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哈尔滨医科大学解鸿波DiscoveryStudioVisualizer精简教程PDB:3K9F工具导航栏工具栏主窗口Ctrl+HCtrl+T氨基酸残基氨基酸相应性质Ctrl+D编辑原子线型显示棍型显示球棍显示必须先选择原子编辑蛋白线型显示棍型显示线型条带必须先选择原子条带改变背景颜色ViewToolbarsViewViewToolbarsSketching旋转放大缩小平移区域选择画分子工具（不推荐使用）蛋白（或DNA等大分子）配体分子其他分子例如水等按字母顺序排列*不同部分字母重新循环代表晶格PDB编号侧链编号点加号+查看侧链所含有氨基酸残基氨基酸及编号点加号+查看氨基酸所含有原子去除对勾表示隐藏1.仅显示配体分子，并双击选中，分子显示为黄色。显示配体和周围形成的氢键作用2.StructureMonitorHBonds3.显示和配体可以形成氢键的氨基酸序号及相应原子将氨基酸以棍状形态显示，Sticksize调整为0.10和配体以示区别，并不显示其带状二级结构默认氢键为绿色选中分子，查看其他相互作用ToolsAnalyzeComplexesShow2DDiagram选中分子，给分子增加表面StructureSurfaceAddStructureMonitorDistance选中两个原子，测距离单位为（Å）StructureMonitorTorsion选中两根化学键，测角度查看蛋白序列查看蛋白拉氏图ChartRamachandranPlot选择原子右键Attributesof…查看原子坐标BuildandEditNucleicAcid工具BuildandEditProtein工具（不是蛋白三维结构，需要做从头预测）CreatePharmacophoreManully工具（根据已知分子构建药效团，但不实用）写字板打开*.pdb文件查看信息，内附原子坐标，原子类型及氨基酸序号等信息。HIV-1蛋白酶PDBcode:3OXC沙奎那韦（Saquinavir）No.1索拉菲尼（Sorafenib）p38MAP激酶PDBcode:3GCSNo.2氟伐他汀（Fluvastatin）HMG-CoA还原酶PDBcode:1HWINo.3神经氨酸酶PDBcode:4KS1达菲（Tamiflu）No.4青霉素结合蛋白PDBCode:3ITA氨苄西林（Ampicillin）No.5