搞有机必须学会的合成检索方法

搞有机必须学会的合成检索方法学化学的人，如果刚进实验室的话，往往是两眼黑，不知道如何下手，要下手往往是漫天刷浆，抓不住重点！那么如何能抓住重点，进行有目的的去读一些论文呢？一、Google搜索首先用google来看看你的研究方向，比如你研究某系列的天然物合成，那么你就用这个名字去search，然后先看看有没有中文的介绍，如果有的话，那么先看看它是不是review，最好的是找到中文的review，然后大体看以下，了解你要做的东西当前的进展，有什么人在做，结果如何啊。然后按图索骥，找到英文的文献，那么可能有很多英文的文献，如何去选呢？选择发表在影响因子高的期刊上的文章来读！！！这个很重要！，因为大牛的教授都是把自己的好结果发在高水平的论文上的。只要你找一篇比如是JOC上的文章，那么就要看好，里面是否引用了某些review，如果有的话，那么你就去找那个review，一般来说国外的高水平的review都是约稿的，请的是当前的牛教授来写的，有读的价值！依次你可以进行全面的了解相关的研究进展了。如何对待中文的杂志呢？我的意见可能偏激，我认为完全没有任何读的价值！为什么呢？第一，20%的杂志覆盖了80%的内容，第二，IF太低，低于1的就是垃圾了，没有引起任何人的重视，那么这个结果是没有价值的。第三，很多中文文献的重复性很差，数据被人为的修改。那么对待英文呢？同样，低水平的也是很多，对于IF低于1的不要去看，就是看了也不要太当真，原因同中文文献一样，对于化学来说也就是不超过20个有意义的杂志吧，美国化学社的全部，德国的wiley上有几个很好的，sciencedirect上的几个影响因子在2以上的，英国化学社的全部，也就是这些了外加thieme的一个。完整的检索分为两部分：①寻找相关的文献出处；②找到收录文献的数据库，或者使用相关软件，进行全文下载阅读。第①步是重要的，第②步是次要的。可以利用的三大检索工具：Beilstein的CrossFire；ISI的WebofScience；CAonCD。最常用的是Scifinder和Beilstein，最强大的可能是scifinder。通常用Scifinder来查化合物的具体的合成路线的设计。用Beilstein查查化合物的理化性质和具体的图谱数据。但是有时候专利里面也有很多有用的文献不仅仅是那些大型知名数据库二、大型检索网站：1、SciFinderScholar简单介绍：SciFinderScholar是美国化学学会（ACS）旗下的化学文摘服务社CAS（ChemicalAbstractService）所出版的化学资料电子数据库学术版。其中的CAPLUS是CA的网络版，它是全世界最大、最全面的化学和科学信息数据库。作为化学和生命科学研究领域中不可或缺的参考和研究工具的“化学文摘”的网络版，SciFinder在线数据库每天更新数千条记录，更整合了Medline医学数据库、欧洲和美国等50家专利机构的全文专利资料、它可以透过网络直接查看“化学文摘”1907年以来的所有期刊文献和专利摘要；以及四千多万的化学物质记录和CAS注册号。可访问的蛋白质和核酸信息远多于任何可公开获得的资源。它涵盖的学科包括应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多领域。到目前为止,SciFinder已收文献量占全世界化工化学总文献量的98％。另外，它还有分子式、反应式和结构式（包括亚结构）检索、核酸和蛋白质序列检索等多种功能。它超越了一般检索工具的范畴，而成为研发人员不可或缺的研发工具。SciFinderScholar可检索数据库包括：①CAPLUSSM（＞2150万条参考书目记录，每天更新3000条以上，始自1907年）②CASREGISTRYSM（＞2000万条物质记录，每天更新约4000条，每种化学物质有唯一对应的CAS注册号，始自1957年）③CASREACT?（＞570万条反应记录，每周更新约600-1300条，始自1974年）④CHEMCATS?（＞390万条商业化学物质记录，来自655家供应商的766种目录）⑤CHMLIST?（＞22.7万种化合物的详细清单，来自13个国家和国际性组织）⑥MEDLINE（NationalLibraryofMedicine数据库，＞1200万参考书目记录，来自3900多种期刊，始自1958年）安装注意事项：①、安装前退出所有程序，网页浏览器除外。②、当安装过程中被问及是否有标有“CustomSiteFiles”的盘时，请选择“否”，如下图。其他选项请选择默认设置。③、安装的最后一步，会被询问是否要进行连接测试（Performconnectivitytest），请不要选择测试，直接点击“Finishi”即可。应用技巧：①SciFinder的一个小技巧，可能一开始我们使用SciFinder自带的结构式绘制工具，并不习惯。如果本来已经有用Chemdraw画好的结构式，把它另存为mol格式，然后在SciFinder的检索界面，点击File-Open，打开它，即可把它调入SciFinder进行检索。②、在SCIFINDER上，很多反应直接检索反应式可能查不到，可以考虑将产品输入后，挑选匹配度较大的化合物，进行结构检索，会有意想不到的结果哦。另外，用PDF打印机将文章打印下来，再慢慢学习。里面的登陆号检索也是很有用的。可以查一般中间体的性质。③一般来说sicfinder我们常用的是structuresearch，可以进行单个化合物的search，也可以进行化学方程式search，可以进行分子式的search，还有CASnumber的search，和关键词search。a．structuresearch，主要问题是很多朋友把自己的最终想合成的结构画出来了，不管它有多么复杂。其实这个是错误的，你想你合成的东西几乎都是新的物质，scifinder那里能收录啊，只要没有人发表就没有收录。所以为了更准确的找到你想要的相关的合成文献，建议你自己先减肥，把不必要的一些结构给去掉，简化。例如下面的例子这个化合物是没有的，但大家发现了没有这个化合物完全可以去掉左边酰氨化那部分和下面的脂化部分，剩下这个结构，这个在scifinder中是有合成方法的，其他的化合物也以此类推。而对反应也是一样的，如果你想查反应，例如：cross-coupling中的thiolreactwithalkylhalides,那么你就把你想要的最简单的thiol和alkylhalides以及相对应的结构化出来，当然结构中要包括你的物质的主要骨架。一般我们不建议进行分子式search，麻烦，大家要给你逐个去找。还有一点，建议你用chemdraw画图.b．关键词的search，这个你要根据你想要的结果来提出最佳关键词，例如你想知道thiophene的合成方法，那么最好的关键词就要包含thiophene这个关键词。这个要是大家给出来很多，相信用过scifinder的人还是知道如何给你查的。c．其他的例如人名，单位的查询，文件号码的查询，杂志查询对其他人来说没有很大的价值。d．查询结果的处理。查询结果一般来说都可以reference的形式出现，这里就有个问题了，有时候可能出现几百个结果，而一般的scifinder只能允许你下载100个结果的纪录。就要筛选，可以进行年段的选择，例如：1990-（从1990年到现在）：1990-2000（从1990到2000），所以如果你的方向很热，建议你对你的结果进行年代选择，否则大家就给你保存了最近100个结果。另外就是scifinder中收录了1500个左右的杂志，很多是影响因子很查的，用英语以外的其他语言写的，专利等等。一般来说好的文章都是用英语写的，其他的语言很难有你需要的文章，其实作者也想用英语写，可能个方面原因没有写成，所以建议你写下要求语言，中文，英文，日语等等。另外就是专利，专利可以说质量差异很大，尽管是什么美国专利局的啊，也有查的专利，所以要不要专利也是个主要的选择。而后就是reference的类型，有review，有journal，有book，有会议发表的，等等，一般也就是前两个review和journal能找到全文，所以建议大家就要review和journal，就足够了，那么有人说专利呢？当然可以要，但我告诉你scifinder还有专门面对企业的，用户界面类似，但内容有差别的。所以根据你自己的情况来决定。最后就是能否得到全文的问题，scifinder的大部分能正确的找到文章的连接（只要网上有全文的），所以如果你想自己找文章的话，还是建议你选择fulltextavailable，然后保存结果，就更好点。e、另外结构中不要加入像——R，这样的基团，那样范围太大了，几乎给你找不到很有用的结果，所以建议你能把一些基团给的具体一点，如果你非要加也要注明，R属于那一类，例如：anymetal,anyhalogen,anyalkylchainetc.SciFinder的版本现在使用的通常是SciFinderScholor,是面对大学或研究机构的,与之对应还有SciFinder,是面对企业用户的,基本是各大制药巨头。二者数据库是一样的，后者仅多了一些分析功能，利于分析数据。国内上海有机所比较有钱，二者全部购买，前者学生可以使用，后者是教授专用的。介绍网站：1、SciFinderScholar(SFS)检索技巧：、SciFinderScholar使用简介（十分详细）：、清华大学图书馆SciFinder简介、官方的详细介绍的网址、可以在线观看（也可以下载，看看源文件）是关于其使用的有声教材：点击SciFindere-Seminars6、台湾长亨公司的scifinder介绍：://、南开的培训课件：、国立中央大学教义：~reflib/SFStrain.ppt2、BeilsteinCrossFireBeilstein是世界上最大的关于有机化学事实的数据库，数据来源于175种期刊，已收录9百多万个化合物和9百多万个反应。作为最基本的化学文献数据库，CrossFireBeilstein能帮助有机化学研究人员形成新思路、设计合成路径（包括起始原料和中间体）、确定生物活性和物理性质、了解外界环境对化合物的影响，等等。主要数据的索引分为3部分：化学物质部分收集了结构信息及相关的事实和参考文献，包括化学、物理和生物活性数据；反应部分提供化学物质制备的详细资料，帮助研究人员用反应式检索特定的反应路径；文献部分包括引用、文献标题和文摘，化学物质部分和反应部分的条目与文献部分有超链接。CrossFireBeilstein数据库是世界上最大的有机化学门户还可以在桌面上直接访问期刊上的文献原文。数据来源为1779～1959年《BeilsteinHandbook》、《Beilstein有机化学大全》从正编到第2检索方法四补编的全部内容和1960年以来的原始文献(各种国CrossFireGmelin/Beilstein数据库)有