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第一章决斗学院、入学在标题画面选择NewGame，那么就开始了校园生活了十代带领探索校园条件：早上在自己屋子选择外出到了学校，入学仪式结束后就回到宿舍。出门的时候，就看到十代，带着你游校园第二章校园生活开始帮助多美婶条件：睡觉后第二天上学发生在上学的途中见到多美婶运货，和十代帮忙。晚上的灯台……条件：晚上去灯台晚上去岛西部的灯台，发现明日香和蓝宿舍的学生交谈。和十代的第一次决斗条件：LV4以上，晚上在自己宿舍选择睡觉十代到宿舍探访，并提出决斗请求。（注：此事件似乎和下面的事件没有先后顺序）袭击蓝学生的迷之巨人条件：大原、小原各战胜2次，金曜日以外的平日放学后放学后克罗诺斯教授说现在出现了迷之巨人袭击学生，要求帮忙调查晚上回宿舍后十代前来通知，说出门搜索巨人。在岛东部搜索到蓝宿舍的学生，告知巨人出现了。之后去岛南部发现犯人。（事件后取巻太阳、慕谷雷蔵可对战）和万丈目的激斗条件：蓝宿舍2人取巻、慕谷各2胜，5日后晚上发生万丈目的跟班被欺负了，回去找万丈目出面。万丈目发出挑战，叫翔来传话。到岛南部湖边（事件标记！）迎战。（事件后枕田ジュンコ、浜口ももえ可对战）冰之女王·明日香条件：蓝宿舍女生2人枕田、浜口各2胜，晚上发生晚上回宿舍后明日香发来信息，约在女宿舍见面，应约前去女宿舍，被当作去偷窥被抓，明日香出面并没有解释而是说决斗赢了就相信你。和明日香决斗。第三章在红宿舍大活跃和精灵的相遇条件：自己宿舍，晚上，LV6以上选择睡觉晚上睡觉的时候似乎听到了精灵的声音，随着声音出门，在岛北部的古井发现了精灵。（到岛北部的枯井能发现3个精灵的其中一个。随机的其中一个。详细的精灵介绍参考关于精灵的资料贴=275190）决斗实力诊断测验条件：教室，早上，1天后，金曜日以外的平日放学后通知第二天会有决斗实力诊断测验。第二天放学后移动到教学楼的决斗场。和万丈目进行决斗。六属性卡组的决斗者条件：黄宿舍，1天后的平日平时闲逛寻找决斗的时候，去黄宿舍看看，遇到了入学考试第一的秀才三泽。三泽发出了挑战。迷之转校生礼条件：蓝宿舍，1天后红宿舍多了一个转校生，礼。礼刚来就不断打听凯撒的事情。后来去蓝宿舍，发现礼潜进去凯撒的房间。结果被蓝宿舍的学生发现一起逃走。之后在岛北部搜索发现礼，礼说如果决斗战胜她就说出身份和前来的原因。击败礼后，礼告知其实她是小五的学生，因为暗恋凯撒所以偷偷前来（事件后，在周一的考试获取10分或者考试累计15分，在那个星期的周末将会出现定期船。在码头能看到定期船确定是否出现了）胜利的方程式条件：自己宿舍，1天后礼走了后的第二天，三泽前来挑战。自从上次落败后他已经研究出了胜利的方程式，所以再次挑战。隼人的烦恼条件：岛西部，遇到隼人发生在岛西部搜索决斗者的时候发现隼人，隼人不见了卡正在找卡。隼人做事慌张似乎还有烦恼，于是乎提出决斗，用决斗提起精神。探索幽灵屋条件：自己宿舍，晚上，LV9以上的土日月火曜日晚上大家在饭堂在说鬼故事，其中大德寺老师提到了学校里面存在的幽灵屋。第二天晚上睡觉前十代前来，说一起去看看幽灵屋。跟十代一起到岛北部的幽灵屋，结果发现使用暗黑决斗的决斗者泰坦。进行决斗。决斗！迷宫兄弟条件：教室，早上放学后克罗诺斯教授训话。因为擅自进入不许靠近的幽灵屋，克罗诺斯教授要进行处罚，对违规学生勒令退学。但是给了机会，如果能胜出明天的决斗就不再追究。第二天放学后开始决斗，对手是曾经令传说中的决斗王武藤游戏都陷入苦战的迷宫兄弟。第一战十代Vs迷宫兄，十代提出帮忙调整卡组。帮十代调整卡组后十代开始决斗。十代战胜后，第二战亲自跟迷宫弟决斗。不再彷徨条件：岛东部，战胜迷宫兄弟的3日后在岛东部发现隼人在沙滩（事件标记！）。隼人因为收到父亲的问候来信，而自己成绩却非常差而烦恼。跟隼人决斗让隼人通过决斗鼓起信心。3日后的早上，隼人来访，说自己已经相通了。（事件后隼人在地图上出现，可以决斗）万丈目的再次挑战条件：岛南部，隼人来访后的第二天以后万丈目之前落败2次，所以继续挑战。在岛南部的湖边发现万丈目（事件标记！），战胜万丈目后，万丈目离去。第二天之后，晚上在灯台见到明日香，明日香告知自从万丈目再败后，万丈目就失踪了。卡片精灵杀人事件条件：自己宿舍，晚上，万丈目失踪第二天后，金曜日以外的平日放学后翔说最近出现了学生失踪时间，异灵研究会会长高寺告知情况。晚上回到宿舍后精灵有反映，感觉不安，于是乎出门，在红宿舍附近发现发电厂不正常。到了发电厂后发现卡片精灵人造人用活人作祭品，为了救出高寺于是乎挑战人造人。（事件后高寺在地图上出现，可以决斗）第四章学校对抗赛，决斗！剑山登场条件：岛西部，LV11以上，战胜过神乐1次后的平日在岛西部可以搜索出决斗者神乐。战胜神乐后，发现红宿舍附近有可疑人出没（事件标记！），走过去发现是一个穿着黄宿舍校服、叫做剑山的学生。剑山跳出了决斗的请求。传说中决斗王的卡组条件：岛南部，晚上，1日后的平日第二天放学后，得知学校有传说中决斗王武藤游戏的卡组展览。后来被告知卡组已经被盗。晚上入夜后，在岛西部发现神乐。翔被轻易战胜，接着便是挑战神乐使用的武藤游戏卡组。再见剑山条件：自己宿舍，晚上，2日后晚上回到宿舍，剑山来访，再次提出决斗请求。答应后出门在红宿舍门口决斗（事件标记！）。成为学院的代表条件：教室，早上，LV13以上的平日放学后，学校公告要选出本校的代表，去参加代表选拔。另2个候选者是十代和三泽。去教学楼的决斗场开始决斗。第一场VS三泽，之后十代战胜三泽，最后VS十代，战胜后获得代表权。（事件后因为已经成为校园代表，可以跟教授决斗）再见了，剑山条件：岛西部，2日后在红宿舍附近又见到了剑山（事件标记！），剑山再次提出决斗。战胜剑山后，剑山告知自己喜欢决斗，而决斗学院很多决斗者，所以他偷偷前来。校服是抢回来的，并不是正规的学生，不过有自信明年能考入决斗学院。之后剑山坐船走了。一·十·百·千·万——万丈目闪电！条件：教室，早上，LV15以上金曜日以外的平日放学后被通知明天就是校园对抗赛了。第二天放学后集体到码头迎接北校代表，发现北校代表居然是万丈目。整顿好后到教学楼的决斗场，和万丈目进行3局2胜的Match战。战胜万丈目后，万丈目选择留在决斗学院而不回去北校。第五章七精门之键（进入此章，在周一的考试获取10分或者考试累计15分，在那个星期的周日将会出现潜水艇。在码头能看到潜水艇确定是否出现了）三幻魔和七精门条件：2日后金曜日以外的平日放学后大德寺老师通知去校长室集中。到教学楼的校长室，校长告知校园沉睡着三幻魔，现在有叫做七星的组织前来夺取封印三幻魔的七精门之键，现在7把钥匙分别给与7个决斗者保管。Darkness条件：岛西部，晚上晚上在岛西部发现十代，交谈中精灵有反应，附近出现不知名力量，被移动到了火山口。七星之一的Darkness出现，翔和隼人被作为人质，被逼决斗。战胜Darkness后亮和明日香赶到，发现Darkness居然就是明日香的哥哥吹雪。湖边的美女条件：2日后的平日放学后大家谈论中听到湖边出现了不知名的美女。三泽前来通知大家到校长室。到了校长室，大家谈论湖边美女，怀疑是七星的一员。晚上到岛南部湖边（事件标记！），发现果然是七星之一，吸血鬼卡米拉。卡米拉点名最强的凯撒亮提出决斗，结果凯撒战败被变成玩偶，回到了湖中的恶魔城。为了救回亮，第二天入夜后再去湖边的恶魔城堡，战胜卡米拉后救出凯撒亮。亚马逊的威胁条件：1日后的平日放学后通知到校长室集中。最近很多学生失踪了，怀疑和岛东部最近建立起来的竞技场有关。前去竞技场，发现竞技场是七星之一的タニヤ抓学生建立起来的。先到的三泽迎战タニヤ，战败，被タニヤ抓走。第二天再去竞技场，发现三泽被抓走后就是陪决斗，但是三泽的实力已经满足不了タニヤ。战胜タニヤ后救出大家。（因为三泽发现实力不足，之后可在地图上发现三泽并决斗）犯人就在眼前条件：1日后的平日放学后通知校长室集中。为了保护钥匙，校长请来了魔暮警察帮忙。魔暮警察询问了大家收藏钥匙的地方确保安全性。晚上回宿舍睡觉的时候，十代进来告知大家的钥匙都不见了。出门后在红宿舍附近商量（事件标记！），万丈目推断出凶手就是知道大家钥匙存放点的魔暮警察，魔暮警察承认自己就是七星之一，之后决斗。无败传说的法老王条件：1日后的平日放学的时候听说了关于アビドス3世生涯无败的传说。入夜后去灯台，见到明日香和亮在讨论吹雪的情况。突然来了一只船，来者正是アビドス3世，作为七星之一前来夺取钥匙，为了保护钥匙与之决斗。暗之决斗者条件：无击败アビドス3世后，前去教学楼的医务室探望吹雪。在到达医务室前，明日香遇到了暗之决斗者泰坦，泰坦声称有办法唤醒吹雪骗走了明日香。医务室找不到明日香后回去宿舍，十代和万丈目前来告知明日香失踪了。出门寻找明日香，在岛北部发现幽灵屋出现了，进去后发现泰坦以明日香作要挟提出决斗。第七人之影条件：LV18以上，1日后的平日放学后收到通知去校长室集中。校长说了七星还剩1人，吹雪醒了，大德寺老师失踪的情况。第二天上学前取巻和浜口前来告知吹雪、万丈目和明日香都没有回宿舍。放学后十代提议晚上一起寻找失踪的人。入夜后到岛北部搜索，发现幽灵屋，进去后发现最后一个七星成员アムナエル，战胜后发现原来是大德寺老师，老师本身就是炼金生物。再战大德寺老师。战胜后大德寺老师说预感到不安，不过很高兴有这么优秀的学生，一定能防止灾难的发生。为了成为明日香的未婚夫条件：1日后的平日放学后校长室集中，校长告知情况应该已经稳定下来了。入夜后在红宿舍附近发现万丈目（事件标记！），原来万丈目在偷听明日香和亮的对话，怀疑他们是不是恋人。万丈目原来喜欢明日香。去岛东部见到吹雪在和女生玩耍（事件标记！），被亮也承认实力的吹雪提出决斗，战胜后吹雪说跟他走，跟上（事件标记！）。吹雪原来把万丈目也喊来了，要进行明日香相性决斗，胜出者就是明日香的未婚夫了。（此事件战胜万丈目后，万丈目为了明日香不服输，在地图上出现并可决斗）三幻魔登场条件：无就在战胜万丈目后，岛上出现了异样。虽然保护着钥匙但是因为决斗者的力量让七精门苏醒了。到岛东部的七精门（似乎需要离开1次岛东部才会刷出这个地点），发现幕后黑手是学校的理事长影丸。影丸为了得到长生不老之力所以利用决斗学校的学生决斗发出的能量唤醒三幻魔，再借助三幻魔之力变回年轻。要击败影丸必须在影丸召唤出三幻魔后再战胜才行。最终的决斗开始了，先击败使用降雷皇的影丸，影丸借助幻魔之力变回年轻，再和神炎皇、幻魔皇决斗。第六章迎接2年级的生活隼人离去条件：1日后的平日上课前克罗诺斯教授公布隼人获得了I2社的卡片设计大赛的优胜。晚上回到宿舍，发现隼人不见了，出门寻找，发现隼人在红宿舍附近（事件标记！）。隼人有心事，于是用最好的决斗鼓励隼人。决斗后隼人说得到优胜后帕伽索斯社长邀请他做卡片设计师，现在已经充满自信，并决定离去了。2日后，放学后大家去码头送别隼人。毕业模范决斗条件：3日后的月火水曜日放学后教授说临近毕业，今年的毕业模范生是丸藤亮，亮将会邀请1个学生进行毕业模范决斗。回到宿舍后，亮亲自上门前来邀请参加毕业模范决斗。第二天放学后教授说将要举行毕业模范决斗，去决斗场和丸藤亮进行毕业战送别亮。成为2年级的学生条件：1日后的平日放学后举行升学礼，翔升为黄宿舍的学生。新入生爱德菲尼克斯条件：红宿舍回去红宿舍的时候遇到新入生爱德菲尼克斯（注意使用移动回去红宿舍，用下面图标移动直接回去自己宿舍，不在红宿舍楼下不会诱发事件），爱德提出决斗。事后翔想起爱德是职业决斗者的明星，而刚到的多美婶说爱德的卡组是刚买10包卡、50张卡挑选出的卡组。（游戏的剧情也是这样，不过游戏中的卡组不是临时凑的）剑山入学条件：无跟爱德决斗后，在红宿舍门口发现有人（事件标记！），原来剑山这个学期正式加入决斗校园。剑山提出了决斗请求。（事件后剑山在地图出现并可决斗）凯撒的异变条件：无（有资料说需要1日后，但是本人在上述事件后能直接诱发不需要过1天）去教学楼，在教学楼的楼下见到爱德。爱德告诉了翔自己在职业联赛战胜了凯撒亮。回到宿舍，十