ntsys软件使用方法集锦

ntsys软件使用方法集锦1/5NTSYS-PC使用说明1、生成矩阵：在excel按如下规则输入数据，A1=1表示有带记为1，B1=13表示扩增的总条带数，C1=7表示样本数，D1=0表示无带记为0。第二行表示的是样本名称。从第三行开始的A列表示引物名称。见下图：输入完毕后，将文件以Microsoftexcel5.0/95工作薄的格式存盘。2、生成系统树：打开NTSYS-PC程序，点击similarity出现如下界面：再点击Qualitativedata，出现下面的界面：ntsys软件使用方法集锦2/5点击inputfile，打开生成的excel文件，点击outfile起一个文件名（假设叫A），然后点击compute按钮。继续点击clustering，出现下面的界面，再点SHAN，出现如下界面：ntsys软件使用方法集锦3/5点击inputfile，打开文件刚才保存的文件111，点击outfile起一个文件名（假设叫222），把Incaseofties改为Find，然后点击compute按钮。计算完成！点击inputfile，打开文件A，点击outfile起一个文件名（假设叫B），然后点击compute按钮。然后点Graphicsntsys软件使用方法集锦4/5再点treeplot，出现下面的界面：点击inputfile，打开文件B，然后点击compute按钮，就会出现聚类图。3、生成遗传相似度表：点File中的Editfile,打开文件A，再点compute按钮，就会得到遗传相似度表。这个软件的功能很强大，但我也只会做聚类图和遗传相似度，如果其他朋友还会使用其它功能，请多交流。ntsys软件使用方法集锦5/5缺失数据可用999代替,写在列的后面,软件就可以识别了TREEplotDisplaysatreematrix(suchasproducedbytheSAHNmodule)ortheNJOINmodule.ThealgorithmusedtoconvertatreematrixintoadendrogramdisplayisgiveninRohlf(1975a).AgeneralizationofthisprocedureisusedtoplotatreewithdifferentheightsforeachOTU.Thetreeisdisplayedonlyapageatatime.ThenumberofOTUsperpagecanbechangedbyeitheropeningtheplotoptionswindoworbypressingthe+or-keys.Thecurrentpagetobedisplayedcanbeselectedeitherfromtheplotoptionswindoworbypressingthezandxkeys.ParametersProgramparametersandbatchcodes.?2000byAppliedBiostatistics,Inc.