pubmed的使用方法

近年来，利用计算机进行文献检索已逐步代替传统的手工检索，随着Internet的普及，我们可以随时随地通过国际互联网来检索获得免费的医学文献，这是一条文献检索新捷径[1]，特别是进行MEDLINE检索，既简单又实用[2]。现在有多个机构提供免费的网上MEDLINE检索服务，其中由美国国立医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NCBI）建立的PubMed数据更新快[3]，检索系统完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。由于PubMed检索系统在不断完善和加强，要快速、全面、准确地在近4千种医学期刊、1千1百万条数据中检索出符合自己要求的资料[4]，并不容易。下面介绍最新版本（2000年9月版）的PubMed使用方法。1.进入PubMed在浏览器的地址栏内输入Pubmed的网址：后按回车键，就进入PubMed的主页，开始检索。2.普通检索在检索式提问框中输入一个或更多的词（例如：vitaminccommoncold），然后按回车键或用鼠标点击Go按钮，PubMed就会利用自动词语匹配功能将重要的词或词组用AND组合在一起进行检索（见图1）。输入的词可以是自由词、主题词、或其他指定字段。由于主题词检索的文献更全面、更准确，应尽量使用主题词/副主题词检索。对于某些新的技术词汇、新药、新方法、新疾病等，还没有相应的主题词时，应该用自由词检索。3.高级检索使用逻辑词AND,OR,NOT（例如：vitamincORzinc）、指定文献记录字段名称检索、使用医学主题词（MeSH）/副主题词组配格式检索，如neoplasms/diettherapy［mh］。不久返回检索结果，检索提问框仍出现在页面顶端，并显示您刚才输入的检索词。您可以在提问框内、点击Details或Limits按钮再修改检索词。3.1PubMed检索规则和语法①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitamincORzinc；②PubMed从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。括弧内的字段是作为一个整体来处理的。③如果输入的字段含有主题词组，PubMed优先按词组检索。如果不希望这样，应该加布尔运算符。例如输入：airbladderfistula，PubMed会将airbladder作为词组。此时应输入：airANDbladderANDfistula。④字段标记符（tag）使用规则：只能在词后加字段标记符，如：romatherapy[mh]，必须用封闭的方括弧[]，大小写和空格会被忽略，如crabs[mh]=Crabs[MH]。⑤日期格式：采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如1998/03/06［dp］，1999/10[EDAT]。月和日可以不写。输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［dp］，1998/01：1998/04［dp］。日期字段标记符有3个：DateofPublication[DP]：出版日期EntrezDate[EDAT]：进入PubMed的日期。MeSHDate[MHDA]：该引文被MeSH主题词编入索引的日期。⑥期刊标记符有3个：jsubseta-AbridgedIndexMedicus只检索《医学索引》的期刊jsubsetd-Dental只检索《牙科文献索引》的期刊jsubsetn-Nursing只检索《护理学索引》的期刊例如:neoplasmsANDjsubseta⑦检索须有摘要的文献，使用hasabstract。如:neoplasmsANDhasabstract⑧检索印刷前的引文，使用pubstatusaheadofprint。例如:pubstatusaheadofprintANDgene3.2.PubMed的检索语法检索语法格式是：检索词[tag]布尔运算符检索词[tag]例如：要检索作者Dr.Crick在1993年撰写的关于DNA的文献，格式是：dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]要检索关于热或潮湿与多发性硬化的关系，格式是：(heatORhumidity)ANDmultiplesclerosis检索学龄前儿童哮喘治疗的英文综述文献，格式是：asthma/therapy[mh]ANDreview[pt]ANDchild,preschool[mh]ANDenglish[la]3.3作者姓名检索输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，但如果作者的姓是一个MeSH词的时候除外，例如输入Yang,则PubMed将只检索：Yin-Yang［MeSH］或Yang［TextWord］。此外，如果使用双引号将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符［au］限制，如smithj［au］，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。3.4期刊名检索包括期刊名全称（如molecularbiologyofthecell）、期刊名MEDLINE缩写（如molbiolcell）、国际标准连续出版物号（ISSN，如1059-1524）。例如，如果输入NewEnglandJournalofMedicine，PubMed将按NEnglJMed［ta］查询。应注意：①如果杂志名也是一个MeSH词，例如GeneTherapy,Science,或Cell，PubMed只会按MeSH词来检索，要想检索杂志名，必须加字段标记[ta]，如genetherapy[ta]。②对一个单词的杂志名，也必须加字段标记[ta]。③尽量使用期刊名全称和期刊名MEDLINE缩写检索，在早期的文献中，ISSN号是不能保证检索完全的。④如果杂志名带有参数或引号，应该去掉这些参数或引号，如：JHandSurg[Am]应该以JHandSurgAm键入。3.5截词检索可以在词尾加*号，来检索有一样词头的所有词，如输入bacter*，则会检索bacter,bacteria,bacterium,bacteriophage等词，但不会检索带有空格的词组，如bacteriacontrol。PubMed只能检索前150个相符合的词。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heartattack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索myocardialinfarction、myocardialstunning、shock、cardiogenic这些方面的文献。3.6强制词组检索（规定Pubmed检索一个词组）一般情况下，如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组，如poi-sonivy，PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组，如果输入的词组，在PubMed的词组表中没有时，PubMed会拆分词组，如您输入：singlecell，PubMed会分成single和cell分别检索，如要强制检索singlecell，必须加双引号，使得PubMed将其当作一个词来进行检索，即写成singlecell。需注意的是，使用双引号规定PubMed进行词组检索，PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。3.7检索细节点击Details按钮，可以查看和编辑检索情况，即可以增加或删除检索词，如图2。还可以从检索细节窗口保存检索项目：点击URL按钮后，用浏览器的书签（或收藏夹）菜单将目前的检索项目作为URL地址以书签形式保存，以便下次再检索。4.限定检索（Limits）如图3，可以对多个选项限定检索，以缩小检索范围，提高检索准确率。完成后将出现如图4的核对框，显示限定的字段。限定字段检索的项目有：4.1字段选择可选择：所有字段（AllFields）、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN号码、语种、MeSH词、副主题词、页码、出版日期、自由词、标题词、期刊卷号、数据库更新代码、物资名称等22个选项，默认选项为AllFields。4.2必须有摘要的文献（OnlyItemswithAbstracts）为复选框，选中后检索出的文献均有摘要。注意1975年前的文献是没有摘要的。4.3出版形式（PublicationTypes）包括：ClinicalTrial临床试验Editorial编辑按语Letter读者来信Meta-Analysis荟萃分析PracticeGuideline实践指南RandomizedControlledTrial随即对照试验Review综述4.4出版语种（Languages）PubMed引用了近40种语言的期刊。但下拉式菜单中只有最常检索的几种语言供选择：英语、法语、德语、意大利语、日语、俄语和西班牙语。如您没有限制语言，PubMed会检索所有语种出版的文献。语种的字段标记符一般取英文的前3个字母表示，如汉语为[chi]，德语为[ger]，但日语例外，为[jpn]。4.5年龄（Ages）可在下拉式菜单中选择其中一项。AllInfant:birth-23month出生到23月龄的婴儿AllChild:0-18years0～18岁的儿童AllAdult:19+years所有成年人（19岁以上）Newborn:birth-1month新生儿（出生到1个月）Infant:1-23months婴儿PreschoolChild:2-5years2～5岁的学龄前儿童Child:6-12years6～12岁儿童Adolescent:13-18years青春期13～18岁Adult:19-44years19～44岁成年人MiddleAged:45-64years45～64岁Aged:65+years65岁以上80andover:80+years80岁以上4.6性别（Gender）4.7人或动物（HumanorAnimal）4.8子项（Subsets）包括：目前有9个数据库或过滤检索系统可选：AIDS、AIM、Dental、MEDLINE、Nursing、PreMEDLINE、Publisher、PubRef、Toxicology。其中MEDLINE,PreMEDLINE和出版商直接提供的电子出版物文献（Publishers）较常用。4.9文献进入MEDLINE的时间有30天、60天、90天、180天、1年、2年、5年和10年选择。4.10出版或进入MEDLINE的时间段应输入时间范围。按照年/月/日的格式。5.利用预览/索引（Preview/Index）检索使用预览/索引可以：预览检索出的文献数量，加快显示速度、一次性地增加检索词来精确检索、增加检索词来检索某些特殊领域、从索引中查看和选择检索词。例如：要检索以chickenpox为头的MeSH词，先选择在下拉式菜单的MeSHTerms，在检索框内输入chickenpox，再点击Index按钮。滚动索引Index窗，高亮显示chickenpoxvaccine，点击AND按钮，Chickenpoxvaccine就会出现在检索提问框内（图5）。注意：Preview/Index只能显示最近三次检索的预览结果。而历史（History）窗口能显示多达过去100次的检索请求。6.利用历史记录（History）检索PubMed能保存您所有的检索请求和结果。历史窗口显示检索序号、检索请求、检索时间、检出的文献数（图6）。点击检索结果数字，可以阅读检索出的文献。也可以将历史检索合并，重新检索。方法是在检索序号前加#号，如#2AND#6,或#3AND(drugtherapyORdiettherapy)。再按Go按钮开始重新检索。注意:①历史记录最多保存100条。②若PubMed停止使用1小时，历史记录就会被删除。③PubMed是利用cookies来保存检索历史的，要使用此功能，您的浏览器必须设置为accept