分子生物学国家重点实验室

分子生物学国家重点实验室工作报告（2001.01－2005.12）金由辛中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、发展规划与设想报告内容历史沿革论证1984验收1986生物口第一个论证开放的国家重点实验室第二届第三届第四届第一届1987-19902001-20051996-20001991-1995基因组织特异、细胞分化、形态、胆固醇等基因组学1987年研究方向生物大分子的结构与功能分子遗传学生物膜的结构与功能HUGO计划结束后的现状预计的10万基因降到24500，只占总基因组的2％以下基因的表达、调控与功能研究方向一、研究工作与成果编码RNA非编码RNA3’非翻译区（抑癌）RNA组学与合成酶识别，调控染色体染色体开放DNA甲基化表观遗传学端粒（长寿与癌症）紧密结合“人口与健康”这一国家重大需求,为防治人类重要疾病、培养生物新品种提供理论依据，建成一个在分子生物学领域从事基础性研究的实验室，跻身国际前列，并为我国国民经济建设作出贡献。总体定位认识未知的世界,突出原创性(基础性研究)建立研究系统和新的实验技术(国际前列)为解决国家重大需求作贡献(国家需求)一、研究工作与成果承担任务类别课题数主持经费(万元)97310713918631410995863攻关11689基金委重大331716基金委4141上海市23231168中科院14141891小计106997850姓名合作项目经费年度合作方式张永莲美国NIHFogarty项目基金9.6万USD2002-2004合作研究徐国良中科院与德国马普学会20万EU2002-2007联合资助管理周金秋中科院与德国马普学会20万EU2002-2007联合资助管理徐国良欧盟国际合作项目5万EU2005-2008合作研究承担国外研究项目一、研究工作与成果研究总经费2001-2005年，共11618万科研经费：7850万管理费：750万依托单位投入：2718万设备更新费：300万组均经费800余万一、研究工作与成果2001-2005年，共发表论文220篇，其中SCI论文206篇，联系作者/第一作者197篇。SCI论文总影响因子646。论文中有152篇被引用，总引用频次1041次，其中他引820次。合计发表IF4论文57篇（上届12篇）。论文发表情况一、研究工作与成果期刊IF篇数Science31.81Cell28.41NatCellBiol20.61MolCell16.81EMBOJ10.51合计5期刊IF篇数CellDeathDiffer8.21CancerRes7.72NucleicAcidsRes7.39Development7.11JBiolChem6.413Oncogene6.32合计28期刊IF篇数MolMicrbiol6.02MolEndocrinol5.92Leukemia5.81Endocrinology5.23GeneTher5.01BiochemJ4.37Biochemistry4.08合计24论文发表情况比较0501001502002501996-20002001-2005年度论文篇数论文总数国外论文IF他引次数122.620646820199220591330510152025301996-20002001-2005年度论文篇数IF106IF104IF672455280一、研究工作与成果获奖情况王恩多（2001）刘望夷（2005）一、研究工作与成果上海市科技进步奖戚正武（2003）戚正武（2005）刘望夷（2003）一等奖二等奖三等奖国家自然科学二等奖专利已申请发明专利39项已获批准授权发明专利20项（1项国际）一、研究工作与成果一、研究工作与成果代表性研究成果成果2成果5成果3成果1成果4基因的表达、调控与功能基因组学RNA组学表观遗传学人类生殖系统发育与疾病研究真核生物的生殖与发育是当今生物学研究热点之一，生殖细胞的分化发育与形态发生在人口与健康问题的研究中占有重要的地位。主要完成人：张永莲、陈江野、金由辛等代表性研究成果（一）附睾自身免疫系统天然抗菌肽起始精子运动ScienceMarch1,2001使21世纪追求的既能避孕，又能防止性传播感染的双功能药物的出现成为可能NatureCellBiologyMay1,2004迄今为止，被发现的第一个附睾蛋白质与精子作用后刺激其功能Bin1b基因代表性研究成果（一）ScienceEditorialComments:“ACondominPillForm?”NewfindingsmayofferaleadfordevelopingadrugthatoffersbothcontraceptionandSTDprevention.Chineseresearchershaveidentifiedapeptide,calledBin1b,thatisexpressedinthemalerat'sreproductivetract,andseemstohaveequivalentsinhumansandchimpanzees.Thepeptideisrelatedtoagroupofotheranti-microbialmoleculescalledß-defensins,andisexpressedonlyinthesexorgancalledtheepididymus,whichmaybeareservoirforsexuallytransmittedbacteriaandviruses,includingHIV.Inadditiontoshowingantimicrobialactivity,Bin1bisalsoresponsibleforspermmaturation,storage,andprotection,suggestingthatthepeptidemaybeausefultargetfordrugsthatwouldbothstopspermproductionandprotectagainstSTDs.科学编辑短评：药片型的避孕套中国研究者的这一新发现可能提供引导一种既可避孕又能防止性传播感染的双功能药物的出现......代表性研究成果（一）发表在Science的文章在国际上引起巨大反响，已被他引72次。在国际上掀起了附睾-defensin自身防御机制和男性避孕的研究高潮。共发表SCI论文11篇，平均每篇的IF值8.0，他引频次达13次。张永莲2001年当选中科院院士，获2002年度何梁何利生命科学奖和2004年度上海市科技功臣称号。获得美国Fogarty基金会的连续资助。获973一项、基金委重点两项、863两项、中科院重要方向性项目一项和上海市重大项目一项的支持。成果一小结代表性研究成果（一）氨基酰-tRNA合成酶与相关tRNA的相互作用在维持正常生命活动中的功能催化蛋白质生物合成关键酶主要完成人：王恩多、金由辛等代表性研究成果（二）代表性研究成果（二）为阐明蛋白质生物合成精确性的机理作出了贡献，为药物设计提供潜在的靶点。NucleicAcidsRes,JBiolChem,BiochemJ各4篇，Biochem.2篇现代的LeuRS可能是由双链进化而来。20氨基酸结构模体犹如LeuRS的进化遗迹。(人的阑尾?)LeuRS独立的CP1结构域可与tRNA的进化早期的小螺旋相互作用，从另一个角度证明了aaRS/tRNA共进化。EMBOJ四位审稿人的一致好评。认为该研究为合成酶与tRNA共进化理论提供了依据，将影响许多研究项目的提出。代表性研究成果（二）发表研究论文20篇，平均影响因子5.3；已被73篇研究论文引用。王恩多研究员2005年当选中科院院士。获国家自然科学奖二等奖（王恩多等，2001）获全国优秀博士论文（李勇，2002）成果二小结代表性研究成果（二）染色体和染色质结构的稳定与白血病发生的相关性主要完成人：徐国良、周金秋等Science2002,297:1824-1827核小体代表性研究成果（三）Cell121,167-178,2005代表性研究成果（三）MedicalScienceNews中对该论文作出如下评论：“这项基于小鼠骨髓细胞的研究发现为开发AML急性白血病治疗新药提供了潜在靶点”。第一次证明表观遗传学方面的改变引发了白血病。发表了Cell、JBiolChem、BiochemJ等论文，2005年发表的Cell论文，当年引用频次9次。中国科学院“百人计划”终期评估为“优秀”，获得100万元后续资助。获国外3项经费支持，其中德国马普学会2项，欧盟合作项目1项，合计45万欧元。获973两项、国家杰青两项、中科院百人计划2项和上海市项目等支持。成果三小结代表性研究成果（三）脂类代谢的细胞和分子机制研究针对肥胖与心血管疾病。发表了CellDeathandDiffer、JBiolChem、BiochemJ等论文。发表影响因子大于6的研究论文5篇。一篇发表在JBiolChem上的论文他引达42次。廖侃进入国家基金委创新群体。获得973、863、基金委重大、中科院和上海市项目等支持。英国FutureCardiology约稿综述。主要完成人：廖侃、李伯良等代表性研究成果（四）MembraneCholesterol7q31P71q25P1DexInsulinIFN-TNF-InsulinDexTrans-splicedCis-splicedP1transcriptP7transcriptExonXbAUGNon-AUGCEACAT1mRNAsExport56Acat1DynamicsoffreecholesterolpoolFCpoolSignalExonXaExons1-165650505056505050565650505656505056565650565656505656565656565050505050505050TranslationACAT1mRNAsJBCJBCJBCinpreparationCellResABBSAcat2APPBBRC,ABBS,BJ,inpreparationLipidraftsTransmembranereceptorLipidraftsTransmembranereceptorCaveolaeTransmembranereceptorProteins此工作为系统工作，获得2003年度上海市科技进步二等奖和2005年国家自然科学奖二等奖。获国家基金委面上项目1项，中科院重要方向性项目1项，研究所、实验室继续资助经费。代表性研究成果（五）核糖体失活蛋白及核糖体RNA结构与功能主要完成人：刘望夷等核糖体失活蛋白（RIP）专一失活核糖体，导致细胞死亡。它可用作抗癌抗病毒感染药物或杀虫剂等，也可作为研究rRNA结构与功能的工具酶。SCI论文IF他引备注全室206646820－－代表性成果成果11187.5142Science文章，当选院士成果21589.536当选院士，国家自然科学奖二等奖成果3549.225Cell文章成果41041.975加入基金委创新群体成果51134.129国家自然科学二等奖25项成果22131.8315专著1部，发明专利2项上述成果占全室％37％67％76％－－代表性研究成果总结工作连续，系统性强成果影响力大，获奖多在顶尖杂志上发表论文创新文化成绩卓越科学编辑短评－药片型的避孕套第一次证明表观遗传学方面的改变引发了白血病他引173次证明了tRNA与合成酶的共进化一、研究工作与成果一、研究工作与成果二、队伍建设与人才培养三、国内外地位与优势四、发展规划与设想报告内容博士26%硕士28%本科32%其他14%队伍建设二、队伍建设与人才培养45岁60%45-55岁14%55岁26%高级44%副高级12%中级16%初级28%现有科研人员43人本届期间先后有院士7