PIK3CATP53基因项目立项

PIK3CA、TP53基因项目立项报告分子诊断部徐正红201503022一．PIK3CA基因项目二．TP53基因项目三．技术方法四．风险评估3一.PIK3CA基因项目41.项目背景吉非替尼厄洛替尼西妥昔单抗帕尼单抗FDA要求对拟采用易瑞沙、特罗凯等EGFR-TKI治疗的患者,进行EGFR基因突变检测FDA要求使用西妥昔单抗、帕尼单抗治疗结直肠癌前，必须进行KRAS基因检测耐药5①PIK3CA基因定位于3q26.3，长34kb，包含21个外显子，编码1068种氨基酸，该组氨基酸产生一组长124kD的蛋白。PIK3CA编码I类磷脂酰肌醇-3-激酶(phosphatidylinositol3-kinases,PI3Ks)的p110催化亚单位，即PI3Kp110a。I类PI3K为异源二聚体，由一个调节亚基（p85）和一个催化亚基（p110）组成。1.项目背景6②PIK3CA的突变约4/5发生在螺旋区(exon9)和激酶区(exon20)这两个热点区域。③PIK3CA基因突变引起p110a异常激活，进而活化PI3Ks，激活下游Akt等信号分子，激活或抑制其下游靶蛋白进而调节细胞的增殖、分化、凋亡以及迁移等生物学效应，最终导致肿瘤的发生。1.项目背景7④CFDA注册产品：产品名称生产单位批准日期人PIK3CA基因突变检测试剂盒（荧光PCR法）北京雅康博生物科技有限公司2014.06.17人类PIK3CA基因突变检测试剂盒（流式荧光杂交法）益善生物技术股份有限公司2014.07.07人类PIK3CA基因突变检测试剂盒（荧光PCR法）厦门艾德生物医药科技有限公司2013.04.021.项目背景8⑤其他的PIK3CA基因突变检测试剂盒：产品名称公司一种PIK3CA基因突变荧光定量PCR分型检测试剂盒及检测方法广州达健一种检测人PIK3CA基因突变的方法和试剂盒苏州科贝用于检测直肠癌PIK3CA基因热点突变位点杭州艾迪康医学检验PIK3CA基因突变检测试剂盒(PCR-荧光探针法)北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司1.项目背景9⑥国内相关专利：专利名称申请（专利权）人申请号或授权公告号PIK3CA基因驱动突变的检测探针、引物及试剂盒厦门艾德生物医药科技有限公司CN102453765BPIK3CAH1047R敲入非人动物乳腺癌模型霍夫曼-拉罗奇有限公司CN201280046858一种PIK3CA基因突变检测液相芯片广州益善生物技术股份有限公司CN201010160769PIK3CA基因突变的检测探针、液相芯片及其检测方法广州益善生物技术股份有限公司CN101445832B一种PIK3CA基因突变荧光定量PCR检测试剂盒及检测方法宁波有成生物医药科技有限公司CN201310260412一种用于检测PIK3CA基因突变的试剂盒武汉友芝友医疗科技有限公司CN201410734805引物及该引物质谱检测PIK3CA基因热点突变的方法武汉康圣达医学检验所有限公司CN201210574584一种PIK3CA基因突变荧光定量PCR分型检测试剂盒及其检测方法广州达健生物科技有限公司CN201210330990用于检测结直肠癌PIK3CA基因热点突变位点的试剂盒杭州艾迪康医学检验中心有限公司CN201210234133一种检测人PIK3CA基因突变的方法和试剂盒苏州科贝生物技术有限公司CN2010106085001.项目背景10cancer%PIK3CAmutationSamplesource(primarytissuevscancercellline)ExonmutatedFunctionaldomainReferenceLiver35.6(26/73)Primary9and20HelicalandkinaseLeeetal(2004)Totalliver36%(26/73)Breast33.3(4/12)Celllines9and20HelicalandkinaseBachmanetal(2004)Breast21.4(9/42)Primary1,9and20p85,helicalandkinaseBachmanetal(2004)Breast18.1(13/72)Primary9and20HelicalandkinaseLevineetal(2005)Breast40.0(28/70)Primary6,7,9and20C2,helicalandkinaseCampbelletal(2004)Breast20.7(19/92)Primary9and20HelicalandkinaseWuetal(2005a)Breast8.3(1/12)Primary20kinaseSamuelsetal(2004)Breast33.3(5/15)Celllines9and20HelicalandkinaseWuetal(2005a)Breast26.9(25/93)Primary9and20HelicalandkinaseLeeetal(2004)Breast28.0(14/50)Celllines1,9and20p85,helicalandkinaseSaaletal(2005)Breast26.4(77/292)Primary1,4,7,9,13,18,20p85,C2,helicalandkinaseSaaletal(2005)Totalbreast26%(195/750)Colon31.6(74/234)Primary1,2,4,7,9,18and20P85,C2,helicalandKinaseSamuelsetal(2004)Colon13.6(14/103)Primary9and20HelicalandkinaseVelhoetal(2005)Colon18.8(6/32)Primary9and20HelicalandkinaseCampbelletal(2004)Totalcolon25%(94/369)2.临床意义---突变率11Ovarian12.1(24/198)Primary9and20HelicalandkinaseLevineetal(2005)Ovarian6.0(11/182)Primary9and20HelicalandkinaseCampbelletal(2004)Totalovarian9%(35/380)Gastric25.0(3/12)Primary18and20KinaseSamuelsetal(2004)Gastric10.6(5/47)Primary9and20HelicalandkinaseVelhoetal(2005)Gastric6.5(12/185)Primary9and20HelicalandkinaseLeeetal(2004)Gastric4.3(4/94)Primary9and20HelicalandkinaseLietal(2005)Totalgastric7%(24/338)Brain26.7(4/15)Primary4,5and13C2andhelicalSamuelsetal(2004)Brain4.6(13/285)Primary9and20HelicalandkinaseBrodericketal(2004)Totalbrain6%(17/300)Lung1.3(3/229)Primary9and20HelicalandkinaseLeeetal(2004)Lung4.2(1/24)Primary9HelicalSamuelsetal(2004)Totallung2%(4/253)Leukaemia1.1(1/88)Primary9HelicalLeeetal(2004)Totalleukaemia1%(1/88)Totalcancersreported15%(382/2551)[*]2.临床意义---突变率12药物检测项目检测意义易瑞沙特罗凯EGFR基因突变预测疗效KRAS基因突变预测疗效西妥昔单抗帕尼单抗KRAS基因突变预测疗效BRAF基因突变预测疗效威罗菲尼BRAF基因突变预测疗效易瑞沙特罗凯西妥昔单抗帕尼单抗PIK3CA基因突变耐药相关2.临床意义---耐药13①PI3K作为EGFR下游信号分子被激活，可导致肿瘤细胞对EGFR-TKI药物的耐药，例如PIK3CA基因的突变可导致西妥昔单抗（爱必妥），帕尼单抗（维克替比）对转移性结直肠癌治疗的耐受，导致吉非替尼，厄洛替尼对非小细胞肺癌和食道癌晚期患者的治疗耐受[1-4]。②K-ras，BRAF和PIK3CA基因突变率约占结直肠癌总体患者的56％。KRAS，BRAF，PIK3CA任何一个或多个突变对个体化靶向药物西妥昔单抗（爱必妥），帕尼单抗（维克替比）治疗无效，全部为野生型治疗有效[4]。③PIK3CA突变对于乳腺癌个体化靶向药物曲妥珠单抗（赫赛汀）治疗无效，野生型治疗有效[5-6]。2.临床意义---耐药14COSMICIDNMAAChange突变率775c.3140AGp.H1047R80%Commonmutations776c.3140ATp.H1047L760c.1624GAp.E542K763c.1633GAp.E545K765c.1635GTp.E545D3.项目内容15PIK3CAmutationorgeneamplificationwasdetectedin30.5%ofallovariancancersand45%oftheendometrioidandclearcellsubtypes,andE542K,E545K,E545D,H1047RandH1047Lmutationsweredetected[7].PIK3CAE542K,E545K,andE545Dmutationinexon9,H1047RandH1047Lmutationinexon20arethecommonmutations,andmaybeassociatedwiththeefficacyofEGFR-TKItherapy[8-9].Mostofthemutationsoccurattwohotspots,namelyE545KinthehelicaldomainandH1047Rinthecatalyticdomain,andE545KH1047Rareassociatedwithinvasionandmetastasis[10-12].continuedactivationofPI3KsignalingbythePIK3CAoncogenicmutant,p110alphaE545K,wassufficienttoabrogategefitinib-inducedapoptosis.[13]PIK3CAE542KmayaffecttheefficacyofEGFR-TKItherapyinlungcancer[14].3.项目内容16引文[1]Sartore-BianchiA,MartiniM,MolinariF,etal.PIK3CAmutationsincolorectalcancerareassociatedwithclinicalresistancetoEGFR-targetedmonoclonalantibodies[J].Cancerresearch,2009,69(5):1851-1857[2]PaezJG,JännePA,LeeJC,etal.EGFRmutationsinlungcancer:correlationwithclinicalresponsetogefitinibtherapy[J].Science,2004,304(5676):1497-1500.[3]JanmaatML,Gallegos-RuizMI,RodriguezJA,etal.PredictivefactorsforoutcomeinaphaseIIstudyofgefitinibinsecond-linetreatmentof