SNT 2969-2011 国境口岸蚊类携带东部马脑炎病毒的检测方法

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书书书中华人民共和国出入境检验检疫行业标准犛犖/犜2969—2011国境口岸蚊类携带东部马脑炎病毒的检测方法 犚犜犘犆犚法犇犲狋犲犮狋犻狀犵犿犲狋犺狅犱犳狅狉犲犪狊狋犲狉狀犲狇狌犻狀犲犲狀犮犲狆犺犪犾犻狋犻狊狏犻狉狌狊犻狀犿狅狊狇狌犻狋狅犲狊犪狋犳狉狅狀狋犻犲狉狆犪狉狋—犚犜犘犆犚犿犲狋犺狅犱20110531发布20111201实施中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局发布书书书中华人民共和国出入境检验检疫行 业 标 准国境口岸蚊类携带东部马脑炎病毒的检测方法 犚犜犘犆犚法SN/T2969—2011中国标准出版社出版北京复兴门外三里河北街16号邮政编码:100045网址www.spc.net.cn电话:68523946 68517548中国标准出版社秦皇岛印刷厂印刷开本880×12301/16 印张0.5 字数9千字2011年11月第一版 2011年11月第一次印刷印数1—1600书号:155066·222668 定价14.00元书书书前  言  本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准起草单位:中华人民共和国辽宁出入境检验检疫局、中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国江苏出入境检验检疫局、中华人民共和国浙江出入境检验检疫局。本标准主要起草人:薛芳、孙时、耿丽梅、田虹、宋锋林、张晓龙、高玉峰、孙立新、吴忠华、郭天宇。Ⅰ犛犖/犜2969—2011国境口岸蚊类携带东部马脑炎病毒的检测方法 犚犜犘犆犚法1 范围本标准规定了国境口岸蚊类携带东部马脑炎病毒的检测对象、生物安全要求、样品的保存运输、检测方法和结果判断。本标准适用于国境口岸蚊类携带东部马脑炎病毒的检测。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB19489 实验室 生物安全通用要求人间传染的病原微生物名录(中华人民共和国卫生部,2006年)3 术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1东部马脑炎病毒 犲犪狊狋犲狉狀犲狇狌犻狀犲犲狀犮犲狆犺犪犾犻狋犻狊狏犻狉狌狊;犈犈犈犞东部马脑炎病毒属披膜病毒科甲病毒属,病毒粒子呈圆形,核衣壳呈20面体对称,直径50nm~70nm,含有一个高电子密度的核心,是引起人类东部马脑炎的病原体。黑尾赛蚊(犆狌犾犻狊犲狋犪犿犲犾犪狀狌狉犪)、盐泽伊蚊(犃犲犱犲狊狊狅犾犾犻犮犻狋犪狀狊)等蚊虫为本病毒的主要传播媒介。4 检测对象出入境交通工具、集装箱、货物以及口岸等场所捕获的媒介蚊虫。5 生物安全要求实验室生物安全要求按照GB19489及《人间传染的病原微生物名录》的规定执行。6 器材与试剂6.1 器材液氮罐、冷藏箱、高速冷冻离心机、高压蒸汽灭菌锅、PCR扩增仪、烘箱、水浴锅、生物安全柜、匀浆器、移液器、PCR反应管、冻存管、离心管、塑料平皿、镊子等。1犛犖/犜2969—20116.2 试剂Trizol、三氯甲烷、异丙醇、无水乙醇、焦碳酸二乙酯(DEPC)、引物、缓冲液、混合酶、RNA酶抑制剂等。7 样品的保存运输7.1 样品的分拣、分装将捕获的蚊虫现场用二氯甲烷熏杀后,快速分拣。若条件允许,分拣过程应在简易低温装置上进行。分拣后按类别装入适当的容器(如:冻存管、离心管、塑料平皿等),加贴标签。标签内容至少包括以下信息:编号、种类、采集时间、采集地点、采集人等。7.2 样品的保存运输(物理法)分装完毕的样品,尽快装入液氮罐、冷藏箱或其他适当的冷冻(冷藏)装置,尽早送实验室处理。若采样点与实验室相距较近,也可将活体样品连同采样工具直接送实验室处理。运送过程中防止蚊虫逃逸。7.3 样品的保存运输(化学法)在装有蚊虫的密闭容器内加入5倍体积的RNA保护剂,常温下5d内送达实验室。8 样品的检测8.1 核酸(犚犖犃)提取8.1.1 犚犖犃提取方法使用Trizol试剂提取总RNA。可参照如下方法提取总RNA,或使用可达到同等效果的RNA提取试剂盒:8.1.1.1 取蚊虫个体(单只或多只)放入1.5mL离心管内,加入1mLTrizol试剂后研磨成匀浆,室温放置5min。8.1.1.2 加入200μL二氯甲烷,剧烈振荡15s,室温放置3min,于4℃12000犵离心15min。8.1.1.3 小心吸出上清液,置于另一1.5mL离心管中,加入异丙醇500μL,室温放置10min,4℃12000犵离心10min。8.1.1.4 弃上清液,加入75%乙醇1mL洗涤,4℃7500犵离心5min。8.1.1.5 弃上清液,将沉淀自然干燥,加入适量的DEPC水溶解沉淀。8.1.1.6 -70℃冻存提取的RNA或直接用于反转录实验。8.1.2 注意事项RNA提取过程中注意事项如下:a) RNA的提取既可单只蚊虫进行,也可多只蚊虫混合提取。根据捕获样品数量、实验目的等具体情况确定。b) 样品研磨前的分装过程,注意低温、快速。尽量在冰盘、冰壶或其他低温装置上操作。c) 操作全过程采取戴口罩、戴手套等措施,防止操作者的汗液、唾液中RNA酶对样品造成污染。d) 试剂和无菌水应专用,避免交叉污染。2犛犖/犜2969—2011e) 尽量使用RNA实验专用的一次性无RNA酶污染的塑料器皿。8.2 核酸检测(一步法犚犜犘犆犚)8.2.1 引物设计根据东部马脑炎病毒E2基因序列,设计特定的上游引物和下游引物,上下游引物扩增的核酸片段长度为436bp。引物序列如下:上游引物PE1:5’CTAGTTGAGCACAAACACCGA3’下游引物PE2:5’CACTTGCAAGGTGTCGTCTGCCCTC3’上下游引物合成后用纯水溶解并分装冻存于冰箱内。引物浓度为20μmol/L。8.2.2 一步法犚犜犘犆犚8.2.2.1 使用一步法RTPCR试剂盒(QIAGEN公司产品)1)对东部马脑炎病毒进行核酸扩增,扩增片断长度为436bp。1) 一步法RTPCR试剂盒由OIAGEN公司提供,是适合市售产品的实例。给出这一信息是为了方便标准的使用者,并不表示对该产品的认可,如果其他等效产品具有同样的效果,则可使用这些等效产品。8.2.2.2 反应组成:反应总体积为50μL。模板RNA5μL、5×缓冲液10μL、dNTPs2μL、上游引物(PE1)2μL、下游引物(PE2)2μL、混合酶(含逆转录酶和DNA聚合酶)2μL、RNA酶抑制剂1μL(40U/μL)、DEPC水26μL。8.2.2.3 反应条件:50℃逆转录30min后,于95℃预变性15min;95℃变性30s,64℃复性40s,72℃延伸17s,扩增30个循环;最后于72℃延伸10min。8.2.2.4 对照的设立:在核酸扩增实验中同时按下列所述设阳性对照、阴性对照和空白对照:a) 阳性对照:以实验室养殖的、没有感染病原微生物的正常蚊虫RNA与东部马脑炎病毒的混合RNA为扩增模板;b) 阴性对照:以实验室养殖的、没有感染病原微生物的正常蚊虫RNA为扩增模板;c) 空白对照:以DEPC水为扩增模板。8.3 琼脂糖凝胶电泳检测扩增结束后,在扩增产物中加入6×DNA上样缓冲液,用含0.5μg/mL溴化乙锭的1.5%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,用凝胶成像系统拍照记录结果。9 结果判断9.1 质量控制有效实验结果应同时符合以下两个条件:a) 阴性对照和空白对照未出现特异性扩增条带;b) 阳性对照在预期位置出现特异性扩增条带。9.2 结果分析9.2.1 阳性结果在实验结果有效的情况下,如待检样品在预期位置出现特异性扩增条带,则可初步判断待检样品东部马脑炎病毒RTPCR检测阳性。初步判断为阳性结果的样品可通过复检或核酸序列测定进一步确认。犛犖/犜2969—2011书书书犛犖/犜2969—20119.2.2 阴性结果在实验结果有效的情况下,如待检样品在预期位置未出现特异性扩增条带,则可判断待检样品东部马脑炎病毒RTPCR检测阴性。1102—9692犜/犖犛书号:155066·222668定价:  14.00元

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