SNT 2754.15-2011 出口食品中致病菌环介导恒温扩增(LAMP)检测方法 第15部分阪琦

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书书书中华人民共和国出入境检验检疫行业标准犛犖/犜2754.15—2011出口食品中致病菌环介导恒温扩增(犔犃犕犘)检测方法第15部分:阪崎肠杆菌犔狅狅狆犿犲犱犻犪狋犲犱犻狊狅狋犺犲狉犿犪犾犪犿狆犾犻犳犻犮犪狋犻狅狀犱犲狋犲犮狋犻狅狀犿犲狋犺狅犱犳狅狉狆犪狋犺狅犵犲狀狊犻狀犲狓狆狅狉狋犳狅狅犱—犘犪狉狋15:犈狀狋犲狉狅犫犪犮狋犲狉狊犪犽犪狕犪犻犻20110225发布20110701实施中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局发布书书书前  言  SN/T2754《出口食品中致病菌环介导恒温扩增(LAMP)检测方法》共分为15个部分:———第1部分:金黄色葡萄球菌;———第2部分:大肠杆菌O157;———第3部分:志贺氏菌;———第4部分:单核细胞增生李斯特菌;———第5部分:副溶血性弧菌;———第6部分:小肠结肠炎耶尔森氏菌;———第7部分:空肠弯曲菌;———第8部分:肺炎克雷伯氏菌;———第9部分:溶血性链球菌;———第10部分:产气荚膜梭菌;———第11部分:产霍乱毒素的霍乱弧菌;———第12部分:溶藻弧菌;———第13部分:创伤弧菌;———第14部分:假结核耶尔森氏菌;———第15部分:阪崎肠杆菌。本部分为SN/T2754的第15部分。本部分按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本部分起草单位:中华人民共和国山东出入境检验检疫局、中华人民共和国广东出入境检验检疫局、广州华峰生物科技有限公司、中华人民共和国天津出入境检验检疫局、中华人民共和国福建出入境检验检疫局。本部分主要起草人:雷质文、李正义、李志勇、曹以诚、姜英辉、郑文杰、张霞、易敏英、王志强、张体银、陈洵、高东微。Ⅰ犛犖/犜2754.15—2011出口食品中致病菌环介导恒温扩增(犔犃犕犘)检测方法第15部分:阪崎肠杆菌1 范围SN/T2754的本部分规定了检测出口食品中阪崎肠杆菌的环介导恒温核酸扩增(LAMP)法。本部分适用于出口食品中阪崎肠杆菌的筛选检测。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T6682 分析实验室用水规格和试验方法GB19489 实验室 生物安全通用要求GB/T27403 实验室质量控制规范 食品分子生物学检测SN/T1632.1 奶粉中阪崎肠杆菌检验方法 第1部分:分离与计数方法3 生物安全措施为了保护实验室人员的安全,应由具备资格的工作人员检测阪崎肠杆菌,所有培养物和废弃物应按照GB19489中的有关规定执行。4 防污染措施防止污染措施应符合GB/T27403的规定。5 缩略语下列缩略语适用于本文件。Betaine:甜菜碱犅狊狋酶[犅狊狋DNApolymerase(largefragment)]:犅狊狋DNA聚合酶(大片段)DNA(deoxyribonucleicacid):脱氧核糖核酸dNTP(deoxyribonucleosidetriphosphate):脱氧核苷三磷酸EDTA(ethylenediaminetetraaceticacid):乙二胺四乙酸犈狊犪16犛:阪崎肠杆菌16SrRNA基因LAMP(loopmediatedisothermalamplification):环介导恒温扩增PCR(polymerasechainreaction):聚合酶链式反应Tris[tris(hydroxymethyl)aminomethane]:三(羟甲基)氨基甲烷1犛犖/犜2754.15—2011TritonX100:聚乙二醇辛基苯基醚6 技术概要根据阪崎肠杆菌特有的靶序列犈狊犪16犛基因(参见附录A)设计的两对特殊的内、外引物,特异性识别靶序列上的六个独立区域,利用犅狊狋酶启动循环链置换反应,在犈狊犪16犛基因序列启动互补链合成,在同一链上互补序列周而复始形成有很多环的花椰菜结构的茎环DNA混合物;从dNTP析出的焦磷酸根离子与反应溶液中的Mg2+结合,产生副产物(焦磷酸镁)形成乳白色沉淀,加入显色液,即可通过颜色变化观察判定结果。7 试剂和材料除有特殊说明外,所有实验用试剂均为分析纯;实验用水符合GB/T6682中一级水的要求。7.1 引物:根据阪崎肠杆菌特有的靶序列犈狊犪16犛基因设计一套特异性引物,包括外引物1,外引物2和内引物1,内引物2。外引物扩增片段长度:520bp。外引物1(F3,5’3’):TCCGCAGGAGTTGAAGAGG外引物2(B3,5’3’):CAGCAGCGTGTCTGTTTCA内引物1(FIP,5’3’):TATGCGGGATCGAACCGCAGATTTTGGCTATAGCTCAGCTGGGA内引物2(BIP,5’3’):GCTCCACCATCACTTCGGAGTGTTTTTTCAGCTTGTTCCGGATTGT7.2 10×ThermoPol缓冲液含:0.2mol/LTrisHCl,0.1mol/L氯化钾,0.1mol/L硫酸铵,20mmol/L硫酸镁,1%TritonX100。7.3 dNTPs:每种核苷酸浓度10mmol/L。7.4 甜菜碱:浓度5mol/L。7.5 硫酸镁(MgSO4):浓度150mmol/L。7.6 犅狊狋DNA聚合酶:酶浓度8U/μL。7.7 DNA提取液:20mmolTrisHCl,2mmolEDTA,1.2%TritonX100(pH8.0)。7.8 显色液:SYBRGreenⅠ荧光染料,1000×。7.9 阳性对照:阪崎肠杆菌标准菌株,或含目的片段的DNA亦可。7.10 1.5mL塑料离心管。7.11 阪崎肠杆菌LAMP检测试剂盒1),可选,参照试剂盒说明书操作。试剂盒组成及使用注意事项参见附录B。1) 由广州华峰生物科技有限公司提供,给出这一信息是为了方便本标准的使用者,并不表示对该产品的认可。如果其他等效产品具有相同的效果,则可使用这些等效产品。8 仪器和设备8.1 移液器:量程0.5μL~10μL;量程10μL~100μL;量程100μL~1000μL。8.2 高速台式离心机:≥7000犵。8.3 水浴锅或加热模块:65℃±1℃和100℃±1℃。8.4 计时器。2犛犖/犜2754.15—20119 检测程序食品中阪崎肠杆菌LAMP检测程序见图1。图1 食品中阪崎肠杆菌犔犃犕犘检测程序10 操作步骤2)10.1 样品制备、增菌培养按照SN/T1632.1的方法进行样品制备和增菌,二次增菌采用EE肉汤。10.2 细菌模板犇犖犃的制备3)10.2.1 增菌液模块犇犖犃的制备2) 采用以下方法,也可使用阪崎肠杆菌LAMP检测试剂盒按照说明书操作。3) 采用下述方法,也可使用等效的商品化的DNA提取试剂盒并按其说明提取制备模板DNA。  对于10.1获得的增菌液,采用如下方法制备模板DNA:a) 直接取该增菌液1mL加到1.5mL无菌离心管中,7000犵离心2min,尽量吸弃上清液;b) 加入80μLDNA提取液,混匀后沸水浴10min,置冰上10min;c) 7000犵离心2min,上清液即为模板DNA;取上清液置-20℃可保存6个月备用。10.2.2 可疑菌落模板犇犖犃的制备对于10.1分离到的可疑菌落,可直接挑取可疑菌落,再按照10.2.1b)步骤制备模板DNA以待检测。3犛犖/犜2754.15—201110.3 环介导恒温核酸扩增10.3.1 反应体系阪崎肠杆菌LAMP反应体系见表1。表1 阪崎肠杆菌犔犃犕犘反应体系组 分工作液浓度加样量μL反应体系终浓度ThermoPol缓冲液10×2.51×F310μmol/L0.50.2μmol/LB310μmol/L0.50.2μmol/L内侧上游引物(FIP)50μmol/L0.81.6μmol/L内侧下游引物(BIP)50μmol/L0.81.6μmol/LdNTPs10mmol/L3.51.8μmol/L甜菜碱5mol/L40.8mol/L硫酸镁50mmol/L24mmol/L犅狊狋DNA聚合酶8U/μL10.32U/μLDNA模板—3—去离子水—6.4—10.3.2 反应过程10.3.2.1 按表1所述配制反应体系。10.3.2.2 65℃扩增60min。10.3.3 空白对照、阴性对照、阳性对照设置每次反应应设置阴性对照、空白对照和阳性对照。空白对照以水替代DNA模板。阴性对照以DNA提取液代替模板DNA。也可使用阪崎肠杆菌LAMP检测试剂盒中的阴性对照。阳性对照制备:将阪崎肠杆菌标准菌株接种于营养肉汤中36℃±1℃培养18h~24h,用无菌生理盐水稀释至约106CFU/mL~108CFU/mL(约麦氏浊度0.4),按10.2.1提取模板DNA作为LAMP反应的模板。也可使用阪崎肠杆菌LAMP检测试剂盒中的阳性对照。10.4 结果观察在上述反应管中加入2μL显色液,轻轻混匀并在黑色背景下观察。建议使用LAMP试剂盒专用反应管,将反应液和显色液一次性加入,DNA扩增反应后可不必开盖即可观察结果。10.5 结果判定和报告在空白对照和阴性对照反应管液体为橙色,阳性对照反应管液体呈绿色的条件下:4犛犖/犜2754.15—2011a) 待检样品反应管液体呈绿色,该样品结果为阪崎肠杆菌初筛阳性,对样品的二次增菌液或可疑纯菌落进一步按SN/T1632.1中操作步骤进行确认后报告结果;b) 待检样品反应管液体呈橙色则可报告阪崎肠杆菌检验结果为阴性。若与上述条件不符,则本次检测结果无效,应更换试剂按本方法重新检测。5犛犖/犜2754.15—2011附 录 犃(资料性附录)阪崎肠杆菌16犛狉犚犖犃基因序列犃.1 阪崎肠杆菌16犛狉犚犖犃基因序列(犪犮犮犲狊狊犻狅狀狀狅.犈犉088379)1attgaacgctggcggcaggcctaacacatgcaagtcgaacggtaacagggagcagcttgc61tgctctgctgacgagtggcggacgggtgagtaatgtctgggaaactgcctgatggagggg121gataactactggaaacggtagctaataccgcataacgtctacggaccaaagtgggggacc181ttcgggcctcatgccatcagatgtgcccagatgggattagctagtaggtggggtaacggc241tcacctaggcgacgatccctagctggtctgagaggatgaccagccacactggaactgaga301cacggtccagactcctacgggaggcagcagtggggaatattgcacaatgggcgcaagcct361gatgcagccatgccgcgtgtatgaagaaggccttcgggttgtaaagtactttcagcgggg421aggaaggtgttgtggttaataaccgcagcaattgacgttacccgcagaagaagcaccggc481taactccgtgccagcagccgcggtaatacggagggtgcaagcgttaatcggaattactgg541gcgtaaagcgcacgcaggcggttgattaagtcagatgtgaaatccccgggctcaacctgg601gaactgcatttgaaactggtcagcttgagtctcgtagaggggggtagaattccaggtgta661gcggtgaaatgcgtagagatctggaggaataccggtggcgaaggcggccccctggacgaa721gactgacgctcaggtgcgaaagcgtggggagcaaacaggattagataccctggtagtcca781cgccgtaaacgatgtcgacttggaggttgtgcccttgaggcgtggcttccggagctaacg841cgtta

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