NMDS分析过程

PCORD5：NonmetricMultidimensionalscaling(NMDS)以微量热指标数据为例1.数据输入格式其中，Number指的是土样个数；Species指测定指标；Excel文件格式为.xls(因为PCORD5只识别这个格式)。2.安装并打开PCORD5软件软件界面：导入数据：File—ImportMatrix—MainMatrix我们文件类型是Excel所以就选择ExcelSpreadsheet选项，点击OK。选择所需要的文件。3.数据分析Ordination菜单栏—NMS/NMDS选项。Autopilot：三种模式，根据需要选择模式。DistanceMeasure：根据数据选择合适的方法常用的是Sorensen（Bray-Curtis）、RelativeSorensen、RelativeEuclidean不用修改点击OK。4.结果输出5.作图（1）（2）二维图结果（3）Statistics——correlationswithMainMatrix，点击OK。（4）Statistics——PercentofVarianceInDistanceMatrix。点击OK。Origin8作散点图：由于PCORD5做出来的图不好修改，所以将数据拷贝出来用Origin8来做图。