郜刚分子生物学-03-染色体-2包装和半保留复制-59页PPT文档

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2.3DNA的复制DNA—ReplicationandSynthesis第二章染色体与DNA•TransmissionelectronmicrographofhumanaHeLacell,illustratingthereplicationbubblethatcharacterizesDNAreplicationwithinasinglereplicon.APicturePaintsaThousandWords...ormore?Becauseafigureisasinformativeas1000words….DNAReplicationMode1.ThreePossibleModesofDNAReplication(1)Conservativereplication(全保留复制)(2)Dispersivereplication(分散复制)2.3.1DNA的半保留复制核酸复制规律的一般猜想在DNA复制时,DNA并不需要解链,只是在复制位点解开几个碱基,亲代分子保持完整。在这个模型中,亲代分子并不需要解链。亲代DNA分子先打成片段然后再互为模板,这样的话,亲代DNA片段分散在子代DNA分子中(3)Semiconservativereplication(半保留复制)unwoundrewoundBasematchGeneralizedmodelofsemiconservativereplicationofDNAMatthewMesselsonFranklinStahl中国科学院上海生化与细胞所2019年招收硕士研究生分子遗传学入学考试:请设计一个实验来证明DNA复制是以半保留方式进行的(8分)。Meselson-Stahl实验:1958年,Meselson和Stahl首先将大肠杆菌在含重同位素15N的培养基中培养约十五代,使所有细菌都被15N标记。然后移至只含有轻同位素14N的培养基中同步培养一代,二代,三代。分别提取DNA,作CsCl密度梯度离心,观察DNA的位置。15N标记的DNA密度大于正常14N的DNA密度,在离心管较低的部位形成一条区带;正常的DNA应该在它的上面。这种重标记的DNA在14N培养液中复制一代,重密度带消失了,而在比正常DNA稍低的地方形成一个带,即中间密度带(如果是半保留复制,在第一代中,DNA是密度杂交分子,两条链中一条链是亲代15N标记的重链,另一条是正常含14N的轻链,这样两条链形成密度上杂交的DNA分子)。在14N培养液中再复制一代,就会出现两条带,一条在中间密度区域,一条在轻密度区域。随着在14N培养液中培养的代数的增加,中间密度区的区带量逐渐减少,低密度区带的量逐渐增加,但并不出现新的区带。这个实验证明了DNA的复制是半保留复制。TheMeselson-Stahlexperiment.themostbeautifulexperimentinbiology15N标记氮源14N标记细胞在14N中复制一次细胞在14N中再复制一次细胞在14N中再复制一次TheexpectedresultsoftwogenerationsofsemiconservativereplicationintheMeselson-Stahlexperiment..Meselson-Stahl实验的改进之一•对15N-DNA、14N-DNA杂交分子经加热变性,对于变性前后的DNA分别进行CsCl密度梯度离心。•结果变性前的杂交分子为一条中间密度带,变性后则分为两条区带,即重密度带(15N-DNA)和低密度带(14N-DNA)。第0代只有15N,第一代出现杂合分子,两代后出现等量的14N和14N-15N杂合分子。纯粹15N的分子没有的了,说明老链保留到了新链中了。3.SemiconservativeReplicationinEukaryotesTaylor-Woods-Hughesexperiments:1957,roottipsofViciafaba(蚕豆)Radioisotope3HlabeledthymidineAutoradiography(放射自显影)蚕豆病是葡糖六磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏者进食蚕豆后发生的急性溶血性贫血。蚕豆(viciafaba)又名胡豆黄TelophaseResultsSemi-conservativereplicationofchromosomescanalsobevisualizedthroughanexaminationofchromosomesthatareallowedtworoundsofreplicationinamediumcontainingbromodeoxy-uridine.ThesereplicatedchromosomesarethenstainedwithafluorescentdyeandGiemsastaintoproducewhataredescribedasharlequinchromosomesDNA半保留复制的生物学意义DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。为了保证遗传的稳定性,在每次细胞分裂之前,遗传信息载体必须精确地复制自己。过去的概念认为遗传信息的载体就是DNA,现在发现许多病毒的遗传信息载体是RNA而不是DNA。因此,我们除了对DNA的复制作详细的论述外,对RNA的复制也加以阐述,以期对遗传信息的复制有个全面的了解。1953年,Watson和Crick在提出DNA双螺旋模型时就指出,由于互补碱基的配对原则,在DNA复制时,只要双链DNA解开,以每一条链为模板以合成其互补链,即可形成两个与亲代完全一样的DNA分子。DNA复制的基本过程正如Watson和Crick所预测的那样,但是在DNA复制中涉及了许多细胞成分。DNA的复制过程大体上可以分为复制的启动,复制的延伸,和复制的终止三个阶段。•DNA复制在生物细胞中要从DNA分子上特定位置开始。这个特定的位置就称为复制起点(Originofreplication),用ori表示oriori2.3.2复制的起点方向和速度一个复制子:replicon一个复制子:replicon大肠杆菌Singleorigin,BidirectionalReplicationoriCter复制叉复制叉复制速度E.coli37℃0.5h105bp/min•MultipleOriginsinEukaryotes复制速度mammaliancell500-5000bp/min复制的多模式单起点、单方向(原核)多起点、单方向(真核)单起点、双方向(原核)多起点、双方向(真核)腺病毒、Φ29噬菌体、线粒体等2.3.3复制的几种主要方式page40•“复制方式”不同于“复制机制”•线性DNA的复制:典型的复制叉式的复制•环状DNA的复制:θ复制滚环复制D环复制2.3.3DNA复制的几种主要方式1.线性DNA双链的复制特点在于:1、多个起点,起点都不在线性DNA的端点(末端),而是在内部2、采用复制叉式的双向复制,两个复制叉,两个方向,有先导链和后随链之分3、末端的复制采用特殊的3种方式(后面讲)4、真核生物采用的复制方式:2.环状DNA双链的复制•θ复制:首先由J.Carins从大肠杆菌中观察到,又称为Carins复制。(双向复制)•滚环复制(rollingcirclereplication)(单向复制)•D环复制(Dloopreplication):线粒体DNA复制(单向复制)JohnCairns’experimentIn1963,JohnCairns:GrewE.coliin3HthymidineWaitedtillcellswereinthemiddleofreplicationLysedthecellsveryverygentlySpreadthelysateonanEMgridExposedthegridtoX-rayfilmforTWOmonthsReplicationoftheE.colichromosome经典实验分析OriginofReplicationθ复制约翰·凯恩斯Thereplicationeyebecomeslargerasthereplicationforksproceedalongthereplicon.Notethattheeyebecomeslargerthanthenonreplicatedsegment.Thetwosidesoftheeyecanbedefinedbecausetheyareboththesamelength.PhotographkindlyprovidedbyBernardHirt.OriginscanbemappedbyautoradiographyandelectrophoresiswhatCairns’experimentshowed:θE.colihasacircularchromosomeE.colihasasingleoriginofreplicationInE.coli,replicationandunwindingaresimultaneousJohnCairnsprovidedawell-designeddemonstrationofE.colichromosomalreplicationin1963.Inhisexperiment,heradioactivelylabeledthechromosomebygrowinghisculturesinamediumcontaining3H-thymidine.Thenucleosidebasewasincorporateduniformlyintothebacterialchromosome.Hethenisolatedthechromosomesbylysingthecellsgentlyandplacedthemonanelectronmicrograph(EM)gridwhichheexposedtoX-rayfilmfortwomonths.ThisExperimentclearlydemonstratesthethetareplicationmodelofcircularbacterialchromosomesWhatCairnsdidnotshow:•Isreplicationunidirectionalorbidirectional?•Istheoriginofreplicationunique?•Whereistheoriginofreplicationlocated?①Cyclechromosome②Semicoservativereplication③DirectlymeasurethechromosomallengthofE.coliConclusions:④Unwound-replicate-rewound⑤Onlyoneorigin(oriC)Twocycleslinkedasapattern.1100m11000003.4=3.2106bpθ复制的特点•多数环状DNA采用的复制方式•复制叉式复制,两个复制叉,双向等速或者不等速复制•有先导链和后随链之分滚环复制环状亲本DNA,双链ori限制性内切酶在复制起点识别特异序列,切开一条单链3’-OH5’-p5’末端常常与特殊的蛋白质结合,受到保护,而在3’末端不断地由DNA聚合酶催化,以没有切断的那条环形链为模板,合成新的互补链3’-OH5’-p3’-OH这里的新生链是共价结合在模板链的互补链上的3’端不断的滚动,而5’端则不断地被甩出去?以单链为模板,通过不连续复制(冈崎片段),复制出另外一条链,最后通过切割和连接重新环化。φX174滚环型复制:单向复制的特殊方式T.Brownetal.,如:ΦΧ174的双链环状DNA复制型(RF)(1)模板链和新合成的链分开;(2)不需RNA引物,新生链在正链3‘-OH上共价延伸延伸(3)只有一个复制叉;复制是单向的(4)滚环复制也有先导链和后随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