刊评价指标。影响因子是以年为单位进行计算的。计算公式：以2010年的某一期刊影响因子为例，IF（2010年）=A/B其中，A=该期刊2008年至2009年所有文章在2010年中被引用的次数；B=该期刊2008年至2009年所有文章数。2013年Top20中的17个杂志仍然排在2014年的Top20中。经典名牌杂志的影响因子继续保持稳中有升态势。2014年其中CA-ACancerJournalforClinicians，以影响因子101.780，独占鳌头；NewEnglandJournalofMedicine以53.298的影响因子，位居第二；Lancet杂志的影响因子为38.278；另外CNS三大杂志的影响因子分别是，Cell：32.403；Nature：36.280；Science：31.201。中国出版的期刊杂志有114个被SCI索引，其中23个期刊影响因子超过1，影响因子超过2的有9个，影响因子超过3的期刊有CellResearch（IF=8.19）,JournalofMolecularCellBiology：7.667，NanoResearch：6.97，MolecularPlant：5.546，FungalDiversity：4.769，Cellular&MolecularImmunology：2.992，WorldJournalofGastroenterology：2.471。4.1检索语言检索语言，又称文献存储与检索语言、索引语言、标引语言等，是信息检索系统存贮与检索共同遵循的一种专用语言。4.文献检索系统检索语言的分类描述文献信息外部特征的检索语言(1)著者索引(2)题名索引(3)文献序号索引(4)引文索引主题词指能代表文献内容实质的经过严格规范化的专业名词术语或词组，其特点是具有唯一性，多个相同概念、名词术语、同义词等在索引中只能用唯一一个术语表达，使内容相同或相近的文献更加集中、更具有专指性，避免同义词的多次检索。26《医学主题词表》(MedicalSubjectHeadings,MeSh)是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。以它作为生物医学标引的依据，编制《医学索引》（IndexMedicus）及监理计算机文献联机检索系统MEDLINE数据库。《MeSH》汇集约18,000多个医学主题词。关键词指从文献中抽出来的、有实质内容的、未经或略经规范化了的名词术语以及增添的相关概念词，它属于自然语言范畴。检索工具的类型（1）目录（catalogue）检索工具（2）索引（index）检索工具（3）文摘（abstract）检索工具（4）全文（Full-text）检索工具4.2文献检索途径1．篇名途径6．关键词途径2．著者途径7．分类途径3．著者地址8．序号途径4．刊名途径9．其它途径5．主题词途径举例：著者途径使用著者途径应注意.书写格式姓前（全称）、名后（缩写，即用首字母）WillianHenryHarrison→HarrisonWH.中国人著者-按汉语拼音著录；5.1文献检索步骤1．分析检索课题，明确检索要求2．选择检索工具，确定检索方法3．选择检索途径，确定检索标识4．检索文献5．获取原始文献5.文献检索步骤5.2文献检索效果评价查全率与查准率的概念查全率是指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量与系统文献库中相关文献总量的比率。查准率是指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量与检出文献总量的比率。二者互逆关系。影响查全率的因素从文献存储来看，主要因素：文献库收录文献不全；索引词汇缺乏控制和专指性；词表结构不完整；词间关系模糊或不正确；标引不详；标引前后不一致；标引人员遗漏了原文的重要概念或用词不当等。检索策略过于简单；选词和进行逻辑组配不当；检索途径和方法太少；检索人员业务不熟练和缺乏耐心；检索系统不具备截词功能和反馈功能，检索时不能全面地描述检索要求等。影响查准率的因素索引词不能准确描述文献主题和检索要求；组配规则不严密；选词及词间关系不正确；标引过于详尽；组配错误；检索时所用检索词（或检索式）专指度不够，检索面宽于检索要求；检索系统不具备逻辑“非”功能和反馈功能；检索式中允许容纳的词数量有限；截词部位不当，检索式中使用逻辑“或”不当等等。▲根据检索目的和要求，确定检索的学科范围、文献类型、回溯年限、语种；▲选择检索手段和检索系统；▲确定检索途径，注意各种检索途径的配合使用；▲确定检索标识，正确使用各种运算符，编制检索提问式；▲检索过程方案调整，通过上下位词的选择和逻辑算符的应用，可进行扩大或缩小检索范围，使检出的结果符合要求。6.检索策略○记录文献线索○掌握各种缩写的还原○向著者索取○利用馆藏目录、公共查询系统、联合目录○利用网上全文传递服务○检索网上全文数据库○利用网上出版社、杂志7.索取原文8.文献的利用先读标题，再读摘要，决定是否对你有用。略读：了解材料的目录、大意、写作意图。略读以后，要作出初步判断，做上记号。速读：全面地、不加删减地读完材料全文，通过速读把材料分为三类：①有一般参考价值或有待斟酌的；②值得引用、内容精辟、观点新颖的；③没有参考价值或观点前后矛盾的。精读：挑选最相关、最好的文章进行精读，通读10篇不如精读1篇。第二节介绍5个常用医学文献数据库掌握3个中文数据库、2个外文数据库检索技巧1.中国期刊全文数据库（CNKI数据库）；2.中文科技期刊全文数据库（重庆维普）；3.万方数据库(北京万方)；4.Pubmed;5.ElsevierSDOL或者springer数据库。中国知识基础设施建成了世界上全文信息量规模最大的“CNKI数字图书馆”，并启动建设《中国知识资源总库》及CNKI网格资源共享平台，包括源数据库（如中国期刊全文数据库等）和专业知识仓库（如中国医院知识仓库等）。中国期刊全文数据库是目前世界上最大的连续动态更新的中国期刊全文数据库，收录1994年至今（部分刊物回溯至创刊）国内8200多种综合期刊与专业特色期刊的全文，全文文献总量2200多万篇。1.中国期刊全文数据库（CNKI数据库）点击某一个数据库名称即进入某一数据库检索页，进行检索①选择查询范围篇名、关键词、摘要中文篇名、英文篇名中文关键词、英文关键词、机标关键词中文摘要、英文摘要②选择检索项作者中文名、作者汉语拼音名、作者英文名中文刊名、英文刊名利用联想、比较、判断、推理、学习等手段，综合考查文献的内容和外部属性特征与检索词的相关性，对检索结果进行内容排序后再输出的检索结果以2位字符表示如:01,表示第1期增刊以“s”表示，如:s1,表示增刊1直接以分类号检索，如：B82以ISSN原有形式进行检索，如：1000-2871检索方式点击减少一逻辑检索行。点击减少一逻辑检索行点击增加一逻辑检索行③输入检索词将弹出一个窗口，显示以输入词为中心的相关词。相关词可以三种方式自动增加检索词或替代原输入词：单词自动增加、多词自动增加、相关词取代原输入词。指检索词在相应检索项内容中出现的次数，可从下拉列表中选择。词频为空，表示至少出现1次，如果为数字，例如3，则表示至少出现3次，以此类推最近词系统记录本次登录最近输入并进行检索操作过的10个检索词。当进行了多次检索操作而又未能得出最满意的检索结果时，可点击图标，在弹出窗口上所列出的检索词中选择，点击您所需要的检索词，则该检索词自动进入检索框中。逻辑与（并且）、逻辑或（或者）、逻辑非（不包含）。并且”、“或者”、“不包含”的优先级相同，即按先后顺序进行组合逻辑关系表示示例含义逻辑与并且A并且B包含A和B逻辑或或者A或者B包含A或者包含B逻辑非不包含A不