质粒DNA电泳的三条带质粒是细胞内的一种环状的小分子DNA,是进行DNA重组的常用载体。作为一个具有自身复制起点的复制单位独立于细胞的主染色体之外,质粒DNA上携带了部分的基因信息,经过基因表达后使其宿主细胞表现相应的性状。在DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒载体可通过连接外源基因构成重组体。从宿主细胞中提取质粒DNA,是DNA重组技术中最基础的实验技能。分离质粒DNA有三个步骤:1、培养细菌使质粒扩增2、收集和裂解细菌3、分离和纯化质粒DNA碱裂解法是较常用的提取的方法。其优点是得率高,适合于大多数的和菌株,所得产物经纯化后可满足多数的DNA重组操作。此法采取酸碱度高达Ph12.6的碱溶液使DNA发生变性。由于质粒和主染色体的拓扑结构不同,变性时前者虽然两条链分离,但仍然缠绕在一起不分开;而后者完全变性分,甚至出现断裂。因此,当加入中和液时,溶液Ph值恢复较低的近中性水平,此时,质粒的两条小分子单链可迅速复性,恢复双链结构,但是主染色体DNA则无法复性。在离心时,大部分主染色体与细胞碎片,杂质等缠绕一起被沉淀,而可溶性的质粒DNA留在上清夜中。在质粒提取过程中,由于机械力、酸碱度、试剂等的原因,可能使质粒DNA链发生断裂。所以,多数质粒粗提取物中含有三种构型的质粒:共价闭合环状DNA(cccDNA):质粒的两条链没有断裂;超螺旋开环DNA(ocDNA):质粒的一条链断裂;松弛的环状分子线形DNA(lDNA):质粒的两条链均断裂;线性分子质粒DNA的分子构型质粒DNA琼脂塘凝胶电泳模式图(a)松弛线性的DNA;(b)松弛开环的OC构型;(c)超螺旋的SC构型由于琼脂糖中加有嵌入型染料溴化乙锭,因此,在紫外线照射下DNA电泳带成橘黄色。(a)道中的SCDNA走在最前沿,OCDNA则位于凝胶的最后边;(b)道中的LDNA是经核酸内切限制酶切割质粒之后产生的,它在凝胶中的位置介于OCDNA和SCDNA之间三、材料、试剂及器具1、材料E.coliDH5α(pUC19vector)2、试剂1)LB培养基2)TE缓冲液3)裂解液:溶液Ⅰ、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ4)酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)5)无水乙醇6)70%乙醇7)氨苄青霉素50mg/mL器具离心机、离心管、吸嘴四、操作步骤以1%比例把E.coliDH5α(含PUC18)接种于含氨苄青霉素(Amp)100μg/ml)的LB培养基中37℃振摇过夜(12-18h)↓取1.5ml培养物置离心管中↓10000rpm,离心1min,或4000rpm,离心5-10min↓去上清,倒扣干净吸收纸上吸干↓沉淀+100μL溶液Ⅰ↓加或不加入少量溶菌酶粉末;混匀,室温放置10min↓+加200μL溶液Ⅱ(新鲜配置)↓温和颠倒数次,混匀,冰上放置5min↓+150μl溶液Ⅲ→颠倒混匀,冰上放置15min↓离心12000rpm,15min↓上清液+等体积酚:氯仿:异戊醇振匀,12000rpm,离心5min↓小心转移上层至一新的离心管弃下层有机相和中层蛋白质↓上清液+2倍体积无水乙醇混匀,室温5min-10min↓12000rpm,5min-15min↓弃上清沉淀+1mL70%乙醇↓12000rpm离心5min-15min↓弃上清;并倒扣离心管使液体流干↓+自然干燥或真空抽干(看不到液滴为宜)↓加50μlTE缓冲液(20μg/mlRNaseA)溶解质粒粗取物↓-20℃保存六、实验报告检查、保存提取的质粒,要求记录实验现象并说明原因。七、思考题分析以下试剂的作用原理:溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖5mmol/LtrisHCL(Ph8.0)10mmol/LEDTA(PH8.0)溶液Ⅱ:0.4mol/LNaOH2%SDS使用前新鲜配制溶液Ⅲ:5mol/LKac60mL冰醋酸11.5mL水28.5mLRNaseA酶:将粉末溶于10mmol/LtrisHCL(Ph7.5)、15mmol/LNACL中,配成10mg/mL浓度的酶液,于100℃水浴加热15min,缓慢冷却至室温,-20℃保存氯仿无水乙醇