Avizo软件的基础知识

Avizo软件的基础知识报告人：张凯课题组：多学科同步辐射形貌站报告提纲Avizo的发展简介用户界面介绍常用的命令模块1232013-11-273Avizo的发展简介1软件的介绍2004年：TGS公司，Amira。2009年重组为VisualizationSciencesGroupofMercuryComputerSystems。2011年收购VISILOG软件。2012年7月获得Amira所有资产。2012年8月FEI公司收购2013-11-275Avizo软件的介绍Avizo软件是VSG最新推出的专门针对地球地质科学、材料科学以及CAE工程计算等一款强大可视化软件产品功能：高级的三维可视化功能：●表面渲染通过丰富的绘图模式和色彩配置使我们得到更具意义、更丰富的三维显示效果；●体渲染执行基于物理学的光线发射/吸收原理的直接三维图象数据渲染；科学可视化：●流场数据：通过高级的矢量场可视化显示三维模型内部的流动仿真结果●标量、矢量和张量可视化：通过等值面来显示标量信息，并进行限制染色和假染色。显示线性积分卷积，流线，表面和彩带。充分利用内置的张量可视化功能，比如张量场的图标化显示，特征值提取和应力等级张量评估。●Matlab®桥梁通过整合Matlab®的微积分学模块，能够进行微积分的数据处理。通过在Avizo的应用进程中连接Matlab服务器，直接进行Avizo数据的Matlab估算。从/到Avizo中输入/输出Matlab矩阵格式数据。输出Avizo表面到Matlab表面2013-11-276Avizo软件的介绍3D数据勘测与分析：●观看与导航在一个或多个窗口中显示一个或多个数据，并且能够灵活进行导航操作●切片/剪切通过一个或多个正切、斜切面来快速显示数据内部切片情况，通过剪切来显示隐藏的数据●数据分析交互式的查询模型任意位置的精确数据，显示或者将数据输出到电子表格或其他制图工具以便进一步分析。并可通过统计学模块进行密度、距离、面积、体积等数据的计算和量化。数据获取●数据输入直接进行数据导入到Avizo。Avizo支持大量标准格式文件的数据导入。●时序数据处理单时间步和多时间步数据为表面流动数据●数据处理与过滤通过一系列的数字过滤器、编辑器、数据处理模块对3D图象进行简单有效的处理图象数据处理●图象配准、溶解、对齐排列配准多个数据集以进行多数据对比、图象溶解。熔合多模型数据以增加信息量和模型精确度。●图象分割基于个别象素分配做出不同的标记以鉴别区分不同的结构来生成3维模型，以及进一步的数据分析任务2013-11-277Avizo软件的介绍三维重构●几何模型从图象信息的处理、几何体的计算到重构生成高分辨率的三维显示图象，Avizo采用创新高效的运算法则，将CT、MRT设备，三维超声设备，共焦显微镜等生成的切片数据进行精确的三维体重构。●表面重构使用创新的加速度科技，快速执行表面重构技术●表面简化采用目前市场上最精确的运算法则之一，适当的减少模型表面多边形的数量以适应低端设备或网络发布的需要。交流●发布最优化的质量将结果发布在相应的数字媒体上，如ppt，web2013-11-278Avizo软件的介绍2013-11-279AvizoFire软件的介绍Avizo®Firesoftwareistheadvanced3Dvisualizationandanalysissoftwareapplicationforexploringmaterialssciencedatafromtomography,microscopy,MRI,andmoretechniques.Fromstraightforwardvisualizationandmeasurementtoadvancedimageprocessing,quantificationandskeletonization,AvizoFireprovidesacomprehensive,multimodalitydigitallabforadvanced2Dand3Dvisualization,materialscharacterization,3DmodelgenerationforFEA,andcalculationofphysicalproperties.•图像处理•图像分割•3D可视化显示•数据定量分析•展示、动画制作。油页岩3D成像演示最低配置1.32位操作系统（windows，MacOSX，Linux（支持64位））2.2G内存3.最低1024x768分辨率的显示器4.主频2G，CPU理想的电脑配置1.64位常用操作系统2.32G内存3.万元级别的专业显卡4.固态硬盘5.多核CPU2013-11-2710AvizoFire软件的介绍2013-11-2711用户界面介绍2软件界面介绍，基本工具箱介绍2013-11-2712AvizoFire软件的介绍图像显示窗口属性窗口命令行窗口，帮助窗口工程视图窗口常用工具栏2013-11-2713AvizoFire软件的介绍工程视图窗口，每个object代表一个操作、显示或数据2013-11-2714AvizoFire软件的介绍属性窗口，每个模块的属性信息，参数设置工程视图窗口属性窗口2013-11-2715AvizoFire软件的介绍视图窗口，图像显示，处理结果显示2013-11-2716AvizoFire软件的介绍命令行窗口，帮助信息，当前命令的处理结果，命令行操作输入2013-11-2717AvizoFire软件的介绍菜单栏视图工具栏常用快捷按钮打开数据保存数据新建工程打开已有工程保存工程系统设置隐藏视图，属性视图窗口打开视图窗口打开属性窗口打开命令窗口打开颜色表打开动画打开图表窗口帮助区域选取图像转动图像移动图像缩放图像旋转获取属性回到原点正交视图定点缩放视图显示切换立体声属性测量截图多窗口切换显示2013-11-2718AvizoFire软件的介绍File文件输出输入Edit数据操作Project视图显示，数据对象操作2013-11-2719AvizoFire软件的介绍View光线、背景色设置等Window各个窗口显示控制Help帮助文档，license管理2013-11-2720常用的命令模块3Avizo命令参数介绍2013-11-2721AvizoFire软件的介绍视图窗口，在每个模块上面右键单击，会显示所支持的命令，左键单击会显示提示信息。点击Creat按钮，可以创建该命令模块。2013-11-2722AvizoFire软件的介绍快速搜素命令模块Favorite：最近使用频率较高的命令模块Recents：刚刚使用过的命令模块Editors：输入数据的裁剪，信息查看等操作Templates：自定义模板Animate：动画制作Annotate：标尺、标题添加模块Compute：数学运算（+，-等），逻辑运算（与，非），图像操作（对齐，体数据裁剪）Convert：16bit8bit图像等Display：所有的显示命令模块：2D，3DGeometryTransforms：坐标变换等ImageProcessing：图像处理，滤波函数，开闭运算等Imagesegmentation：图像分割模块MeasureAndAnalyze：测量和数据定量分析图像数据的读入：CT图像数据，二进制Raw数据，2013-11-2723AvizoFire软件的介绍•工具栏：File菜单Opendataas•工程视图窗口：Opendata图片数据输入：FileOpendataas2013-11-2724AvizoFire软件的介绍1.选择数据类型，2设置channelconversion，3设置voxelsize2013-11-2725文件头图像数据AvizoFire软件的介绍自定义二进制数据输入：FileOpendataas文件头：记录图像数据的相关信息：压缩格式，颜色表，数据大小。Raw数据格式，是用户自定义的数据。要求知道文件头的大小，数据类型，数据大小。2013-11-2726AvizoFire软件的介绍自定义二进制数据输入：FileOpendata1.选择datatype2.设置Dimensions3.设置Header4.确认requested和Filesize是否相等5.设置voxelsizeRaw数据格式，是用户自定义的数据。要求知道文件头的大小，数据类型，数据大小。大量数据的读入LargeDiskData2013-11-2727AvizoFire软件的介绍storetheimagedatainaspecialformatthatfacilitatestherandomretrievalofdatafromdisk.•File菜单ConvertToLargeDataFormat常用命令模块：数据的裁剪2013-11-2728AvizoFire软件的介绍1.导入数据2.生成*.am数据模块3.左键单击*.am数据模块。4.在属性窗口，点击红框所示按钮，弹出Help菜单.5.更改Minindex和Maxindex值，选择所需要的图像区域。6.点击OK2013-11-2729AvizoFire软件的介绍常用命令模块：Display菜单orthoslice断层图像显示Orientation：显示不同方向的切片SliceNumber：第几层断层Colormap：颜色表，可更改最小，最大值，从而改变图像显示范围2013-11-2730常用命令模块：Favorites文件夹BoundingBoxAvizoFire软件的介绍2013-11-2731常用命令模块：Favorites文件夹slice的使用orthoslicesliceAvizoFire软件的介绍2013-11-2732AvizoFire软件的介绍常用命令模块：Favorites文件夹slice的使用1.选择rotate，2选取箭头工具4，在视图窗口转动图像2013-11-2733常用命令模块：Display菜单VolumeRendering3D透视图像显示AvizoFire软件的介绍AlphaScale：透明度的设置Colormap：颜色表更改，显示范围更改2013-11-2734AvizoFire软件的介绍常用命令模块：Display菜单Isosurface3D等值图像显示Threshold：更改阈值Apply2013-11-2735AvizoFire软件的介绍常用命令模块：Compute菜单VolumeOperationVolumeedit1.添加Volumeedit命令行2.属性窗口选择Cut选项.3鼠标选择去除区域，4.点击Apply3D图像裁剪2013-11-2736AvizoFire软件的介绍Volumeedit标尺，标题的添加2013-11-2737AvizoFire软件的介绍1.Scalebars的使用2.Caption的使用2013-11-2738AvizoFire软件的介绍常用命令模块：Annotate菜单ScalebarsPosX，PosY，PosZ标尺位置Frame：X，Y方向是否选用Unit：标尺的单位：um，cm等Color：标尺颜色Linewidth：标尺粗细2013-11-2739AvizoFire软件的介绍常用命令模块：Annotate菜单CaptionText：输入文字信息Font：字体颜色Absolutionposition：标题位置谢谢!ThanksforYourTime!