学生会在工作中,与团委密切协同,并配合行政部门,全面管理同学的思想、学习、文娱、体育、生活福利等,并通过自己的活动,引导同学走又红又专的道路,做社会主义革命和建设事业的可靠接班人。“文化大革命”期间,学生会工作基本上陷于停顿。1979年5月4日石河子农学院学生会正式成立。学生会设有:宣传部、学习部、文艺部、体育部、生活部、民族学生工作部、女生部,各部干事采取聘任制。到1985年第八次学代会,各部干事由聘任改为由系学生会对口担任干事和建立学生会主席团。到1992年第十三次学代会上,增设了监察部、实践部。1993年10月,学院第十四次学代会召开,全国各民族的246名学生代表参加了会议。大会审议并通过学生会章程,选举了新一届学生会。学生会常务委员会由学生会主席、秘书长、学生会监察部部长、学生会办公室主任、各系学生会主席组成。任期一年半。学生会为学代会的执行机构。学代会期间,学生会工作由学代会主席团负责。到1993年学院第十四次学代会时,学生会机构有:监察部、社会实践部、学习部、宣传部、生活部、文艺部、体育部、民族学生工作部、女生部、学生会办公室。下设各系学生分会。各班则设班委会。1995年4月15日至4月16日,石河子农学院第十五次学生代表大会在院图书馆三楼报告厅举行。参加会议的代表211名。会议通过了第十四届学生会主席刘剑锋作的《团结探索,抓住机遇,开拓拼搏迎接挑战》工作报告,选举出第十五届由14名委员组成的委员会。1996年,石河子大学成立,由农、经贸、工、医、师范、成教学院学生会共同组建成立石河子大学学生联全会。1997年,学联第一次代表大会5月24日在教工俱乐部召开,参加大会的代表224名。大会听取了工作报告,通过了《石河子大学学生联合会章程(草案)》,选举产生了石河子大学学联第一届委员会。2001年12月,大学学联举行了“学联届中递补大会”,为学联增添了新鲜的血液和新的活力。随后,石河子大学大学生伙食管理委员会、宿舍管理委员会、教学质量监督委员会等相继成立或得到加强,创办了学联自己的刊物《学联简报》。大学生艺术团、礼仪队、自律监察队相继成立。2004年3月12日-13日,石河子大学第二次学生代表大会在艺术楼音乐厅召开,参加会议的代表共260名。大会审议并通过了学联主席赵久龙所作的《创优良学风促全面成才在全面建设小康社会的伟大征程中谱写青春篇章》报告,选举产生了石河子大学学联第二届委员会,药学院谢佳楠同学当选为主席。2002年2月,总面积1200平方米的学生活动中心投入使用,学联干部开始有了自己的办公场所,占地240平方米的排演大厅和活动室为学生开展有益健康的活动创造了条件。4月份学联举办了由大学十四个学院参加的“庆功杯”足球联赛,取得了很好的效果;近几年由于学联组织的逐步完善,学联各部均开展了大量的校园文化活动,协助团委做了许多具体的工作,成效显著在学生中有很强的影响力;2003年,制定了《石河子大学学生联合会干部制度》、《石河子大学学生联合会档案管理制度》等25项管理制度,并汇编成册;