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18CHAPTER2.CELLVIEWER2.1关于cellViewer该工具提供了一个用户友好的交互界面，从四个不同的角度显示了材料：直接原子晶格（晶胞视图），倒易晶格（衍射图），立体投影（立体图）和反极图（IPF视图）。CellViewer提供了两个单独的插槽或视图（左侧和右侧），每个插槽或视图均可被上述四个视图之一占据。因此，用户可以选择适合自己需求的两个视角的组合。该工具可用于可视化晶体学平面，方向，它们的相互位置和方向，它提供晶体学计算器或可帮助计算导致所需样品取向的TEM支架倾斜度的工具。左视图和右视图都是交互式且相互关联的：例如，如果单击“衍射”视图中的衍射点，则将相应的晶体学平面渲染到3D晶胞中，“单元格”视图或标记将在“立体”视图中的适当位置绘制或IPF视图。用户可以调整一个视图对另一视图的影响程度。例如，“单元”视图中的3D单元可以自由旋转而不会影响其他视图。但是，如果需要，可以立即更新衍射视图中的衍射图案，也可以调整立体视图中的极点，使其与实际的晶胞方向匹配。2.2输入项该工具唯一需要输入的是样品材料。应按照1.3节中的规定进行定义。CIF格式的支持正在开发中。可选的cellViewer输入是diffractGUI的结果。DiffractGUI可以将区域轴和图案方向传递给cellViewer，从而可以提供模拟衍射图和直接对应于diffractGUI分析的衍射图的晶胞方向。2.3视窗说明如上所述，窗口具有两个视图或插槽（左和右），每个视图或插槽都可以被单元格视图，衍射视图，立体视图或IPF视图占据。可以通过上下文菜单（在视图上单击鼠标右键后出现）或使用工具栏按钮，以及主菜单正下方的方式来选择两个视图的内容。可以通过主菜单调整各个视图的各种属性和设置，也可以通过窗口左下方的上下文菜单和选项卡更快地进行调整。窗口右下角的选项卡显示有关所选晶体平面，方向，原子等的详细信息。图形用户界面的详细说明如下。2.3.1衍射图该图显示了理论上的点衍射图。可以通过按工具栏按钮激活它。各个衍射点由圆盘表示。磁盘大小是根据结构因素得出的。十字表示非常微弱或禁止反射。样品不需要在精确的区域轴上定向，因此，对于某些衍射点，不能完全满足衍射条件。这样，这些反射不会显示为黑色，而是以灰色阴影显示-点越黑，衍射条件越令人满意。2.3。视窗说明错误!未定义书签。图2.1：衍射视图衍射视图是交互式的。用户可以单击这些点以在“平面”选项卡中查看有关相应平面的详细信息，并将平面本身绘制到“单元格”视图中。基本设置可以在上下文菜单或“衍射”选项卡中进行调整，所有设置在主菜单中均可用。此视图可用的鼠标操作如下：左击选择平面1（蓝色）。Shift+左键单击选择平面2（红色）。右键点击显示上下文菜单。2.3.2单元格视图这是单位晶格（或更宽的原子晶格）上的交互式视图，可以通过工具栏按钮激活。原子表示为根据其元素着色的球形。用户可以使用工具栏按钮和来放大，缩小和旋转单位单元。随着晶胞旋转，可以在右上角看到实际的晶体学取向。旋转晶格的实际方向可能会或可能不会立即在“衍射”视图或“立体”视图中反映出来。与“衍射”视图类似，用户可以单击鼠标来选择单个原子。选中的原子突出显示，详细信息显示在“原子”选项卡中。如果只选择一个原子，则在此表示其坐标和元素。在有两个原子的情况下，将打印有关原子之间的向量的信息。三个原子生成一个平面，该平面由法向矢量和米勒平面索引描述。平面也在视图中渲染。如果有四个原子，则添加有关d间距的信息。20CHAPTER2.CELLVIEWER图2.2：单元格视图此视图可用的鼠标操作如下：左击选择原子（绿色）。Shift+左键单击/Ctrl+左键单击/双击左键即使打开了旋转模式（突出显示工具栏按钮）也选择原子。右键点击显示上下文菜单。2.3.3立体图可以通过工具栏按钮激活此视图。该视图非常直观。它提供选定平面和方向的立体投影。投影杆可以立即固定或更新，以与“单元格”视图中的单元格方向匹配。网格可以反映平面或方向索引。单击该图，您可以选择随后在其他视图中显示的平面或方向。此视图可用的鼠标操作如下：左击选择平面1（蓝色）。Shift+左键单击选择平面2（红色）。Ctrl+左键单击选择方向1（蓝色）。Ctrl+Shift+左键单击选择方向2（红色）。右键点击显示上下文菜单。2.3。视窗说明错误!未定义书签。图2.3：立体图2.3.4IPF视图该视图与立体视图非常相似。可以通过工具栏按钮激活它。与立体视图相比，该视图仅覆盖整个立体投影的一部分。所显示区域的边界由三个点给定，可以由用户设置。IPF三角形可能是彩色的。也可以将其绘制到“立体”视图或“单元”视图中，以直接显示IPF在单位单元上下文中的含义。图2.4：IPF视图单击该图，您可以选择随后在其他视图中显示的平面或方向。此视图可用的鼠标操作如下：左击选择平面1（蓝色）。22CHAPTER2.CELLVIEWERShift+左键单击选择平面2（红色）。Ctrl+左键单击选择方向1（蓝色）。Ctrl+Shift+左键单击选择方向2（红色）。右键点击显示上下文菜单。2.3.5样本标签图2.5：“示例”选项卡材料可以使用此字段指定样品材料。区域轴用户可以在此处设置所需的区域轴。该字段的更改总是立即反映在左右视图中。2.3.6衍射视图选项卡此选项卡允许“衍射”视图的基本设置。主菜单中提供高级设置。最高现货指数在这里，您可以设置在“衍射”视图中绘制的衍射点的最大点（平面）索引。最高平面开发该字段指定“衍射”视图对实际方位与完美区域轴的偏离的容忍度。值越高，则允许从理想区域轴偏角越大，从而在衍射图中绘制点。注意，磁偏角反映在各个衍射光斑的暗处–磁偏角越高，光斑越亮。2.3。视窗说明错误!未定义书签。图2.6：衍射视图选项卡查看范围指定衍射图的X和Y轴限制。从单元格视图更新区域轴如果选中，则在“单元格”视图中旋转晶胞时会立即重绘衍射图。2.3.7单元格视图选项卡图2.7：单元格视图选项卡单元格视图的基本设置可以在此选项卡中完成。主菜单中提供高级设置。格子跨度控制在“单元格”视图中显示多少个原子。零表示“人类友好”的晶胞（例如，在HCP结构的情况下为整个六边形）。大于或等于1的数字代表NxNxN个“true”单位单元的块。较高数量的原子可能导致增加的硬件要求。相对在。半径使用相对原子半径，您可以设置表示原子的球体大小，以结构中两个最近原子之间的距离的百分比表示。换句话说，值100表示单位晶格中两个最接近的原子将相互接触。大于100的数字使某些原子彼此相交，而小于100的数字使“单元格”视图稀疏且更容易透视。24CHAPTER2.CELLVIEWER表面复杂度每个原子可视化（球体）都包含许多平面。可以在此处设置脸部数量。数字越高，原子越平滑。较多的面可能导致对硬件的需求增加。保留观点应用某些“单元格”视图更改（例如“表面复杂性”，“相对半径”等）后，“单元格”视图视点将重置（以给定的区域轴方向）。此复选框允许保留用户设置的晶胞方向（例如，通过旋转，TEM支架倾斜等）。透明飞机该复选框使“单元”视图中的平面透明，因此仍可以看到它们后面的原子。2.3.8立体视图标签图2.8：立体视图标签您可以在此处控制“立体”视图。主菜单中提供高级设置。极可以在此处设置与投影极对应的方向的米勒指数。点击选择此单选按钮确定鼠标左键是否选择方向或平面。另一个可以通过Ctrl选择。网格显示在此可以指定网格是反射方向还是平面法线。从单元格视图更新极点如果旋转了晶胞，则此复选框允许自动更新投影杆和上方。显示理论思考如果选中，则立体投影中将显示理论平面（对应于衍射图中的反射）。最高衍射选项卡中的现货指数在此处适用。2.3。视窗说明错误!未定义书签。显示IPF在这里可以控制IPF在立体视图中的外观。2.3.9IPF视图选项卡图2.9：IPF视图选项卡可以在这里调整IPF。主菜单中提供高级设置。极IPF极点（对应于左下/右下角）在此处指定为Miller索引中的方向向量。右/左角IPF三角形的边角在此处设置为米勒指数中的方向向量。上角IPF三角形的上角在此字段中定义为米勒索引中的方向向量。点击选择此单选按钮确定鼠标左键是否选择方向或平面。另一个可以通过Ctrl选择。显示理论思考如果选中，则立体投影中将显示理论平面（对应于衍射图中的反射）。最高衍射选项卡中的现货指数在此处适用。彩色IPF此复选框在白色和彩色IPF之间切换。2.3.10飞机标签此选项卡说明有关通过鼠标单击视图或使用此面板中的“平面1”和“平面2”字段手动输入的平面的详细信息。飞机1该字段表示飞机1（蓝色的飞机）的米勒指数。单击“衍射”视图，“立体”视图和“IPF”视图后，可以手动或自动填充它。26CHAPTER2.CELLVIEWER图2.10：平面选项卡飞机2该字段表示飞机2的米勒指数（红色）。单击“衍射”视图，“立体”视图和“IPF”视图后，可以手动或自动填充它。d间距在此说明飞机1和飞机2的D间距。平面间角如果同时指定了两个平面，即平面1和平面2，则在此打印它们之间的角度。2.3.11原子标签图2.11：原子选项卡这里提到了有关在“单元格”视图中单击鼠标选择的原子的详细信息。单击特定原子时，其坐标（以米勒指数表示）将添加到“原子”字段中。也可以手动输入原子坐标，用分号分隔单个原子。关于选择的详细信息取决于选择的原子数：•一个原子–元素，原子坐标（米勒和笛卡尔坐标）两个原子–元素，两个原子之间的向量方向（米勒和笛卡尔坐标）及其距离（米勒和笛卡尔坐标）•三个原子–元素，平面法线向量（在米勒和笛卡尔坐标中）四个原子–元素，平面法向矢量（在米勒和笛卡尔坐标中）和d间距••2.3。视窗说明错误!未定义书签。2.3.12方向标签图2.12：“方向”标签此选项卡说明有关晶体学方向的详细信息，这些信息是通过鼠标单击视图或使用此面板中的方向1和方向2手动输入的。矢量1该字段表示方向1的米勒指数（蓝色）。单击“立体声”视图和“IPF”视图后，可以手动或自动填充。矢量2该字段表示方向2的米勒指数（红色）。单击“立体声”视图和“IPF”视图后，可以手动或自动填充。长度方向1和方向2的长度在此处说明。向量之间的角度如果指定了两个方向，即方向1和方向2，则将在此处打印一个角度。2.3.13计算器标签图2.13：计算器选项卡此选项卡提供晶体学计算器。在弹出菜单中选择要计算的数量后，所需参数的描述将出现在文本字段旁边。正确设置所有输入后，结果将打印在选项卡的右侧。支持的计算包括：28CHAPTER2.CELLVIEWER•平面和方向的Miller和Bravais表示法之间的转换•平面和方向的米勒和笛卡尔坐标系之间的转换•平面角和方向角的枚举•d间隔枚举和分配•计算结构因子，原子散射幅度或消光距离2.3.14导出标签图2.14：导出选项卡使用此选项卡可以将某些晶体学量导出为文本文件。输入参数该面板用于设置计算输入-主要是列举平面的米勒指数范围。一些计算还需要加速电压。出口数量此处使用复选框指定导出到表格的数量。导出文件在此选项卡中，您可以使用分隔符弹出菜单在表中指定分隔各个值的字符。然后，您可以按导出按钮启动导出过程。该程序的状态在下面说明。2.3.15支架校准选项卡该工具使您可以模拟TEM样品架。为此需要一些基本的校准。选项卡右侧的持有人可视化应该帮助用户检查是否所有值都已正确设置。支架方位角此字段指定相对于“单元格”视图中当前显示的样品方向的固定器方向。此值是alpha倾斜轴和Y（垂直）轴之间的角度（以度为单位）。正旋转角方向这些弹出菜单允许您指定正角度是将支架向右还是向左倾斜（α倾斜），是向上还是向下（对于β倾斜）（从支架手柄向支架尖端观察）。2.3。视窗说明错误!未定义书签。图2.15：支架校准选项卡倾斜导致显示的晶胞方向这些字段用于设置与当前在“单元格”查看器中显示的样本方向相对应的alpha和beta倾斜度（以度为单位）。校准如果设置了前面提到的所有值，并且支架可视化与实际情况吻合，则可以按此