文献汇报1

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汇报人:2014级本科生张静颖全基因组关联研究确定了15q14为屈光不正和近视的敏感位点3.22文献汇报目录01020304研究背景研究方法研究内容研究结果01背景与摘要屈光不正是全世界最常见的眼部疾病,可能导致失明且这一性状高度遗传屈光不正是目前人类视力损害最常见的原因---由眼部生物特征成分的异常协调效应引起分析轻度近视与远视的比值比后发现,相关位点位于视网膜、GJD2和ACTC1中,对可能影响这些基因转录的调节因素进行调控后的数据表明15q14的变异影响屈光不正研究内容分析•对5328个个体的屈光误差进行了全基因组关联研究(主要荷兰)在四个独立的队列中进行复制(共10280个)。在15q14号染色体上发现了一个重要的关联。•轻度近视与远视的比值比后发现等位基因(小等位基因频率=0.47)为个体杂合子的1.41(95%CI1.16-1.70)。等位基因和对于等位基因的纯合子的1.83(95%CI1.42-2.36)。•眼轴伸长导致近视(近视),,而短轴则导致远视(远视)。屈光不正经常引起,眼睛解剖结构的改变,增加了临床眼病的风险。近视可导致青光眼、视网膜等眼部疾病。高度近视会导致后葡萄膜炎和黄斑变性。近视的治疗方法有限,是视力受损的第五大常见原因和第七大常见的致盲原因。屈光不正和近视的病因是复杂的,目前的观点是眼球生长是由视觉诱发的信号级联引起(从视网膜开始,穿过脉络膜,随后进行巩膜重塑。近视的危险因素是教育、阅读、户外曝晒和家族遗传。通过隔离分析:近视患者的复发风险估计的兄弟姐妹(λs)不同,近视的遗传度估计(h2)范围从0.60到0.90(ref.15)。(建议多基因参与,而不是单个主要基因的影响研究背景总体概述•对5328个个体的屈光误差进行了全基因组关联研究(主要荷兰)在四个独立的队列中进行复制(共10280个)。在15q14号染色体上发现了一个重要的关联。•轻度近视与远视的比值比后发现等位基因(小等位基因频率=0.47)为个体杂合子的1.41(95%CI1.16-1.70)。等位基因和对于等位基因的纯合子的1.83(95%CI1.42-2.36)。•眼轴伸长导致近视(近视),,而短轴则导致远视(远视)。屈光不正经常引起,眼睛解剖结构的改变,增加了临床眼病的风险。近视可导致青光眼、视网膜等眼部疾病。高度近视会导致后葡萄膜炎和黄斑变性。近视的治疗方法有限,是视力受损的第五大常见原因和第七大常见的致盲原因。屈光不正和近视的病因是复杂的,目前的观点是眼球生长是由视觉诱发的信号级联引起(从视网膜开始,穿过脉络膜,随后进行巩膜重塑。近视的危险因素是教育、阅读、户外曝晒和家族遗传。通过隔离分析:近视患者的复发风险估计的兄弟姐妹(λs)不同,近视的遗传度估计(h2)范围从0.60到0.90(ref.15)。(建议多基因参与,而不是单个主要基因的影响01研究方法GWAS分析对比观察期望分布logistic回归分析绘制势能函数研究方法GWAS分析(genome-wideassociationstudies)即染色体组或基因组分析我们选取了31个snp分布。四个位点的染色体,(补充表2)为进一步调查四个独立的复制群组:SNP(单核苷酸多样性:在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列,绝大多数核苷酸序列顺序一致而只有一个碱基不同的现象)此方法可以确定基因多态性和近视的关系复制组的分析显示了显著的变化。即15q14(最重要的)的折射误差与轨迹之间的联系。在rs634990结合P=2.21×10−14;表1)。该区域的风险等位基因的频率与整个研究相似。P值在RS-II、RS-III和TwinsUK的14个顶端SNPs中,显著变化(P0.05)logistic回归分析为了确定这个位点对临床相关结果风险的影响在logistic回归分析中,将近视患者与远视者进行比较。证据表明,rs634990的C等位基因导致的近视风险高于。T等位基因(图2)。低至中度或高度近视与低的比值比(或)。中度或高度远视的异型受精卵为1.41(95%CI1.16-1.70),1.83(95%)。为该置信区间1.42--2.36)。研究方法在GOLGA8B(180kbrs634990的5′端)。研究了一个势能函数。这些基因通过检测视网膜上的基因表达水平来促进眼睛生长发育。在死后人类的眼睛(补充表3)并观察到中度至高表达。GJD2和ACTC1的表达和GOLGA8B的低表达。ACTC1对42-kDa平滑肌进行编码。ACTC1在眼睛中的功能作用目前不清楚,但类似的如α-SMA,已被证明是在近视中增加α-SMA影响巩膜中收缩纤维的数量并有助于细胞外基质的重塑GJD2编码36-kDa蛋白Connexin36(也称为CX36和缝隙连接)。蛋白质2),是属于多基因家族的一种神经特异蛋白。存在于光感受器,和双极细胞,在视网膜电的传输过程中起着至关重要的作用。GJD2的所有外显子和内含子外边界的测序也有47个个体。高度近视,高远视或远视中有频率差异研究方法评估在基因间区域内的相关变异对于SNPs的表达。相关的15q14位点在淋巴母细胞细胞系中。至少有两个以上的相关SNPs。、15q14基因变异的影响是相对均匀的,提高调查结果的可信度RASGRF1。这个基因在功能上与眼睛发育有关,类似于GJD2,参与光感受器的突触传递15q25支持这些基因位点与屈光不正和近视的关联。来揭示近视的机理。随后应该包括全面。对整个相关区域和侧翼基因进行重新测序,验证群组。参与者1991年至1993年期间进行了研究,包括6775接受了双侧白内障手术,激光屈光手术的有5328人可获得屈光不正和全基因组的SNPs,其中99%的人是欧洲血统。复制组——前三个复制研究起源于荷兰。第一个队列是RS-II,包括2157个参与者。(自2000年起,55岁以上的老人2000年至2002年期间进行了随访。第二个复制队列是RS-III,a。(2082名年龄在45岁及以上,在2006年和2009年之间第三个复制研究是ErasmusRucphen家族。(ERF)研究,一个以家庭为基础的研究,在一个基因隔离的人口的西南部。荷兰。包括了年龄在18岁的ErasmusRucphen的2032个活着的后代。人眼组织中的基因表达数据人类基因表达的数据在视网膜色素上皮,脉络膜(从6个供者眼睛获得从三个供体的眼中获得光感受器(使用液态氮快速冷冻技术)捐献者年龄在63岁至78岁之间,没有任何已知的眼部病史。冷冻切片从黄斑切开,用组织学知识和外观辨认视网膜色素上皮、光感受器和脉络膜细胞。用激光显微解剖系统从黄斑区分离RNA分离和mRNA成分并进行程序和表达微阵列分析。根据迈阿密的指导方针。作为表达水平的度量,对所有的表达式进行排序。在44K微阵列上的基因增加了它们的表达,计算对应的百分比(补充表3)研究方法测量屈光不正从1998年到2002年,参与者接受了眼科和屈光不正检查,得出最佳矫正视力和角膜测量数据。计算公式为:等效球镜量=球镜量+(柱镜量/2)并对折射率进行测量,得出临床分型。近视分为低(球形相当于从1.5−−3度),中等(球形相当于从3−−6度)和高(球形相当于−6度或更低)。02课题研究内容点击此处更换文本添加文字点击此处更换文本添加文字点击此处更换文本添加文字点击此处更换文本添加文字THANKS点击此处更换文本添加文字

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