动力学计算步骤:一、构造分子1:File-new-3Datomisticdocument-重命名2:构建分子-右键改Displaystyle-adjusthydrogen加氢-clean3:优化分子-moduces-forcite-calculation-几何优化more里面可以改参数-改任务名称-Run二、构建晶胞点开优化好的分子-modules-amorphouscell-construction-添加指定分子-改number,密度,numberofconfigurations调成1-setup-forcefield-compass-Construct三、使分子有序排列,构建超级晶胞先构建一个分子的晶胞-bulid-symmetry–supercell-扩大a,b-保存四、将不同晶胞合并将两个晶胞的参数改成一样后,Bulid-bulidlayer-打开所选晶胞-layerdetails调节方向-bulid五、动力学模拟计算第一步:Forcite-calculation-dynamic-more-NVT,numberofsteps和flameoutputevery一样;温度Anderen;Energy中forcefield选择compass-Run。第二步:Forcite-calculation-dynamic-more-NPT,压力选择0.0001Gpa(常压),numberofsteps和flameoutputevery一样;thermostat选择Anderen;barostat选择Berendsen;Energy中forcefield选择compass-Run六、分析参数Modules-forcite-analysis1:径向分布。2:密度分布。