测序技术能替代微生物检验技术

NGS能取代微生物学传统技术无锡市第二人民医院检验科传统微生物检测技术病原检出阳性率低，培养时间长病原颗粒抗原/抗体代谢产物涂片培养免疫学质谱生化鉴定疑难感染病原-经典案例14岁联合免疫缺陷综合征男孩8个月2013年旅行后脑膜炎住院6周内-38项感染病原检测5种抗生素经验治疗48小时脑脊液高通量测序钩端螺旋体475条序列，更换青霉素32天痊愈出院鉴定疑难感染病原-经典案例鉴定疑难感染病原-经典案例-中国上海华山医院感染科——“战狼3”输入性非洲锥虫病：中国感染与疾控团队的72小时救援鉴定疑难感染病原-经典案例-中国上海华山医院鉴定新发病原体——猪疱疹病毒跨物种传播2017年6月，江西女性患者，反复发热，头痛两周，视力下降。病情恶化,转诊到上海华山医院，全面检查均未明确病原体。手术眼玻璃体液送至宏基因组测序平台，36小时传来报告:测出4832条猪疱疹病毒序列，确诊病原体。由抗生素转为抗病毒治疗，一周后患者体温正常，视力稳定，出院后定期随访,最终治愈。经过调查，该患者来自江西某养殖场，曾被污水泼溅入双眼。上海专家远赴江西采取样本检测，明确了病毒跨种传播路径。该研究发表于美国疾控中心主办的权威杂志。该案例引起中国国家疾控系统的高层重视,推动了新发感染精准诊治的政策落地。鉴定疑难感染病原-经典案例-中国北京协和医院鉴定新发病原体——猪疱疹病毒跨物种传播鉴定疑难感染病原-经典案例-中国上海中山医院——“中山探索系列”快速鉴定新发病原体重大传染病传染病暴发的溯源重大传染病西非肆掠的埃博拉病毒的遗传多样性和传播途径的分析GenomicsurveillanceelucidatesEbolavirusoriginandtransmissionduringthe2014outbreak.2014年2月从几内亚开始，3月到利比里亚，5月塞拉利昂，7月末到尼日利亚病例指数增长Newgenomictechnologiescanprovidenear-real-timeinsightsintothepathogen'sorigin,transmissiondynamics,andevolution.如何进入并在人群中传播，变异情况，是否有来自自然宿主的新毒株？来自血流、肺部、CNS、脓肿等不同感染部位和不同的标本类型来自血流、肺部、CNS、脓肿等不同感染部位和不同的标本类型mNGS用于ICU脓毒症患者的病原学诊断(血液)mNGS用于肺部感染患者的病原学诊断(肺组织)mNGS用于中枢神经系统感染患者的病原学诊断(脑脊液)mNGS在检测不同来源脓肿标本方面的技术优势(脓肿标本)mNGS用于骨关节感染患者的病原学诊断(骨关节液)检测出细菌、病毒、真菌、寄生虫等不同的病原体检测出细菌、病毒、真菌、寄生虫等不同的病原体mNGS用于诊断罕见肺外肝结核(结核杆菌)mNGS用于诊断新发传染病(猪疱疹病毒)mNGS用于诊断真菌感染(耶氏肺孢子菌)mNGS用于诊断实质外脑囊虫病(脑囊虫)受惠于儿童、青年、老人、免疫缺陷等不同的人群受惠于儿童、青年、老人、免疫缺陷等不同的人群mNGS用于儿童肺炎病原学探查罕见肺外肝结核(儿童)mNGS用于检出罕见鼻病毒和博卡病毒混合感染(青年女性)mNGS用于免疫缺陷人群病原学诊断队列研究(免疫缺陷患者)mNGS用于老年人关节感染病原诊断(老年人)Nature、NEJM、Cell、CID、JCM等超高水平的文章层出不穷Nature、NEJM、Cell、CID、JCM等超高水平的文章层出不穷mNGS测序将变革临床病原检测中国科学家Cell重要评述文章:mNGS成为病毒分类新方法技术变革带来急性和慢性肺部感染管理新机遇新诊断工具mNGS用于临床的机遇及挑战mNGS临床应用离现实更近一步测序技术NGS（nextgenerationsequencing），又称高通量测序技术，一次并行能对几十万到几百万条DNA分子进行测序。测序技术的发展测序撒网捕鱼&靶向钓鱼Sanger测序技术测序技术能取代传统微生物检验技术！！！谢谢大家Thankyou