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抗菌素抗性标记及筛选原理大多数质粒载体都是用抗菌素抗性标记，包括氨苄青霉素抗性（Ampr）、卡那霉素抗性（Kanr）、四环素抗性（Tetr）、链霉素抗性（Strr）和氯霉素抗性（Cmlr））等。i）氨苄青霉素（Ampicillin，Amp）是青霉素的衍生物，通过干扰细菌细胞壁合成的末端反应，杀死生长的细菌。细菌质粒Ampr基因编码b-内酰胺酶，特异地切割氨苄青霉素的b-内酰胺环。ii）氯霉素（chloramphenicol，Cml）通过与50S核糖体亚基结合，干扰细胞蛋白质的合成并阻止肽键的形成。杀死生长的细菌。细菌抗性原理是Cmlr编码乙酰转移酶，特异地使氯霉素乙酰化而失活。iii）卡那霉素（kanamycin，Kan）通过与70S核糖体结合，导致mRNA发生错读。杀死细菌。而Kanr编码的氨基糖苷磷酸转移酶，对卡那霉素进行修饰，阻断其与核糖体结合作用。iv）链霉素（Streptomycin，Str）通过与30S核糖体亚基结合，导致mRNA错译。杀死细菌。Strr编码一种氨基糖苷磷酸转移酶对链霉素进行修饰，阻断其与核糖体30S亚基结合作用。v）四环素（Tetracycline，Tet）通过于30S核糖体亚基结合，干扰细胞蛋白质的合成并阻止肽键的形成。杀死生长的细菌。Tetr编码特异性蛋白质，对细菌的膜结构进行修饰，组止四环素通过细胞膜进入细菌细胞内。抗生素抗性筛选原理是：不带有抗菌素抗性基因的受体菌不能在含有抗菌素的培养基（选择培养基）中生长。当带有抗菌素抗性基因的载体进入受体菌后，受体菌才能生长。