功能基因研究策略及工具功能基因研究策略及工具功能基因研究策略及工具功能基因研究策略及工具吉基吉基吉凯基因吉凯基因20132013让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!科学家并不意味着聪明过人,而仅仅代表他有某一领域的基础知识有比较规范的思考方式有理性领域的基础知识,有比较规范的思考方式,有理性客观的态度,能用一些实验(具体的或抽象的实验模型)检验理论或假说。让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!常见问题常见问题立题依据不充分。创新性不够。实验设计不合理。实验设计不合理。如何做好预实验。如何获得一个好基因。让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!典型基金精要典型基金精要典型基金精要典型基金精要A基因通过调控B信号通路影响C肿瘤的D功能A基因通过调控B信号通路影响C肿瘤的D功能典型典型SciSci文章精要文章精要典型典型SciSci文章精要文章精要A基因通过调控B信号通路影响C肿瘤的D功能A基因通过调控B信号通路影响C肿瘤的D功能A基因通过调控B信号通路影响C肿瘤的D功能1.相关性研究:A--C组织水平:肿瘤组织样本基因的表达情况临床水平:基因表达水平与各种临床特点(恶性程度,转移与否,耐药性,生存率等)的相关性2.功能研究:A--D细胞水平:生长凋亡转移侵润血管新生耐药细胞水平:生长,凋亡,转移,侵润,血管新生,耐药动物水平:成瘤,转移,药物敏感3机制研究:AB3.机制研究:A--B分子水平:相互结合,表达调控,翻译后修饰前,降解调控,剪切调控,胞内定位,激酶信号传导等3功能基因研究流程功能基因研究流程提出问题提出问题基因功能功能机制让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!肿瘤基因功能研究流程推进肿瘤基因功能研究流程推进肿瘤第一步:由特定肿瘤找出相关基因肿瘤表达检测基因常规方法:表达芯片,等目的通过筛选找出在肿瘤组织中有表达和肿瘤的功能目的:通过筛选,找出在肿瘤组织中有表达,和肿瘤的临床特征有相关性的基因意义研究的应用性以及临床相关性功能意义:研究的应用性以及临床相关性机制让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!肿瘤基因功能研究流程推进肿瘤肿瘤基因功能研究流程推进第二步确定候选基因的生物学功能肿瘤第二步:确定候选基因的生物学功能基本逻辑:改变基因状态后检测细胞模型、动物模型的表型变化基因基因操作基因操作常规方法:过表达,RNAi功能功能检测功能检测方向:增殖凋亡,转移,血管新生等功能目标确定候选肿瘤相关基因的生物学功能机制目标:确定候选肿瘤相关基因的生物学功能意义:研究的重要性让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!肿瘤基因功能研究流程推进肿瘤肿瘤基因功能研究流程推进肿瘤第三步:确定基因行使功能的分子机制常规思路检测下游基因的变化包括表达修饰等基因常规思路:检测下游基因的变化,包括表达修饰等常用方法:表达芯片,等功能目标:找出受目的基因影响的发生改变的下游分子意义决定了文章的深入程度功能下游分子检测意义:决定了文章的深入程度机制让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!不同阶段研究者推进过程解决方案肿瘤已确定肿瘤研究方向,手头有组织样本,但未确定目的基因的研究者芯片技术基因确定单个目的基因表达芯片获得候选基因列表OE\RNAi功能检测高通量筛选细胞模型动物模型功能已找到基因功能芯片技术机制表达芯片获得下游变化基因列表1Cell.2006Mar24;124(6):1283-98.文章示例CellVol117927–939June252004Cell,Vol.117,927939,June25,2004TwistaMasterRegulatorofMorphogenesisPlaysanTwist,aMasterRegulatorofMorphogenesis,PlaysanEssentialRoleinTumorMetastasisFigure1.MicroarrayAnalysisIdentifiedTwisttoBeUpregulateddihiduringtheMetastaticProgFigure2.SuppressionofTwistExpressionbyStablesiRNAgpppyDoesNotAffecttheProliferationof4T1CellsInVitroandInVivoFigure3.SuppressionofTwistExpressionInhibitedtheAbilityof4T1CellstoMetastasizefromtheMammaryGlandtoLungFigure4.SuppressionofTwistExpressionReducedthePresenceof4T1CellsintheBloodCirculationFigure5TwistInducesanEMTandCellMigrationFigure5.TwistInducesanEMTandCellMigrationFigure6.ExpressionofTwistResultsinRepressionofE-CadherinTranscriptionFigure7.ExpressionofTwistinHumanTumorCellLinesandinHumanBreastCarcinomas合作案例:863项目常见问题常见问题立题依据不充分。前期工作基础,提出问题的依据。创新性不够。实验设计不合理。寻找到一个疾病新基因(功能)。经典的研究思路。实验设计不合理。如何做好预实验。经典的研究思路。临床相关性实验,功能提示。如何获得一个好基因。芯片筛选、功能筛选。让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!让我们用心,换取您的放心!吉凯基因已有课题已有课题项目评估,方案分析,主线重要实验的完成无课题,有临床肿瘤方向1、从芯片开始,寻找肿瘤方向上功能新基因(承诺)2公司资源提供肿瘤方向上的功能新基因2、公司资源,提供肿瘤方向上的功能新基因40吉凯基因简介新的肿瘤相关的功能-新的肿瘤相关的功能基因-涵盖多种常见肿瘤类型-独一无二的产品:GeneCard暨课题库/科研种子快速获得发表SCI论文-快速获得发表SCI论文所需的基因和数据-快速获得国科金申请所需的前期工作基础40使用吉凯基因的产品发表的文献41代表文章技术路线NatMed.IF=27.136Treatmentofcerebralischemiabydisruptingischemia-inducedinteractionofnNOSwithPSD-95.ZhouLLiFXuHBLuoCXWuHYZhuMMLuWJiXZhouQGZhuNatMed.IF=27.136Treatmentofcerebralischemiabydisruptingischemia-inducedinteractionofnNOSwithPSD-95.ZhouLLiFXuHBLuoCXWuHYZhuMMLuWJiXZhouQGZhuZhouL,LiF,XuHB,LuoCX,WuHY,ZhuMM,LuW,JiX,ZhouQG,ZhuDY.2010Dec;16(12):1439-43.Epub2010Nov21.ZhouL,LiF,XuHB,LuoCX,WuHY,ZhuMM,LuW,JiX,ZhouQG,ZhuDY.2010Dec;16(12):1439-43.Epub2010Nov21.产品/服务领域目的细胞基因名称后续检测过表达慢病毒细胞生物学皮层神经元细胞(原代培养)HumannNOS-N1-133WesternBlot、小鼠脑皮层注射(原代培养)1133射42代表文章技术路线NatCellBiolIF=19527NatCellBiolIF=19527NatCellBiol.IF=19.527CytosolicFoxO1isessentialfortheinductionofautophagyandtumoursuppressoractivity.ZhYYJLiWLiXZhHWSWDFJYNatCellBiol.IF=19.527CytosolicFoxO1isessentialfortheinductionofautophagyandtumoursuppressoractivity.ZhYYJLiWLiXZhHWSWDFJYZhaoY,YangJ,LiaoW,LiuX,ZhangH,WangS,WangD,FengJ,YuL,ZhuWG.2010Jul;12(7):665-75.Epub2010Jun13.ZhaoY,YangJ,LiaoW,LiuX,ZhangH,WangS,WangD,FengJ,YuL,ZhuWG.2010Jul;12(7):665-75.Epub2010Jun13.产品/服务领域目的细胞基因名称后续检测肺癌RT-PCR、慢病毒介导的RNAi肿瘤生物学肺癌H1299、结直肠癌HCT116、子宫颈癌HeLaHumanCytosolicFoxO1RTPCR、WesternBlot、免疫共沉淀、免疫荧光、裸鼠成瘤免疫颈细胞裸鼠成瘤、免疫组化432010年中国科学家使用吉凯基因服务发表的miRNA相关文章1.JBiolChem.2010Oct8;285(41):31491-501.IF=5.328VitaminD3up-regulatedprotein1(VDUP1)isregulatedbyFOXO3AandmiR-17-5patthetitildttitillltilitfibblttranscriptionalandpost-transcriptionallevels,respectively,insenescentfibroblasts.ZhuodeX,NiuXH,ChenYC,XinDQ,GuoYL,MaoZB.2.BMCCancer.2010Jun22;10:318.IF=2.736;Hsa-miR-125a-3pandhsa-miR-125a-5paredownregulatedinnon-smallcelllungcancerandhaveinverseeffectsoninvasionandmigrationoflungcancercells.JiangL,HuangQ,ZhangS,ZhangQ,ChangJ,QiuX,WangE.3.BiochemBiophysResCommun.2010Jan15;391(3):1483-9.IF=2.548miR-126inhibitsnon-smallcelllungcancercellsproliferationbytargetingEGFL7.SunY,BaiY,ZhangF,WangY,GuoY,GuoL.,,g,g,,442011年中国科学家使用吉凯基因服务发表的miRNA相关文章1.Neoplasia.2011Sep;13(9):841-53.IF=5.476HypomethylationofthehsamiR191locuscauseshighexpressionofhsamir191andpromotestheHypomethylationofthehsa-miR-191locuscauseshighexpressionofhsa-mir-191andpromotestheepithelial-to-mesenchymaltransitioninhepatocellularcarcinoma.HeY,CuiY,WangW,GuJ,GuoS,MaK,LuoX.2.Carcinogenesis.2011Dec;32(12):1798-805.IF=5.402MicroRNA-499-5ppromotescellularinvasionandtumormetastasisincolorectalcancerbytargeting