1SciFinderWeb使用介绍朱传娴2011.12.142提纲•介绍–SciFinder中的内容–SciFinder的注册和登陆•SciFinder中的检索和后处理–SciFinder中的文献检索–SciFinder中的物质检索–SciFinder中的Markush检索–SciFinder中的反应检索–SciPlanner在路线设计中的应用•SciFinder网络资源平台美国化学文摘社—ChemicalAbstractService•创建于1907年•ACS的分支机构•密切关注,索引和提炼着全球化学相关的文献和专利•最早创立了《化学文摘》•总部坐落于俄亥俄州的哥伦布市3SciFinder中的内容4期刊专利论文会议报告溶剂,催化剂,产率等物质基因合成信息CAPlusMedlineRegistryCASReactChemcatsChemlistSciFinder中的内容—文献数据库CAPlus(Pre1907-)覆盖化学相关众多学科领域的参考文献。3200万条文献信息。上万种期刊和61个专利发行机构的专利(含专利族)。会议录、技术报告、图书、学位论文、评论、会议摘要日更新3000条以上的记录Medline美国国立医学图书馆出品生命科学医学相关毒理,病理学报告期刊、临床报告SciFinder中的内容—反应数据库66CASReact(1840-)源自期刊,专利中有机、有机金属、无机、生化反应。2900万单步,多步反应。1300万制备信息周更新。SciFinder中的内容—物质数据库Registry(Pre1957-)世界上最大的物质数据库5400万个物质;6200万个序列无机物、有机物、聚合物、混合物、合金、核酸蛋白质序列等所有具有CASNo物质日更新4000多个物质ChemList查询备案/管控化学信息的工具。Chemcats4000万化学物质提供商的联系信息包含价格情况、运送方式、质量等级等信息。8提纲•介绍–SciFinder中的内容–SciFinder的注册和登陆•SciFinder中的检索和后处理–SciFinder中的文献检索–SciFinder中的物质检索–SciFinder中的Markush检索–SciFinder中的反应检索–SciPlanner在路线设计中的应用•SciFinder网络资源平台SciFinder的注册和登陆9SciFinderWeb的系统要求:Windows用户支持IE8.x或FireFox2.xMac用户支持Firefox和SafariJava安装(初次使用结构时自动安装)在图书馆相关页面上找到SciFinderWeb注册用的网址点击URL创建SciFinder账号10开始创建SciFinder帐号每个用户必须输入各自信息11设置用户名及密码注意事项12用户名:必须是唯一的,且包含5-15个字符。它可以只包含字母或字母组合、数字和/或以下特殊字符:•-(破折号)•_(下划线)•.(句点)•@(表示“at”的符号)密码:必须包含7-15个字符,并且至少包含三个以下字符:•字母•混合的大小写字母•数字•非字母数字的字符(例如@、#、%、&、*)IP地址:必须通过固定IP地址进行注册对新ID的Email确认13需要点击邮件中的确认链接使用这个链接登陆SciFinder14登陆界面15输入SciFinder帐号和密码SciFinder登陆后主界面16文献,物质,反应检索入口,默认开始检索文献可用的检索方法保存过的结果集邮件提醒结果集不使用的情况下,请退出17提纲•介绍–SciFinder中的内容–SciFinder的注册和登陆•SciFinder中的检索和后处理–SciFinder中的文献检索–SciFinder中的物质检索–SciFinder中的Markush检索–SciFinder中的反应检索–SciPlanner在路线设计中的应用•SciFinder网络资源平台SciFinder中的文献检索18非晶硅太阳能电池研究amorphoussiliconwithsolarbattery使用介词来连接关键词,点击Search提前限定出版年限、文献类型等主题检索的候选项19“Concept”表示做了同意词的扩展“Closelyassociatedwithoneanother”表示同时出现在一个句子中“werepresentanywhereinthereference”表示同时出现在一段话中如何在大量文献中寻找所需信息?20文献的分析工具21IndexTerm——索引词分析IndexTerm帮助分析文献中重要的概念22AuthorName了解行业专家Company-Organization了解行业的核心机构JournalName了解行业的主要刊物SciFinder分析工具—PublicationYear23依据出版年限排序了解近年来发展趋势0501001502002503003504004502000200120022003200420052006200720082009201024如何获得课题相关的综述文献?Refine限定工具通过综述快速了解课题的发展背景CitingReferences-----获得最有参考价值的文献2526历史导航——返回原先的检索界面Categorize----系统分析工具Categorize系统分析工具27一级目录二级目录二级目录相关的IndexTerm这里可以选择感兴趣的内容,用于文献的筛选28查看文献详细信息29题录信息重要概念索引物质索引摘要信息30结果的保存使用Export将结果输出Citationmanager:保存成RIS格式,用于导入EndNote等文献管理工具OfflineReview:保存过成PDF,RTF格式,用于脱机浏览文献检索小结主题检索时,使用介词作为连接尽量选择包含Concept和ClosedAssociatedwith的候选项通过SciFinder的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围尝试将不同的Analyze/Refine功能组合起来用,会有更多的收益使用Categorize可以让系统来实现自动分类•更多细节化内容,请参考•提纲•介绍–SciFinder中的内容–SciFinder的注册和登陆•SciFinder中的检索和后处理–SciFinder中的文献检索–SciFinder中的物质检索–SciFinder中的Markush检索–SciFinder中的反应检索–SciPlanner在路线设计中的应用•SciFinder网络资源平台SciFinder中的物质检索33物质名称检索举例:双酚A(bisphenolA;BPA)这里可以通过输入物质的名称,CA号,俗名,商品名,来进行检索SciFinder中的物质记录34在SciFinder中,鼠标滑过物质,可以打开物质的标准菜单,通过标准菜单,可以获得和物质有关的所有内容SubstanceDetail获得和物质有关的所有信息35双酚A的CAS号、分子式、结构式、化学名、别名按照CASRole分类的专利、非专利文献列表。对某类文献感兴趣,仅需点击交叉处的即可方便快捷地获取。预测数据和实验数据36实验数据,可以看到原始文献对应的链接实验谱图信息37点击,直接查看物质的实验谱图信息SciFinder中的结构检索38点击画图版来进行结构输入,初次使用时需要安装Java插件SciFinder结构绘制工具重复基团工具铅笔元素周期表可变基团碳链工具选择工具旋转工具环锁定工具正电子橡皮常用基团R基团定义工具可变位置连接工具模版工具原子锁定工具镜面旋转工具负电子索套选择工具常见环,多元环工具C原子和单键恢复工具结构检索选择单双键,RS构型,不确定键定义工具结构和反应切换功能40精确结构检索—检索金属配合物NPPtBuButtButBuNiClBF4该结构中包含:配体金属离子阳离子阴离子结构检索方法41任何一种结构,使用精确结构都可以检索到检索的定义42精确结构检索单一组分配合物结构检索—检索类似的环系结构43其中R=Me,H亚结构检索结果44检索界面可以看到对应的结构和检索方式SciFinder中的物质分析45SubstanceRole分析,帮助获得具有特定研究报道的物质点击KeepAnalysis来获取当前的结果集。物质结果集的排序及历史导航条46SciFinderWeb中的历史导航条,方便快速返回曾经检索过的界面。Refine-AtomAttachment获得结构中特定修饰情况47Refine下的AtomAttachment工具,帮助科研工作者了解结构中各个位点的可修饰性获得特定位点上为非C,H的衍生物48特定位点上为Q的物质结构检索—结构相似的检索49NEtCOOHHOOCSciFinder中的相似结构检索,帮助获得在结构上存在相似的物质。相似结构检索50相似结构检索到的物质与原结构存在以下的区别:取代基位置变化取代基变化母体结构变化结构检索小结51精确结构检索:获得物质的盐,聚合物,混合物,配合物等,母体结构不能修改,不能修饰亚结构检索:所画的结构必须存在,母体结构不能修改,但可以被修饰相似结构检索:获得相似度在60分以上的结构,母体结构可以修改,也可以被修饰,用相似度来控制获得的结果52提纲•介绍–SciFinder中的内容–SciFinder的注册和登陆•SciFinder中的检索和后处理–SciFinder中的文献检索–SciFinder中的物质检索–SciFinder中的Markush检索–SciFinder中的反应检索–SciPlanner在路线设计中的应用•SciFinder网络资源平台•Markush检索能帮助我们做初步的专利评估•举例:获取和该结构有关的专利53检索中的问题:通过结构检索,能方便的获得真实物质所对应的专利但是,如何获取预测物质所对应的专利呢?Markush检索—帮助获取和结构有关的专利Markush检索,帮助获得预测物质对应的专利5455Markush检索直接返回保护了该结构的专利一篇专利原文中的Claim56这里描述了R,Z的修饰当:Z=SO2R=C3-C10有取代的C环时,符合我们的检索要求。57提纲•介绍–SciFinder中的内容–SciFinder特色功能–SciFinder的注册和登陆•SciFinder中的检索和后处理–SciFinder中的文献检索–SciFinder中的物质检索–SciFinder中的Markush检索–SciFinder中的反应检索–SciPlanner在路线设计中的应用•SciFinder网络资源平台SciFinder中的反应定义工具58反应位置标记工具反应箭头反应官能团列表反应原子标记工具反应角色工具反应检索—基础检索•检索苯甲醛氧化成苯甲酸的反应•反应结构中的所有的伯醇不能参与反应59CHOCOOHSciFinder中的反应定义60反应位置标记工具,保证反应的精准性官能团选择工具,可以用官能团来定义反应,或者保护某特定官能团。亚结构反应检索,帮助找到所有相关的反应SciFinder中的反应结果61让一篇文献出现一条反应SciFinder中的反应后处理62SciFinder中可以使用Analysis/Refine工具对反应进行处理,这些工具的使用能让我们更好的了解反应的信息。获得有实验过程的反应63分析后的结果是一个预览结果,需要点击KeepAnalysis来获得最后的结果。反应信息和反应过程64反应的整体概述,每一步的溶剂,温度,反应条件反应信息和反应过程65反应实验历程的获取获得反应中心相似的反应66相似反应检索,依据和反应中心的相似程度,查询反应中心彼此相似的反应。选择相似级别67对于选择是全部反应中检索相似反应,还是在当前结果集中检索相似反应选择相似反应的相似限制Broad:仅反应中心相似Miedum:反