搜索
MRIcro使用阐明（人工翻译版）MRIcro系统win95或者随后Linux系统需求x86,或SUN微系统x86（我觉得这不是问题，支持32位就行）硬件支持16或24位色当前版本1.40build1（这阐明书有点老叻）费用免费作者ChrisRorden描述：把医疗图像转化为SPM和谐分析格式。（SPM，即ScanningProbeMicroscopy，扫描探针显微）。可以逐次分析查看分析格式图像。创立分析格式头文献。创立3D兴趣区域（通过计算容量和密度）兴趣区域多层叠加。旋转图像来符合SPM模版图像。输出图像格式涉及BMP，JPEG，PNG，TIF。结合图像：各种图像有关查看。（观测相似坐标PET或MRI扫描）简介MRIcro容许在装有windows和Linux系统电脑上浏览医疗图像。这是一种单机运营程序，这她包裹郑重补充SPM工具。MRIcro可以有效率浏览和输出脑图像。除此之外，它还能使神经生理学家鉴定故意义区域。MRIcro可以创立给其她平台输出脑图像分析格式头文献。对其她Windows程序熟悉使用者将发现这个软件非常简朴好用。把鼠标停在按钮上一段时间将在这个按钮上浮现一种文字暗示。万不得已，咱们还揍了一种简要使用手册来描述基本功能。加载图像和主信息面板MRIcro可以浏览各种各样图像格式，涉及SPM分析格式。分析格式图像涉及两个某些：一种是涉及原始图像资料img格式文献和一种描述图像维度hdr格式文献。MRIcor住信息面板显示了头文献信息和一系列按钮这样你就可以打开浏览头文献。OpenAnalyzeformathdr/imgpair这个按钮是你能有留言Analyze或者NIfTI格式图像。当你按下这个按钮时候，一种是你选取头文献去打开对话会浮现。MRIcro这时候就会试图打开一种邮箱头名字图像文献。图1重要信息面板。Showextendedheaderinformation这个按钮可以打开一种窗口来显示当前打开头文献信息。slice浏览面板slice浏览面板是你可以选取加载映像文献表象。滑动选取要显示片。（你可以在滑动条右边编辑框编辑，或者请按Fn1/Fn2来观测持续上一种或者下一slice，也可以用鼠标滚轮来切换，如果有话~~）。图2slice浏览面板当你浏览轴向面、横断面和冠状面视图时候，你通过独立地调节三个编辑框可以设立X，Y，Z三个坐标。变化图像亮度和控制对比度值按钮在sun这个按钮旁边和反对比图像。这些数值描述了窗口中心和窗口显示宽度。窗口中心（windowcentre）指是显示中档灰度图像强度，同步窗口宽度描述范畴在亮白和完全黑色之间。点击“autocontrast”（显示是以一种黑色箭头指向一种有缺口白圈）设立图像1%为完全黑或完全白。自动平衡工作对MRI扫描来说较好用，但是对CT扫描来说普通不太好用，这时骨头显示比背景和脑组织都要亮。对CT扫描来说，你可以通过在“View”窗口选取一种“ContrastPreset[CT]”来做一种好设立。例如，“Bone”这个预设立把窗口中心设立在400到之间（这样相对合理某些），这普通对CT扫描中发亮骨是有效。图3你可以通过按住鼠标右键把需要调节对比度区域从图像中框出来，来调节这个区域对比度。亮度值（窗口中心）和对比度值（窗口宽度）调节与选区是成比例。注意：如果你选取了任何兴趣区绘图工具，这个就不论用（按下快捷键Fn10来取消）。图4这个柱状图从侧面显示了这个名为“IconT1”图像图像强度。顾客也可以自定义兴趣区域来创立条形图（看ROI某些详细简介）。注意：Mn临界值列出，这个可以用来设立目的图像图像强度比例来匹配一种SPM模版（详细请见指南某些）。Histogram这个按钮（在面板左侧底部）显示立体像素在当前打开图像亮度分布。（见上图）滑动条上面显示六个图标可以让你选取图像呈现方式：轴向，矢状，冠状，和投射（前面三个同步），自由旋转，多层面，三维渲染。如果这个图像跟选取按钮不匹配，图像也就不会保存为轴向格式。在投射视图中，三个编辑栏显示在slice浏览区靠上位置。可以使你独立设立你想要观测X，Y，Z坐标（也可以点击在图像上，来直接跳到鼠标所在坐标）。如果你想同步观测一种以上图像（启动MRIcro不止一次），你可以“yoke”视图，这样同一种视图可以打开多次，成为每个图像（要用这种特性来进行工作，一方面保证“yoke”复选框是打勾）。Yoking将试图通过原图和原始坐标来匹配slice。这样你就可以比较一种图像和模版正常化限度（原意是normalisation），同步可以通过比较PET扫描和分量T1MRI扫描图像来定位PET扫描构造。如果要同步查看一系列横断和冠状slice，按下“multislice”按钮（有一种与一种箭头型slice紧挨着三轴向slice图标）。要运营这个功能，先要加载一种图像。每个slice可以在”options”窗口选取出，如这个手册“othercommands”某些所说。选取自由旋转按钮一起一种名为”FreeRotate”新窗口浮现（见下图）。这个窗口可以是你选取你想看那个斜剖某些。你可以独立选取查看，相片旋角（yaw），滚动，和倾斜度。除此之外，你可以选取你想看那一片。“pivot”设立使你可以设立图像轴向旋转运动。你也可以”nudge”（这是一种键，推动意思）。（把图像放在框架中间）。最后，你可以设立新图像尺寸。习惯视图可以保存为，绘图图像（用”file/saveaspicture“命令），打印图格式，或者按在自由旋转窗口下面”Save”按钮来创立一种8位由你旋转状态描述分析格式图片。注意，自由旋转工具中混合观测居中和物体居中，这两者坐标，也许会使你困惑。（mixviewercentered和objectcentered）。此外，当自由旋转多重区域增益选定”interpolate”复选框，你也许会在这些区域周边看见一种轻微光晕。你可以通过按”3D“这个按钮生成一种3D立体渲染图（显示出一种矢状大脑皮层描述）。这个功能描述细节在这个手册”volumerenderingpage“某些。图5自由旋转视角可以用来定制视图。Mirror按钮（它在原则或者镜像文本中浮现显示字母”LR“，这取决于镜像与否被选取）使你可以翻转图像左或者右。如果你选取镜像，在镜像模式中会浮现一种消息提示你：它不是好编写区域。有一种下拉菜单是选取颜色色彩对照表（LUT）。在默认状态下，MRIcro以黑白状态或者高温金属配色方案显示图片。然而，MRIcro也可以读取Osiris（欧西李斯）格式色彩对照表，它可以让你使用不同配色方案来查看图片。MRIcro支持（shipwith）各种Osiris分布色彩对照表，并且你还可以自己制定习惯色彩LUTs。如果MRIcro在它自己目录内发现任何LUT格式文献，”drop-down”下拉菜单将会列出这些文献名字。从下拉菜单中选取你想要配色方案。有一种下拉菜单使你可以通过不规则尺寸立体像素选取来决定MRIcro如何来显示图片。（例如你可以在X维上用2mm，Y上1mm立体像素来显示图片）。一方面，图像可以在“square”模式下浏览图像，这种状况下所有像素都是正方形，不论图像内部像素是什么维度。第二，亦可以在“stretch”状态下浏览图像，这种状况下使用“邻近估算法”（nearestneighborapproximation）”使立体像素尺寸跟slice内部维度成比例来浏览图像（尽管投射和多slice视图不是成比例）。最后你可以在“smooth”模式下浏览：立体像素尺寸是成比例并且使用“邻近估算法”（这就会创立一种24比特图像，投射视图是对的成比例）。使用变焦因素功能（在slice浏览面板右下方）来设立图像比例，MRIcro容许你使用一倍到六倍比例，这取决与你图像尺寸和原始比例。这时你也许想要调节窗口尺寸了（通过拖曳视窗右下角）。兴趣面板区域MRIcro容许你涂画你感兴趣三维区域（ROIs）。这对注解受到伤害脑区是非常有用。除此之外，ROIs容量是计算过。换而言之，数个不同独立ROIs可以互相叠加（在脑图像上是以相似模版来原则化了），这样可以让神经生理学家来评估共同受损区域了。ROIs可以存储到硬盘里以备将来查验。所有ROIs都涂画在MRI图像上方，而不是直接画在MRI图像上。这意味着既可以用ROIs查看脑图像也可以不用ROIs。MRIcro提供了相称数量工具来生成和浏览ROIs。这些工具显示在“Regionofinterest”一系列按钮上。下面对这些按钮从左到右来一一简介。图6兴趣区域面板涉及了诸多工具来标记病灶和特定区域。如果你选取了一种ROI，体积将显示在左下角，这里是2.6立方厘米。“openroi”按钮（它看起来好像是一种打开后浮现ROI文献夹）可以选取ROI[s]打开。如果你想打开各种ROIs，你可以按下“Ctrl”键选取你要打开各种ROI名字。ROI信息按钮（它以一种“i”图标显示）可以显示图像“interest”区平均密度同步可以生成一种关于图像直方图（这与“slice浏览某些”直方图是同样）。“saveROI”按钮（它是一种这样图标~~一种硬盘上叠加了一种ROI），这样你就能把你做ROI存到硬盘上了。使用“deletROIonthisslice（删除这张slice上ROI）”按钮（好像一种铅笔橡皮）可以只移除当前所浏览slice上ROI。这个按钮在你做ROI时犯了一种描绘轮廓或者填充错误时是有用。点击“deleteentireROI”(这个按钮像一种废纸篓)可以从内存里删掉当前所有ROI[s]。如果在你做一种新ROI之前，你已经打开了各种ROIs，你或许就会用到这个功能（你可以一次画一种ROI）。“DeletentireROI”按钮（是一种废纸篓上有一种ROI叠在上面图标）可以用来关闭一种ROI。接下来，有一种下拉菜单来定义你接下来要画一种ROI颜色（在你同步看各种ROI时候会自动启用一种多色彩设立）。这个选取是红色，绿色，蓝色，白色，或者黑色。这可以使你选取一种明显色彩。在你把图像打印成黑白前你可以把ROI设立成黑白色。在加载各种ROIs之后，你可以在“ROI”菜单选取“ROIdensitycolorbar”这一项画出ROIs相叠加某些。这些颜色指出了互相叠加ROIs数目。最左边颜色（深紫色）显示单个ROI条目（即各个ROI自己不跟其她ROI重叠某些）。最右边颜色（深红色）显示则是重叠最多某些。这个功能如下图所示。图7这张图显示MRI有四个叠加ROIs多张slices。右上角色条值得是ROI强度（深紫色是一种ROI覆盖区域，深红色是四个ROI共同覆盖区域）。这四个图也示范了选取窗口显示右半球功能。-这里持续slices彼此叠加。多slices可以产生横断面slices（上面板）或者冠状面slices（下面板）。选取一种两种画笔中一种来勾描ROI轮廓。这里有俩画笔：“closed”画笔（快捷键Fn6）会自动接近你已经画任何轮廓线。“open”画笔（快捷键Fn7）不会自动接近轮廓线。“fillbutton”（涂料罐子图标，快捷键Fn8）可以用来填充你通过画笔所勾描ROI（两种：右击选取画笔）。在你做一种新ROI之前你需要加载图像，清除掉所有当前ROIs（使用“saveROI”或者“deleteROI”,这个上面说过），然后选取你要看横断面，冠状面，或者矢状面slice（你不能在自由移动状态下画ROI，也不能在投射视图和多视图下画ROI）。在你使用画笔或者填充时候，按住shift键可以在制作区域抹除ROIs。在实践中，可以使closedpen来迅速画出ROIs（快捷键Fn6）然后用Fn1和Fn2键上翻或者下翻slice。使用pen+shift来修剪一种ROI不想要边沿。用左键来购苗ROI轮廓然后移动到ROI中间用右键来填充。画完用“SaveROI”储存。注意：ROI容量列在兴趣区旁边（以立方厘米cc或者立体像素数来衡量，当你切换slice或者存盘时候更新这些信息）。巫师帽子这个图标可以暂时隐藏一种兴