单细胞凝胶电泳步骤新版

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单细胞琼脂糖凝胶电泳(cometassay)SingleCellAgaroseGelElectrophoresis(SCGE)分析DNA损伤DNA损伤增加----comettail增大步骤:一、胞悬液的制备:1.吸弃旧培养基,PBS冲洗2遍。2.0.25%胰酶消化,待细胞变圆,间隙增大,立即终止消化,用弯头吸管轻轻吹打细胞,使成细胞悬液,加入离心管,1000rpm,25℃离心10min,弃上清,以1mlPBS悬浮细胞,(以上应在暗室及较低温度下进行)。各组收集细胞2~3×106个(细胞悬液终浓度106个/ml),必须分散成单个。悬浮于1mlPH7.4PBS中,此步在暗室及较低温度下进行。浓度要求:100μL上胶中混30μL细胞悬液,在100x镜下视野有10-15个细胞,细胞呈圆形,不皱缩。二、玻片制备:1.玻片磨砂。2.制备0.7%正常熔点琼脂糖(NMPA)和0.7%低熔点琼脂糖(LMPA)各20ml。用pH7.4PBS配制。称0.14g溶于20mlPBS。(NMA与玻片附着不紧,可升高其浓度至0.7%,低浓度的下胶有显像清晰,高浓度附着玻片牢固不易洗脱,可以调节浓度在0.6%-0.7%)。铺第一层胶:0.5%NMPA100μl于磨砂玻片面,迅速盖上盖玻片,室温5min使其固化,即为第一层胶;第二层胶:37℃0.5%LMPA100μl+30μl(1-2x106)细胞悬液混匀,迅速铺于第一层胶上,盖新盖玻片,移入冰箱5min,使其固化。*余下的细胞1000g×10min离心,于0.1-0.2ml悬浮缓冲液中混匀,做Western-blot。余下细胞4℃锡纸避光,可以保存一周(用于重复试验)。三、细胞溶解:1.玻片缓缓浸入新鲜配制的冰凉(应用前冷藏30~60分钟)细胞溶解液中,4℃1小时(2-3h浸泡)或过夜。玻片在细胞消化液中可至少存放4周。细胞溶解液1L的配制500mlNaCl146.1g73.05gNa2EDTA37.2g18.6gTrisbase1.2g0.6g用约12克NaOH调节pH至10。6g定容至445mltriton5mlDMSO50ml配500ml用去离子水定容至890ml。过滤除菌,为贮备液。室温保存。应用液(现配现用)(粉剂定容至890ml水98%+10mltritonx-1001%+100mlDMSO10%按比例配制即可)加入TritonX-100至1%DMSO至10%(消除血液或动物组织中血红蛋白释放的铁产生的自由基)4、碱化处理及电泳:取出玻片,放入水平电泳槽中(正极端),并列放置,不留空隙。倒入新鲜配制的冰冷电泳缓冲应用液,高于胶2mm,无气泡。放置40分钟解旋,本室一般采用20min,使DNA解链。20V,300mA电泳20分钟。通过调节液面来调电压。(电压先调到最大,电流300mA然后通过液面来调节电压)电泳缓冲应用液:10NNaOH30.0ml(12克)200mMEDTA5.0ml(二钠为0.372g)(附言:电泳缓冲液储备液:10NNaOH200g/500ml水,两周内用。200mMEDTA14.89g/200ml水,pH=10,室温保存。)定容至1000ml,混匀,电泳前新鲜配制。可通过改变液面高度来调节电压。U=IR,高度下降,横截面积下降则电阻上升。电压下降,减液。5、中和:切断电源,取出玻片,置染缸,中和缓冲液浸洗,3次×5min。中和缓冲液:Trisbase48.5g去离子水定容至1000ml用10mol/LHCL调节pH至7.5。室温保存。玻片过夜可以使用甲醇进行脱水固定。6、染色呈中性后,凉干玻片,用5μg/mlEB应用液染色5-10min,漂洗20-30min。EB染色液(10×贮备液)EB1mg去离子水20ml室温避光保存。临用时将贮备液稀释10倍。使终浓度为5μg/ml以上除中和及染色外,各步均应在暗处进行,以避免额外的DNA损伤。四、镜检及结果评价EB染色后的DNA样品应尽快在荧光显微镜下观察。未受损细胞表现为以圆形荧光核心,即彗星头部,没有尾巴。受损细胞则有彗尾伸向阳极,形成一个亮的头部和尾部。用目镜测微尺或拍摄×400倍照片再作判断。每个样品中至少随机挑选25个细胞测定。彗星尾长度35μm为未损伤35-70μm为中度损伤70μm为重度损伤

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