SNT 2143-2008 进出口食品中隐孢子虫检测方法 PCR法

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书书书中华人民共和国出入境检验检疫行业标准犛犖/犜2143—2008进出口食品中隐孢子虫检测方法犘犆犚法犇犲狋犲狉犿犻狀犪狋犻狅狀狅犳犆狉狔狆狋狅狊狆狅狉犻犱犻狌犿犻狀犳狅狅犱犳狅狉犻犿狆狅狉狋犪狀犱犲狓狆狅狉狋—犘犆犚犿犲狋犺狅犱20080904发布20090316实施中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局发布书书书前  言本标准的附录A为规范性附录。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准起草单位:中华人民共和国上海出入境检验检疫局。本标准主要起草人:李晓虹、闫东丽、韩伟。本标准是首次发布的出入境检验检疫行业标准。Ⅰ犛犖/犜2143—2008进出口食品中隐孢子虫检测方法犘犆犚法1 范围本标准规定了食品中隐孢子虫的PCR检验方法。本标准适用于果汁、牛奶、叶类蔬菜及水果、贝壳类中隐孢子虫的快速检验。2 规范性引用文件下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款。凡是注日期的引用文件,其随后所有的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本标准,然而,鼓励根据本标准达成协议的各方研究是否可使用这些文件的最新版本。凡是不注日期的引用文件,其最新版本适用于本标准。GB/T5750.12 生活饮用水标准检验方法 微生物指标GB/T6682 分析实验室用水规格和实验方法(GB/T6682—2008,ISO3696:1987)SN/T1193 基因检验实验室技术要求3 定义、术语和缩略语下列术语、定义和缩略语适用于本标准。3.1 定义和术语3.1.1隐孢子虫 犮狉狔狆狋狅狊狆狅狉犻犱犻狌犿隐孢子虫为顶端复合体门、孢子虫纲、球虫亚纲、真球虫目、艾美球虫亚目、隐孢子虫科、隐孢子虫属。是直径在(3.2μm~5.1μm)×(8.0μm~8.5μm)的极微小的,无法以肉眼辨识的单细胞寄生虫。隐孢子虫寄生于人或动物的胃肠道上皮和呼吸道上皮微绒毛,其隐孢子虫病是一种重要的人畜共患寄生虫病。感染多经过食源性或水源性传播途径感染。目前公认的隐孢子虫有效种为13个种。其中感染人最主要的是微小隐孢子虫(犆.狆犪狉狏狌犿)。3.2 缩略语3.2.1犐犕犛 犻犿犿狌狀狅犿犪犵狀犲狋犻犮狊犲狆犪狉犪狋犻狅狀免疫磁珠分离。3.2.2犚犉犔犘 犚犲狊狋狉犻犮狋犻狅狀犉狉犪犵犿犲狀狋犔犲狀犵狋犺犘狅犾狔犿狅狉狆犺犻狊犿限制性片段长度多态性分析。4 设备和材料4.1 电子天平:感量为0.001g。4.2 显微镜:×100倍。4.3 离心机:3000r/min。4.4 恒温水浴锅:36℃±1℃,65℃±1℃。4.5 PCR扩增仪。1犛犖/犜2143—20084.6 电泳仪。4.7 磁极和混匀器。4.8 微波炉。4.9 紫外检测仪或凝胶成像系统。4.10 微量可调移液器:10μL,100μL,200μL,1000μL。4.11 FTA卡(Whatman公司或同类产品)。4.12 直径6mm打孔机(Whatman公司或同类产品)。4.13 振荡器。4.14 摇床。4.15 过滤均质袋(400mL)(法国犐狀狋犲狉狊犮犻犲狀犮犲,StNom公司或同类产品)。5 试剂除另有规定外,试剂为分析纯或生化试剂,水为灭菌双蒸水。5.1 抗隐孢子虫磁珠试剂盒(丹麦Dynal公司或同类产品)。5.2 DNA抽提试剂盒。5.3 2×犜犪狇PCRMasterMix[0.1U犜犪狇Polymerase/μL、500μmol/LdNTPeach、20mmol/LTrisHCl(pH8.3)、100mmol/LKCl、3mmol/LMgCl2、其他稳定剂和增强剂]:北京天为时代公司或同类产品。5.4 100bpDNAmarker。5.5 10mmol/LTrisHCl。5.6 0.1mmol/LEDTA(pH8.0)。5.7 琼脂糖。5.8 溴化乙锭。5.9 引物:见表1。表1 隐孢子虫引物序列及扩增片段长度PCR扩增引物名称引物序列(5′3′)扩增片段大小/bpPrimaryPCRExCrylFaExCry2RbTTCTAGAGCTAATACATGCGCCCACTTCTTCGAAGCAGGA1330NestedPCRNesCry3FaNesCry4RbGGAAGGGTTGTATTTATTAGATAAAGCTCATAAGGTGCTGAAGGAGTA830  注:Fa为Forward(正向),Rb为Reverse(反向)。5.10 FTA纯化试剂:Whatman公司或同类产品。5.11 FTA卡洗液TEbuffer:0.01mol/LTrisHCl,pH8.0;0.1mmol/LEDTA,Whatman公司或同类产品。5.12 1%BSA(牛血清白蛋白)。5.13 0.1mol/L盐酸(HCl)。5.14 1mol/L氢氧化钠(NaOH)。5.15 TAE电泳缓冲液(储备液50×):Tris碱242g、冰乙酸57.1mL、0.5mol/LEDTA(pH8.0)100mL,用蒸馏水定容至1000mL,混匀,室温保存。使用时取20mL50×TAE电泳缓冲液,稀释为1000mL工作液即可。5.16 犞狊狆Ⅰ限制性内切酶:Promega公司或同类产品。5.17 犛狊狆Ⅰ限制性内切酶:Fermentas公司或同类产品。5.18 质控标准卵囊:微小隐孢子虫(犆狉狔狆狋狅狊狆狅狉犻犱犻狌犿狆犪狉狏狌犿)PUS8304、贝氏隐孢子虫(犆狉狔狆狋狅狊狆狅2犛犖/犜2143—2008狉犻犱犻狌犿犫犪犻犾犲狔犻)P053、安氏隐孢子虫(犆狉狔狆狋狅狊狆狅狉犻犱犻狌犿犪狀犱犲狉狊狅狀犻)P052、犬隐孢子虫(犆狉狔狆狋狅狊狆狅狉犻犱犻狌犿犮犪狀犻狊)PUS8297或适宜的隐孢子虫卵囊。阴性质控菌株为适宜的非隐孢子虫卵囊。6 检验步骤6.1 方法提要食品经处理后,用IMS方法分离纯化隐孢子虫卵囊,再用FTA卡提取DNA,以提取的DNA为模板进行巢式PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检验PCR产物是否有特征条带,从而对食品中隐孢子虫进行快速检验。如有必要,可鉴定到种。6.2 检验程序隐孢子虫PCR检验程序见图1。图1 隐孢子虫犘犆犚检验程序6.3 检测步骤6.3.1 食品样品处理6.3.1.1 对于饮料类样品直接以无菌操作取样品10mL进行下一步的IMS操作。6.3.1.2 对于叶类或贝壳类样品称取25g放入过滤均质袋中,加入100mL双蒸水,密封后放至摇床上轻轻振荡30min,将滤液倾倒入2个50mL离心管中,2000犵离心20min;去上清液,用双蒸水重悬2个50mL离心管中沉淀物及部分上清液,将重悬物转移至另一50mL离心管,总体积不得超过10mL,然后进行下一步的IMS操作。6.3.2 隐孢子虫卵囊的分离与纯化将处理好的样品10mL,用抗隐孢子虫磁珠试剂盒分离纯化隐孢子虫卵囊,其操作参照说明书,最后得到的卵囊悬液进行下一步的DNA抽提。保存剩余分离纯化好的隐孢子虫卵囊,以备确证试验使用。3犛犖/犜2143—20086.3.3 模板犇犖犃提取将上述分离纯化好的隐孢子虫卵囊约10μL滴加到FTA卡上,按FTA卡操作说明书提取模板DNA。所提取的模板DNA,可常温下储存,也可直接放入PCR管中进行后续反应。6.3.4 巢式犘犆犚扩增(可参照相关试剂盒操作说明)6.3.4.1 初始PCR(PrimaryPCR):反应体系为DNA模板(6.3.3中制得的FTA滤膜片一片),2×犜犪狇PCRMasterMix50μL;1%BSA4μL;10μmol/L引物各2.5μL;双蒸水41μL。反应条件:94℃预变性4min;94℃变性1min,54℃退火45s,72℃延伸1min,35个循环;72℃延伸8min。扩增产物长度为1330bp。6.3.4.2 巢式PCR(NestedPCR):反应体系为DNA模板(第一轮PCR产物)1μL,2×TaqPCRMasterMix50μL;10μmol/L引物各5μL;双蒸水39μL;反应条件:94℃预变性4min;94℃变性1min,58℃退火45s,72℃延伸1min,35个循环;72℃延伸8min。扩增产物长度为830bp。6.3.5 质量控制检测过程中分别设阳性对照、阴性对照和空白对照。阳性对照为5.18中所列的隐孢子虫卵囊或适宜的质控隐孢子虫卵囊,阴性对照为非隐孢子虫卵囊,空白对照加入无菌水作为对照。6.3.6 巢式犘犆犚扩增产物电泳检验用1×TAE电泳缓冲液配制2%琼脂糖电泳凝胶(溴化乙锭终浓度达到1.0μg/mL),制胶。在电泳槽中加入电泳缓冲液,使液面没过胶面。将10μL第二轮NestedPCR扩增产物点样,同时加入100bpDNAMarker。9V/cm恒压,电泳20min~30min。紫外凝胶成像仪下观察电泳结果,拍照并记录结果。6.4 结果及判断6.4.1 犘犆犚扩增产物电泳检验结果隐孢子虫PCR扩增产物为830bp。6.4.2 结果判断阴性对照和空白对照均未出现特征条带;阳性对照出现预期大小的特征条带;待测样品出现预期大小的特征条带,怀疑存在隐孢子虫,需进一步确证;待测样品未出现预期大小的扩增条带,为阴性结果。6.4.3 确证试验将6.4.2中出现特征性条带对应的卵囊,参照GB/T5750.12方法进行镜检鉴定。6.4.4 结果表述PCR扩增产物电泳检验结果阳性,且经确证为阳性,报告检出隐孢子虫。PCR扩增产物电泳检验结果阴性,报告未检出隐孢子虫。6.5 微小隐孢子虫种鉴定6.5.1 犚犉犔犘分析6.4.4中确证为阳性的PCR产物用犞狊狆Ⅰ、犛狊狆Ⅰ限制性内切酶进行酶切。犞狊狆Ⅰ限制性内切酶的反应体系为:ddH2O2.3μL,10×buffer2μL,BSA0.2μL,犞狊狆Ⅰ酶0.5μL,第二轮巢式PCR产物15μL,37℃反应2h。犛狊狆Ⅰ限制性内切酶的反应体系为:ddH2O7μL,10×buffer2μL,犛狊狆Ⅰ酶1μL,第二轮巢式PCR产物10μL,37℃反应2h。6.5.2 犞狊狆Ⅰ、犛狊狆Ⅰ限制性内切酶酶切反应产物电泳检验操作步骤同6.3.6。6.5.3 结果表述经犞狊狆Ⅰ酶酶切产物电泳分别得到102bp、628bp片断结果的,报告检出微小隐孢子虫。4犛犖/犜2143—2008经犛狊狆Ⅰ酶酶切产物电泳分别得到111bp、254bp、449bp片断结果的,报告检出微小隐孢子虫。经犞狊狆Ⅰ酶或犛狊狆Ⅰ酶酶切产物电泳未得到102bp、628bp或111bp、254bp、449bp片断结果的,报告未检出微小隐孢子虫。6.6 废弃物处理和防止污染的措施检验过程中防止交叉污染的措施按照附录A的规定执行。5犛犖/犜2143—2008附 录 犃(规范性附录)检测过程中防止交叉污染的措施犃.1 抽样和制样过程抽样和制样工具,应清洗干净,121℃高压灭菌15min~20min,一套洁净工具限于一份样品使用。存放样品的容器应该经过清洗、高压,或为一次性灭菌容器。犃.2 检测过程犃.2.1 PCR实验室应分为样品制备区、前PCR区、PCR区和后PCR区。将模板提取、PCR反应液配制、PCR循环扩增及PCR产物的鉴定等步骤分区或分室进行。实验室的运作应从“净区”到“脏区”单向进行。犃.2.2 实验过程中,应穿戴实验服和手套,手套要经常更换。各区要有专用实验服,经常清洗。犃.2.3 各区所有的试剂、器材(尤其是移液器)、仪器都应专用,不得带出该区。犃.2.4 所有溶液、水、耗材和器具要121℃,15min高压,避免核酸和(或)核酸酶污染。每种溶液应使用高质量的成分和新蒸馏的双蒸水。在20℃~25℃贮存的试剂中,可加入0.025%的叠氮钠。所有试剂应该以大体积配制,然后分装成仅够一次使用的量进行贮存。犃.2.5 DNA模板或引物的离心管打开之前,要短暂离心,离心管不能用力崩开,以免产生气溶胶。犃.2.6 前PCR区中,最好能在PCR操作箱中加入PCR反应各组分。犃.2.7 实验前后,实验室用紫外线消毒以破坏残留的DNA。犃.2.8 可使用UDG和dUTP系统控制污染。犃.2.9 应遵循PCR操作的其他要求。6犛犖/犜2143—2008

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