内含子-外显子预测网站

推荐几个不错的RNA剪接位点（内含子/外显子）预测网站2011-01-1120:36分析基因组数据时，经常需要预测基因的RNA选择性剪切方式，即内含子和外显子的位置和数量。预测是基于RNA剪接的保守性序列“GU－AG”规则，即内含子5’端序列一般是GU，而3’端一般是AG，当然它们附近的序列也是有一定规律的，但不是很保守。根据这一特点并结合ORF,Blast等数据就可以对未知基因的成熟mRNA序列进行预测。下面我推荐几个比较专业的RNA剪切预测网站：1.Augustus（功能相当强大，预测比较准确，并没有特种特异性，强烈推荐）2.SplicePort（功能也很全面，推荐）3.GeneSplicer（只针对以下几个物种：Plasmodiumfalciparum(malaria),Arabidopsisthaliana,human,Drosophila,andrice）4.NetGene2（只针对：Human,C.elegans,A.thaliana）5.MaxEntScan（只针对Human）PS：以上只针对某某物种的不代表其它物种不支持，只是结果可能不很准确，对于同一基因，可以参考结合以上不同的服务器给出的结果。希望以上网站对需要的朋友有所帮助，如果您有什么问题，也可以在下面留言交流。