数量性状标记辅助育种原理数量性状基因座QTL

现代分子生物技术在优质肉鸡育种中的应用朱庆（四川农业大学教授、博导）常规育种技术表现型外观生长发育产蛋性能数量遗传分析纯繁杂交新品种选育本身成绩同胞成绩后裔成绩分子生物技术基因型分子标记基因定位性状连锁辅助选择分子标记辅助育种分子遗传标记－DNA标记特点：•数量大•遗传稳定，不受环境影响•呈等显性或完全显性标记：RFLP,RAPD,VNTR,AFLP,mtDNA等可直接选择基因型呈等显性，可将杂合子与纯合子区分可在两种性别任何年龄的个体检测早期选择，加快选育进展可阐明家系内遗传变异对限性性状和年龄限性性状最为有利标记辅助选择的意义家禽经济性状－数量性状标记辅助育种原理数量性状基因座（QTL）QTL图谱分析遗传图谱构建基因定位分子标记技术路线：寻找QTL的染色体片断标定QTL位置找到与QTL连锁的标记寻找候选基因与性状相关的特定基因特定基因的功能位点标记辅助选择Southern杂交利用载体基因文库阳性克隆选择引物作序列分析微卫星DNA探针（CA）nPAGE检测PCR扩增•微卫星检测：•标记性状相关分析：分子标记（标记基因座分析）基因型（最小二乘分析）性状（方差分析检验）相关分析•功能基因定位克隆：确定基因在染色体上的大致位置（家系连锁分析资料）获得目的基因DNA片段突变检测验证和功能分析（染色体步移等技术）绘制染色体图谱（筛选目的基因）确定含有候选基因的染色体片段种染色体数连锁图上的遗传标记总数微卫星标记数物理图上基因数连锁群数基因组大小(cM)覆盖比例(%)牛(Cattle)2n602100150060831290095绵羊(Sheep)2n54104089510527340095山羊(Goat)2n60337307202274088猪(Pig)2n381800140040019220095马(Horse)2n6424020010/20*19/25*936/679*鸡（Chicken）2n78172780019151380095人(Humans)2n46小鼠(Mouse)2n402647010487211450100鼠（Rat）2n4290001300212000100狗（Dog）2n7821020041鹿（Deer）2n682306616434几种重要畜禽种和人类及家鼠基因组有关数据家禽染色体标记图谱——优质鸡肉质性状选育举例说明根据研究报道，从家禽基因组中选取与肉质性状相关的标记根据标记序列进行引物设计采集血样进行PCR扩增家禽个体肉质性能测定对PCR产物进行电泳检测标记与性状相关分析肉质功能基因QTL定位利用标记进行性状选择利用分子标记研究：地方鸡种遗传变异及遗传多样性研究标记与产蛋性能及蛋品质等相关研究标记与生长发育及料肉比等相关研究前期研究进展各分子标记星座位上各等位基因的基因频率在不同的群体间有比较明显的差异，出现一些特定的等位基因。不同分子标记座位所反映的群体杂合度具有较大的差异，具有较大选育潜力。四川不同地方鸡种群有较大遗传差异，表现出不同的遗传距离。研究表明：00.20.40.60.81.01.2HFBFCKLKSHSCHF0.28971.18220.87000.71350.44620.2897图1不同鸡种群聚类模式图（数字表示相对遗传距离）四川不同鸡种群遗传聚类分析肉用性状：体重、日增重、相对－绝对增重、屠宰性能、料肉比等蛋用性状：开产日龄、开产蛋重、开产体重、300日龄产蛋量，月产蛋量、蛋品质性状等与性状相关的分子标记分子标记PCR产物检测（自动序列分析）建立资源群体性状组合、配合力测定常规育种方法分子生物技术特色突出、性能优良形成配套新品系、建立商业育种体系