SDS-PAGE电泳操作流程―含考染 银染 碘染

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资源描述

1SDS-PAGE操作流程——考染1、准备溶液30%聚丙烯酰胺溶液-----30%(w/v)Acrylamide【组分浓度】各种组分名称配制不同体积所需各成分的体积(mL)或质量(g)30%Acr-Bis(29:1)1000ml100ml29%Acrylamide(丙烯酰胺)290g29g1%BIS(N,N’-亚甲丙烯酰胺)10g1g【配制方法】将29克丙烯酰胺和1克N,N’-亚甲丙烯酰胺溶于总体积为60ml温热(37℃左右)的去离子水中,充分搅拌溶解,补加水至终体积为100ml。0.45µm微孔滤膜过滤除菌和杂质,储于棕色瓶,4℃避光(用铝箔纸包扎起来)保存。严格核实PH不得超过7.0,因可以发生脱氨基反应是光催化或碱催化的。使用期不得超过两个月,隔几个月须重新配制。如有沉淀,可以过滤。【保存条件】4℃避光(用铝箔纸包扎起来)保存【注意事项】丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可通过皮肤吸收,其作用具有累积性。称量丙烯酰胺和N,N’-亚甲丙烯酰胺时应戴手套和面具。可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能含有少量未聚合材料。1MTris-HCL(pH6.8)(浓缩胶buffer)【组分浓度】1MTris-HCL名称用量备注Tris12.1g去离子水80ml浓盐酸9ml(36%的浓盐酸)预实验已确定去离子水加入去离子水定容至100ml后,室温保存【配制方法】称量121.1gTris碱溶于800mL的去离子水,充分搅拌溶解,加0.7mL的浓HCL调节所需要的pH值(7.4-大约0.7mL,7.6-大约0.6mL,8.0-大约0.42mL),将溶液定容至1L,高温高压灭菌后,室温保存。应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。【保存条件】4℃保存。【注意事项】对人体有刺激性,请注意适当防护。1.5MTris-HCL(pH8.8)(分离胶buffer)【组分浓度】1.5MTris-HCL名称用量备注2Tris18.17g去离子水80ml浓盐酸3ml(36%的浓盐酸)预实验已确定去离子水加入去离子水定容至100ml后,室温保存【配制方法】1L称量181.7gTris碱溶于800mL的去离子水,充分搅拌溶解,加浓HCL调节所需要的pH值=8.8,将溶液定容至1L,高温高压灭菌后,室温保存。(1.5mmol/LTris-HCL(pH8.8):18.15gTris和48ml1mol/LHCL混合,加水稀释到100ml终体积。过滤后40C保存。)【保存条件】4℃保存【注意事项】应使溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。10%十二烷基硫酸钠SDS溶液-----10%(w/v)SDS【组分浓度】10%(w/v)SDS名称用量备注SDS10g去离子水80ml加入去离子水定容至100ml后,室温保存【配制方法】称取2g高纯度的SDS置于100~200ml烧杯中,加入约16ml的去离子水,68℃加热溶解,滴加浓盐酸调节PH至7.2,定容至20ml后,室温保存【保存条件】室温保存【注意事项】对人体有害,请注意防护。10%过硫酸铵溶液-----10%(w/v)AP【组分浓度】10%(w/v)过硫酸铵名称用量备注过硫酸铵0.1g去离子水1ml现配现用【配制方法】称取0.1g过硫酸铵置于1.5ml离心管,加1mL去离子水吹打溶解,4℃保存【保存条件】4℃保存【注意事项】10%过硫酸铵溶液在4℃保存时,可使用1周左右,超过期限会失去催化作用5×Tris-甘氨酸电泳缓冲液-----5×Tris-Glycinebuffer(SDS-PAGE电泳缓冲液)【组分浓度】各种组分名称配制不同体积所需各成分的体积(mL)或质量(g)1000ml500ml0.125MTris15.1g31.25Mglycine(甘氨酸)94.0g0.5%(W/V)SDS5.0g【配制方法】称取15.1gTris,94.0g甘氨酸(glycine),5.0gSDS,用800ml蒸馏水或去离子水溶解,充分搅拌溶解,定容至1000ml,室温保存。得0.125mol/LTris-1.25mol/L甘氨酸电极缓冲液。临用前稀释5倍。【保存条件】室温保存【注意事项】配制好的电泳液使用时间不宜超过两周。电泳缓冲液可以回收,回收后可再使用1-2次,但为了取得最佳的电泳效果,应使用新电泳液。5×SDS-PAGE加样缓冲液-----5×SDS-PAGELoadingBuffer【组分浓度】0.25MTris-HCL(pH6.8);10%(W/V)SDS;0.5%(W/V)BPB(溴酚蓝);50%(V/V)甘油;5%(W/V)β-巯基乙醇(2-ME)各种组分名称配制不同体积所需各成分的体积(mL)或质量(g)5ml3ml1MTris-HCL(pH6.8)1.25mlSDS0.5gBPB(溴酚蓝)25mg甘油2.5ml(0.5mL/份)分装,室温保存,使用前加25μL2-ME/小份,保存一个月左右。β-巯基乙醇(2-ME)0.25ml【配制方法】量取1.25mL1MTris-HCL(pH6.8),0.5gSDS,25mgBPB,2.5mL甘油,置于10mL塑料离心管中,加去离子水溶解后,定容至5mL,小份(0.5mL/份)分装,于室温保存。使用前将25μL的2-ME加入到每小份中。加入2-ME的LoadingBuffer可在室温下保存一个月左右。【保存条件】-20℃保存,至少一年有效。【注意事项】SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5X)中含少量DTT和巯基乙醇,有轻微刺激性气味,必须完全溶解后再使用。摘自Takara商品目录--实验室常规试剂配制方法TEMED原液直接使用考马斯亮蓝R-250染色液【组分浓度】0.1%(w/v)考马斯亮蓝R-250,25%(v/v)异丙醇,10%(v/v)冰醋酸各种组分名称配制不同体积所需各成分的体积(mL)或质量(g)1000ml400ml备注4考马斯亮蓝R-2501.0g0.4g异丙醇250ml100ml搅拌溶解,可用甲醇替代冰醋酸100ml40ml搅拌均匀去离子水650ml260ml搅拌均匀,滤纸除去颗粒物,室温保存考马斯亮蓝染色脱色液【组分浓度】10%(v/v)醋酸,25%(v/v)乙醇名称用量备注冰醋酸100ml乙醇250ml去离子水650ml充分混匀后使用2、实验步骤2.1.制胶2.1.1组装胶架将洁净、无水的玻片对齐,形成空腔,插入塑料框的凹槽中,注意箭头向上,并确保下端平齐。放于制胶架上夹紧,下端紧贴密封条。2.1.2分离胶的配置2.1.2.110%分离胶配方如下表:分离胶胶类型8%10%12%15%蒸馏水/ml4.3643.32.330%Acr-Bis(29:1)/ml2.673.3451.5MTris-HclPH8.8/ml2.52.52.52.510%SDS/ml0.10.10.10.110%APS/ml0.10.10.10.1TEMED/μl5555总体积/ml102.1.2.2灌胶混匀后用移液枪将凝胶溶液沿玻棒小心注入到长、短玻璃板间的狭缝内(胶高度距样品模板梳齿下缘约1cm)。2.1.2.3液封在凝胶表面沿短玻板边缘轻轻加一层水(或者75%乙醇)以隔绝空气,使胶面平整。静置约30min观察胶面变化,当看到水与凝固的胶面有折射率不同的界限时,表明胶已完全凝固,倒掉上层水,并用滤纸吸干残留的水液。2.1.3浓缩胶的配置2.1.3.15%浓缩胶配方下表:5%胶蒸馏水30%Acr-Bis(29:1)0.5MTris-HclPH6.810%SDS10%APTEMED6ml4ml1ml1ml0.080ml0.060ml0.008ml2.1.3.2插入制胶梳混匀后用移液枪将凝胶溶液注入到长、短玻璃板间的狭缝内(分离胶上方),轻轻加入样品模5板梳,小心避免气泡的出现。约30分钟,聚合完全。2.2电泳2.2.1安装电泳槽将制备好的凝胶板取下,小心拔下梳子。两块10%的凝胶板分别插到U形橡胶框的两边凹形槽中,可往上提起使凝胶板紧贴橡胶。将装好玻璃板的胶模框平放在仰放的贮槽框上,其下缘与贮槽框下缘对齐,放入电泳槽内。倒入1×tris-gly电泳缓冲液。2.2.2样品处理对于蛋白样品直接取80µl的样品,依次加上20µl5×buffer(加了B-巯基乙醇),混匀。对于菌体或组织等固体样品,取少量样品加100ul2×buffer(加了B-巯基乙醇)煮沸10分钟。2.2.3加样用移液枪取处理过的样品溶液10μl,小心地依次加入到各凝胶凹形样品槽内,marker加入到其中一个槽内,为区别两块板,marker可加在不同的孔槽中。2.2.4电泳将电泳槽放置电泳仪上,接通电源,正负极对好。电压调至约150v保持恒压。待溴酚蓝标记移动到凝胶底部时,关电源,把电泳缓冲液倒回瓶中。2.2.5剥离胶把电泳槽取出,两块板拿下来,用刮片从长短玻片中间翘起,取下。2.3染色放于加有R250染色液的染色皿中,染液漫过胶即可,置于摇床上,转速约为45r/min,时间约1小时,完成后染液倒掉并用水洗掉染液。2.4.脱色取出染色过的胶放于加有脱色液的染缸里,脱色液漫过胶即可,置于摇床上,转速约为45r/min,时间约1小时,本底色脱净,条带清晰可见即可,完成后倒掉脱色液。2.5拍照将脱色后的胶置于透明文件夹中,把胶上面的气泡赶出(用前也可用酒精棉球擦干净文件夹),放到胶片观察灯上,拍照。SDS-PAGE操作流程——银染1、固定:25mL醋酸,100mL甲醇,加入125mL超纯水,对凝胶中蛋白质进行固定60min(固定时间可延长,加一步水洗)。2、浸泡:75mL甲醇,0.5g无水硫代硫酸钠(强还原性),17g醋酸钠(28.18g三水合醋酸钠),加入165mL超纯水,(每10mL溶液中加入100uL稀释十倍的甲醛),30min。3、水洗:用超纯水洗三次,每次10min。64、银染:0.625gAgNO3溶于250mL超纯水中,20min。5、水洗:水洗两次,每次1min。6、显色:6.25g无水NaCO3溶于250mL超纯水中(每25mL溶液加入150uL稀释十倍的甲醛,边观察边显色,至条带清晰可见)7、停止:3.65gEDTA溶于250mL超纯水中,10min。8、水洗:用超纯水洗3次,每次5min。注:含甲醛的溶液要现配现用,因甲醛在空气中容易挥发而使浓度不足,使用时可按比例扩大,AgNO3溶液可重复使用,甲醛为还原剂,还原银离子为单质银。SDS-PAGE操作流程——碘染1、5%(W/V)BaCl2染胶板15min或更长时间。2、水洗三次,每次1min3、2.0gKI+1.3gI2+50mLH2O混匀,染胶15min。(先让KI溶于水,待完全溶解后加入I2)4、自来水洗至背景色消失,不要长时间水洗。

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