5生物样本库编号规则

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生物样本库编号规则建议Avantech周学迅@20100325标本库编号命名规则:总原则:唯一性,共享性辅原则:在满足总原则基础上,尽量精简。编号长度尽量保持统一。一.遗传数据库按家系采集时,建议编号规则如下G1234P1D08BS1家系采集家系流水号关系研究(采样)脏器样本类型细类分管号关系类中,P1为原始本人第1代,家系中其余关系,请自己定义相关的编号规则前7位样本编号一致的为同一个体,同一个体的若干不同编号样本,其个体的基本信息是一致的,以下同。二.组织生物样本采集和常规采集的编号规则组织编号规则1012345D08TF1年份流水号取材脏器取材部位保存方式分管号N/P/T/M/LF/R/O/D/P标签类型:BRADYTHT-163-499-3-IP长方形为25.4mm*9.525mm,圆直径9.525mm【组织样本的编号命名1012345D08TF1,代表该1012345号病收集的D08脏器的肿瘤样本(T肿瘤,P癌旁,N正常,M转移,L淋巴结,Y息肉,C囊壁)用F方式(FrozenTissues/OCT/RNAlater/DNA/ParaffinEmbedding等)保存的第一份。】外周血编号规则1012345D08BP1年份流水号研究脏器样本类型样本细类分管号BS/P/W/E/D/T/B标签类型:BRADYTHT-163-499-3-IP长方形为25.4mm*9.525mm,圆直径9.525mm【血液样本的编号命名1012345D19BP1,代表该1012345号病收集的D19脏器癌症的B血液样本的P血浆(Plasma/Serum/WhiteBloodCells/Erythrocyte/Thrombolytic/DNA/RNA/wholeBlood/等)的第一份。】其余细胞/体液编号规则1012345D08BP1年份流水号研究脏器样本类型样本细类分管号【如脐血为常规保留样本,为区别用常规外周血,可对脐血专门设立一个样本类型,细类可参考外周血的分类】附表1、器官分类代码表器官代码用1位字母和2位数字表示,如果涉及需要器官内的具体部位进行分类,可以对子类别增加定义,在需要通过编号区别脏器分类的特定情况下,可以考虑添加一位的方法。(一)运动系统骨A器官代码具体部位器官代码具体部位颅骨A01掌骨A11椎骨A02指骨A12肋骨A03髋骨A13胸骨A04股骨A14锁骨A05髌骨A15肩胛骨A06胫骨A16肱骨A07腓骨A17桡骨A08足骨A18尺骨A09其它骨-未特指A99腕骨A10(一)运动系统关节B器官代码具体部位器官代码具体部位椎间盘B01韧带B04半月板B02其它关节软骨B05关节囊B03关节-未特指B99(一)运动系统肌C器官代码具体部位器官代码具体部位头肌C01面肌上肢肌C04上肢带肌咀嚼肌臂肌颈肌C02颈浅肌与颈外侧肌手肌颈前肌上肢筋膜颈深肌下肢肌C05髋肌颈部筋膜大腿肌躯干肌C03背肌小腿肌胸肌足肌腹肌下肢筋膜膈肌C04肌-未特指C99(二)内脏学消化D器官代码具体部位器官代码具体部位唇D01咽D07颊D02食管D08腭D03胃D09贲门部牙和牙周组织D04舌D05胃底唾液腺D06腮腺胃小弯颌下腺胃大弯舌下腺幽门部器官代码具体部位器官代码具体部位十二指肠D10肝*D19右前叶空肠D11右后叶回肠D12左内叶盲肠D13左外叶阑尾D14尾状叶结肠D15升结肠胰*D20胰头横结肠胰体降结肠胰尾乙状结肠胰管直肠D16消化器官-未特指D99肛管D17肝外胆道D18胆囊/胆囊管肝管/肝总管胆总管(二)内脏学呼吸系统E器官代码具体部位器官代码具体部位鼻E01肺E05左肺上叶喉E02左肺下叶气管E03右肺上叶支气管E04右肺中叶胸膜E06壁胸膜右肺下叶脏胸膜呼吸器官-未特指E99(二)内脏学泌尿系统F器官代码具体部位器官代码具体部位肾F01肾被膜膀胱F03肾实质肾盂尿道F04输尿管F02泌尿器官-未特指F99(二)内脏学心血管系统G器官代码具体部位器官代码具体部位心G01心包动脉G02肺循环的动脉心房体循环的动脉心室静脉G03肺循环的静脉瓣膜体循环的静脉冠状动脉心血管,未特指G99心的静脉(二)内脏学淋巴系统H器官代码具体部位器官代码具体部位淋巴导管H01胸导管淋巴结*H02骶淋巴结右淋巴导管髂内淋巴结淋巴结*H02头部淋巴结髂外淋巴结颈部淋巴结髂总淋巴结肘淋巴结腹壁淋巴结腋淋巴结腹腔器官的淋巴结胸壁淋巴结胸腺*H03胸腔器官淋巴结脾*H04腘淋巴结淋巴器官-未特指H99腹股沟淋巴结(二)内脏学男性生殖系统I器官代码具体部位器官代码具体部位睾丸*I01阴囊I07附睾I02阴茎I08阴茎头输精管和射精管I03阴茎体精囊I04阴茎根前列腺I05男性生殖器官-未特指I99尿道球腺I06(二)内脏学女性生殖系统J器官代码具体部位器官代码具体部位卵巢*J01外阴J06阴蒂输卵管J02前庭球子宫J03子宫底阴阜子宫体大阴唇子宫颈小阴唇阴道J04阴道前庭前庭大腺J05女性生殖器官-未特指J99乳房J07(二)内脏学纵膈/腹膜/盆腔K器官代码具体部位器官代码具体部位纵膈K01网膜K05腹腔K02系膜K06盆腔K03未特指K99腹膜K04(三)感觉器皮肤L器官代码具体部位器官代码具体部位皮肤L01表皮软组织L02真皮未特指L99皮肤附属物(三)感觉器视器M器官代码具体部位器官代码具体部位眼球壁M01角膜眼球内容物M02房水巩膜晶状体虹膜玻璃体睫状体眼副器M03眼睑脉络膜结膜视网膜泪器眼-未特指M99眼球外肌眶脂体与眶筋膜(四)感觉器前庭蜗器N器官代码具体部位器官代码具体部位外耳N01耳廓内耳N03骨迷路外耳道膜迷路鼓膜内耳道中耳N02鼓室耳,未特指N99咽鼓管乳突窦和乳突小房(四)感觉器其它感受器O器官代码具体部位器官代码具体部位嗅器O01未特指O99味器O02(五)神经系统中枢神经系统P器官代码具体部位器官代码具体部位脑P01端脑脊髓P02灰质间脑白质脑干脑和脊髓的被膜P03小脑中枢神经器官-未特指P99(五)神经系统周围神经系统Q器官代码具体部位器官代码具体部位脑神经Q02嗅神经脑神经Q02副神经视神经舌下神经动眼神经脊神经Q01颈丛滑车神经臂丛三叉神经胸神经前支展神经腰丛面神经骶丛前庭蜗神经内脏神经Q03舌咽神经周围神经系统-未特指Q99迷走神经(六)内分泌系统内分泌系统R器官代码具体部位器官代码具体部位垂体R01肾上腺R04甲状腺R02松果体R05甲状旁腺R03内分泌器官-未特指R99(七)血液和造血系统S器官代码具体部位器官代码具体部位血液S01骨髓S02(八)胎儿T器官代码具体部位器官代码具体部位胚胎T01脐带T03胎盘T02(九)其他Z器官代码具体部位其他Z01备注:1、腹腔、盆腔的韧带归到系膜里面。2、声带的肿瘤手术器官为“喉”。附表2、样本类型代码表以下样本类型编号中,采用2位编号,今后如果有细分的需要指定来源的衍生物,可以增加定义2位编号,在需要通过编号区别来源的情况下,可参考以下表格中的3位编号,细胞系的传代数暂时不列入现有样本库编号范围。样本类型样本代码样本衍生物代码细胞系DNARNA蛋白mRNA01234肿瘤组织T组织的样本代码:左边和右边的编号自由组合新鲜组织(T)T10T11T12T13T14正常组织N冻存组织(F)T20T21T22T23T24癌旁组织P石蜡组织(P)/T31T32T33T34转移组织M冷冻切片(C)/T41T42T43T44淋巴组织L石蜡切片(L)/T51T52T53T54组织-息肉Y非特指细胞系(C)/////组织-囊壁C非特指DNA(D)/////非特指RNA(R)/////非特指蛋白(Q)/////非特指mRNA(M)/////血液Blood全血(BB)B10B11B12B13B14血浆(BP)///B23/血清(BS)///B33/红细胞(BE)//B42B43B44白细胞(BW)B50B51B52B53B54血小板(BT)///B63/非特指细胞系(BC)/////非特指DNA(BD)/////非特指RNA(BR)/////非特指蛋白(BQ)/////非特指mRNA(BM)/////胆汁gall胆汁(G1)G10G11G12G13G14胆石(G2)/////胆汁细胞系(GC)/////胆汁DNA(GD)/////胆汁RNA(GR)/////胆汁蛋白(GP)/////胆汁mRNA(GM)/////胰液pancreaticjuice胰液(Y1)Y10Y11Y12Y13Y14胰石(Y2)/////胰液细胞系(YC)/////胰液DNA(YD)/////胰液RNA(YR)/////胰液蛋白(YP)/////胰液mRNA(YM)/////脑脊液脑脊液(Z1)///Z13/脑脊液细胞(Z2)Z20Z21Z22Z23Z24脑脊液上清(Z3)///Z33/非特指细胞系(ZC)/////非特指DNA(ZD)/////非特指RNA(ZR)/////非特指蛋白(ZP)/////非特指mRNA(ZM)/////心包液heart心包液(H1)///H13/心包液细胞(H2)H20H21H22H23H24心包液上清(H3)///H33/非特指细胞系(HC)/////非特指DNA(HD)/////非特指RNA(HR)/////非特指蛋白(HP)/////非特指mRNA(HM)/////胸腔积液chest胸腔积液(X1)///X13/胸腔积液细胞(X2)X20X21X22X23X24胸腔积液上清(X3)///X33/非特指细胞系(XC)/////非特指DNA(XD)/////非特指RNA(XR)/////非特指蛋白(XP)/////非特指mRNA(XM)/////腹腔积液abdomen腹腔积液(A1)///A13/腹腔积液细胞(A2)A20A21A22A23A24腹腔积液上清(A3)///A33/非特指细胞系(AC)/////非特指DNA(AD)/////非特指RNA(AR)/////非特指蛋白(AP)/////非特指mRNA(AM)/////关节腔液joint关节腔液(J1)///J13/关节腔液细胞(J2)J20J21J22J23J24关节腔液上清(J3)///J33/非特指细胞系(JC)/////非特指DNA(JD)/////非特指RNA(JR)/////非特指蛋白(JP)/////非特指mRNA(JM)/////精液semen精液(S1)S10S11S12S13S14精子(S2)S20S21S22S23S24精浆(S3)S30S31S32S33S34非特指细胞系(SC)/////非特指DNA(SD)/////非特指RNA(SR)/////非特指蛋白(SP)/////非特指mRNA(SM)/////卵细胞egg卵细胞(E1)E10E11E12E13E14卵细胞细胞系(EC)/////卵细胞DNA(ED)/////卵细胞RNA(ER)/////卵细胞蛋白(EP)/////卵细胞mRNA(EM)/////排泄物waste尿液(W1)///W13/粪便(W2)/////尿液蛋白(WP)/////

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